More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3153 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  100 
 
 		 196 aa  403  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  35.79 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  36.08 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  36.6 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  38.58 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  38.58 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  38.89 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  34.02 
 
 		 200 aa  125  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  34.02 
 
 		 200 aa  125  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  34.02 
 
 		 200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  37.44 
 
 		 206 aa  124  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  37.36 
 
 		 202 aa  124  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  38.27 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  40.4 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  34.18 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  32.96 
 
 		 253 aa  118  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 445 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  34.08 
 
 		 213 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 211 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 		 228 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  35.68 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 		 213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  33.53 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 		 213 aa  108  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  31.47 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.03 
 
 		 442 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  34.87 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 459 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  35.68 
 
 		 233 aa  108  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.77 
 
 		 378 aa  107  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  31.47 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.96 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  35.79 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  32.99 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  34.69 
 
 		 452 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  31.66 
 
 		 447 aa  106  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  31.15 
 
 		 203 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  31.19 
 
 		 448 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.73 
 
 		 378 aa  106  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 		 200 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 222 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  36.55 
 
 		 442 aa  105  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  35.29 
 
 		 222 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  30.27 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  31.63 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  30.27 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 212 aa  104  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  34.69 
 
 		 209 aa  104  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 212 aa  104  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.12 
 
 		 212 aa  104  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 212 aa  104  8e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  30.6 
 
 		 203 aa  104  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 448 aa  104  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  27.89 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  32.43 
 
 		 256 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.93 
 
 		 427 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  30.98 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  30.81 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.52 
 
 		 442 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  31.52 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 		 212 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.54 
 
 		 449 aa  101  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  32.53 
 
 		 203 aa  101  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  27.32 
 
 		 213 aa  101  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 440 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 		 245 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  33.88 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  31.5 
 
 		 447 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  33.95 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  29.69 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.03 
 
 		 547 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  31.93 
 
 		 203 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  29.38 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  33.88 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 		 220 aa  99.8  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  29.38 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.38 
 
 		 203 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1513  phosphoribosyltransferase, putative/phosphoglycerate mutase family protein  34.76 
 
 		 438 aa  99.4  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000537342 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 		 241 aa  99.4  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  29.38 
 
 		 203 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  29.38 
 
 		 203 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  31.93 
 
 		 203 aa  99  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.03 
 
 		 444 aa  99  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 		 223 aa  99  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  28.87 
 
 		 203 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  29.38 
 
 		 203 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  32.72 
 
 		 207 aa  98.6  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 		 218 aa  98.2  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 215 aa  98.2  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>