More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3516 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
213 aa  436  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  62.19 
 
 
208 aa  259  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  62.69 
 
 
202 aa  257  9e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  62.69 
 
 
202 aa  257  9e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  58.79 
 
 
219 aa  250  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  58.65 
 
 
213 aa  244  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  58.88 
 
 
210 aa  244  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  57.97 
 
 
209 aa  241  3.9999999999999997e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  50.77 
 
 
207 aa  201  9e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  50.77 
 
 
207 aa  199  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  50.77 
 
 
207 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  50.77 
 
 
207 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  50.77 
 
 
210 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  53.19 
 
 
188 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  51.6 
 
 
186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  51.6 
 
 
186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  51.6 
 
 
186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  51.6 
 
 
186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  50.26 
 
 
207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  51.87 
 
 
186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  47.87 
 
 
187 aa  196  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  49.73 
 
 
186 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  50.78 
 
 
206 aa  188  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  47.42 
 
 
191 aa  188  7e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  54.5 
 
 
214 aa  186  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  50.27 
 
 
185 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  44.68 
 
 
191 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  48.66 
 
 
196 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  49.47 
 
 
186 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  52.38 
 
 
217 aa  182  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2079  peptidyl-tRNA hydrolase  47.5 
 
 
206 aa  182  3e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0265  peptidyl-tRNA hydrolase  49.21 
 
 
205 aa  182  5.0000000000000004e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02751  peptidyl-tRNA hydrolase  45.69 
 
 
206 aa  180  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.705281  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  49.18 
 
 
206 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  47.87 
 
 
190 aa  179  2.9999999999999997e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  42.71 
 
 
188 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  44.92 
 
 
184 aa  177  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  42.71 
 
 
188 aa  175  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  49.21 
 
 
206 aa  174  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  47.06 
 
 
183 aa  174  9e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  44.15 
 
 
189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02731  peptidyl-tRNA hydrolase  40.31 
 
 
198 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  44.62 
 
 
180 aa  169  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  48.94 
 
 
194 aa  168  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02721  peptidyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 
200 aa  168  7e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.778009  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1616  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 
202 aa  167  9e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  44.68 
 
 
187 aa  166  2e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  46.03 
 
 
195 aa  166  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03281  peptidyl-tRNA hydrolase  43.01 
 
 
202 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.53 
 
 
193 aa  164  9e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  43.16 
 
 
192 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2631  peptidyl-tRNA hydrolase  49.2 
 
 
196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  44.74 
 
 
189 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02831  peptidyl-tRNA hydrolase  38.29 
 
 
199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.396706  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  43.16 
 
 
192 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  43.16 
 
 
192 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  44.92 
 
 
189 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0252  peptidyl-tRNA hydrolase  42.2 
 
 
200 aa  161  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0954  peptidyl-tRNA hydrolase  41.8 
 
 
188 aa  160  1e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000191784  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  46.03 
 
 
191 aa  160  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  44.39 
 
 
193 aa  159  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  40.31 
 
 
189 aa  157  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  44.67 
 
 
195 aa  157  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  43.46 
 
 
186 aa  157  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf853  peptidyl-tRNA hydrolase  43.85 
 
 
181 aa  157  1e-37  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  42.71 
 
 
192 aa  156  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  42.02 
 
 
189 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  42.11 
 
 
192 aa  156  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1663  peptidyl-tRNA hydrolase  45.86 
 
 
181 aa  156  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  43.46 
 
 
186 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0261  peptidyl-tRNA hydrolase  43.09 
 
 
186 aa  155  4e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0329582  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  41.49 
 
 
189 aa  154  7e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0968  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 
195 aa  154  7e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  43.68 
 
 
192 aa  154  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11032  peptidyl-tRNA hydrolase  45.26 
 
 
191 aa  154  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1364  peptidyl-tRNA hydrolase  40.84 
 
 
179 aa  154  1e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  48.54 
 
 
205 aa  153  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.24 
 
 
199 aa  153  2e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.67 
 
 
193 aa  152  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0170  peptidyl-tRNA hydrolase  42.55 
 
 
193 aa  151  8.999999999999999e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00869457 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  41.49 
 
 
190 aa  150  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  45.74 
 
 
189 aa  150  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  42.55 
 
 
214 aa  150  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1073  peptidyl-tRNA hydrolase  43.68 
 
 
199 aa  150  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  42.02 
 
 
189 aa  150  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  40.72 
 
 
199 aa  149  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  38.83 
 
 
188 aa  150  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  38.3 
 
 
185 aa  150  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0398  peptidyl-tRNA hydrolase  50.88 
 
 
188 aa  149  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3654  peptidyl-tRNA hydrolase  42.41 
 
 
201 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000443892  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  41.26 
 
 
209 aa  148  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0183  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 
193 aa  148  6e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0154785  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  41.49 
 
 
190 aa  147  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4160  peptidyl-tRNA hydrolase  47.06 
 
 
207 aa  147  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.199794 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  41.49 
 
 
190 aa  147  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1203  peptidyl-tRNA hydrolase  44.15 
 
 
190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.156035  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  38.02 
 
 
365 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4538  peptidyl-tRNA hydrolase  41.05 
 
 
228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0234872  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2593  peptidyl-tRNA hydrolase  46.84 
 
 
193 aa  145  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00186006  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0097  peptidyl-tRNA hydrolase  42.49 
 
 
190 aa  146  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000012965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>