51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5363 on replicon NC_011880
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011880  Cyan7425_5363  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 812 aa  1663    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.395815  normal  0.0592495 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0091  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  47.9 
 
 		 838 aa  772    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5141  hypothetical protein  22.83 
 
 		 685 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3197100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1251  hypothetical protein  22.43 
 
 		 657 aa  55.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  24.62 
 
 		 1444 aa  54.3  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5498  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.17 
 
 		 456 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  decreased coverage  0.000256581 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.86 
 
 		 565 aa  53.5  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3411  DNA-directed DNA polymerase  28.7 
 
 		 215 aa  52.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.537666  normal  0.0817359 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1870  hypothetical protein  20.88 
 
 		 691 aa  51.6  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3451  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.04 
 
 		 453 aa  50.8  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3970  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.75 
 
 		 406 aa  50.8  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.126437  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3616  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.34 
 
 		 530 aa  50.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00210343  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2245  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.87 
 
 		 212 aa  49.7  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09513  probable DNA-directed DNA polymerase III (epsilon subunit)  26.92 
 
 		 457 aa  50.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3922  DNA polymerase III subunit epsilon  30.97 
 
 		 530 aa  50.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000050364  normal  0.710356 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0076  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.15 
 
 		 442 aa  49.3  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5151  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.47 
 
 		 174 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2251  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.07 
 
 		 229 aa  48.5  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.517325  normal  0.396144 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1907  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.01 
 
 		 453 aa  47.8  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5149  AAA ATPase  24.01 
 
 		 1031 aa  47  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120671  normal  0.52051 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  27.45 
 
 		 1433 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  27.45 
 
 		 1433 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  24.71 
 
 		 1435 aa  47.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2024  Rad3-related DNA helicase  26.88 
 
 		 791 aa  47.4  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.323186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  27.18 
 
 		 970 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  27.45 
 
 		 1433 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2656  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.43 
 
 		 456 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.60887 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  27.45 
 
 		 1433 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  27.45 
 
 		 1433 aa  46.6  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  27.45 
 
 		 1433 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  27.45 
 
 		 1433 aa  46.6  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3055  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.5 
 
 		 218 aa  46.6  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000215012  normal  0.403566 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  27.45 
 
 		 1433 aa  46.6  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1818  DNA polymerase III, epsilon subunit  21.9 
 
 		 180 aa  46.6  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.562654 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.72 
 
 		 205 aa  46.6  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  27.45 
 
 		 1433 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1848  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.07 
 
 		 239 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2114  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.07 
 
 		 212 aa  47  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0010  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.84 
 
 		 289 aa  46.2  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.847041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  23.33 
 
 		 952 aa  45.8  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1595  DNA polymerase/helicase  25.17 
 
 		 379 aa  46.2  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700691  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1384  Rad3-related DNA helicase  30.77 
 
 		 797 aa  45.8  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1770  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.07 
 
 		 229 aa  45.8  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5255  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.14 
 
 		 180 aa  45.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000603191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1965  DNA polymerase III, epsilon subunit  22.28 
 
 		 459 aa  45.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249813  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  24.12 
 
 		 1433 aa  45.4  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3956  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.07 
 
 		 502 aa  45.1  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.323553  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  27.72 
 
 		 1442 aa  44.3  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  22.73 
 
 		 1433 aa  44.3  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0878  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.3 
 
 		 375 aa  44.7  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0866  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.3 
 
 		 375 aa  44.3  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000243712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>