More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0548 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  100 
 
 		 259 aa  528  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  51.34 
 
 		 247 aa  239  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  54.88 
 
 		 256 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  54.88 
 
 		 256 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  54.88 
 
 		 256 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  54.88 
 
 		 256 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  47.76 
 
 		 254 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  53.95 
 
 		 256 aa  230  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  53.95 
 
 		 256 aa  230  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  52.61 
 
 		 256 aa  229  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.42 
 
 		 256 aa  229  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  52.61 
 
 		 256 aa  229  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  48.62 
 
 		 257 aa  228  8e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  48.22 
 
 		 256 aa  227  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  46.8 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  43.5 
 
 		 250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  45.6 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2434  ABC transporter related protein  49.09 
 
 		 246 aa  211  7.999999999999999e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150378  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  48.74 
 
 		 257 aa  205  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1634  ABC transporter related protein  45.34 
 
 		 245 aa  203  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0852  ABC transporter related  44.35 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.478961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  36.99 
 
 		 254 aa  198  7e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  42.28 
 
 		 249 aa  195  6e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3479  ABC transporter related protein  43.51 
 
 		 246 aa  195  6e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319887  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2985  ABC transporter, ATP-binding protein  41.05 
 
 		 250 aa  191  9e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0492  ABC transporter-related protein  40.89 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  45.53 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  42.01 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  39.66 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  41.1 
 
 		 255 aa  184  9e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  40.08 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  38.15 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  39.26 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2569  ABC transporter related  38.49 
 
 		 311 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.630319  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3599  ABC transporter related  37.94 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  39.76 
 
 		 250 aa  182  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0517  ABC transporter related  45.54 
 
 		 221 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  45.54 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1192  ABC transporter related  46.63 
 
 		 259 aa  178  9e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000837637  hitchhiker  0.00000450172 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  36.93 
 
 		 245 aa  178  9e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  40.17 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  40.64 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  45.02 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  45.02 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0501  ABC transporter related  44.72 
 
 		 223 aa  171  9e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305427  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1614  ABC transporter related  41.02 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507834  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1648  ABC transporter related  41.02 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.168951  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  37.25 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  43.69 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  38.34 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  39.66 
 
 		 249 aa  169  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  44.55 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  38.4 
 
 		 281 aa  167  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  44.55 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  37.97 
 
 		 258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  37.97 
 
 		 258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  36.99 
 
 		 243 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  41.35 
 
 		 254 aa  165  9e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  37.97 
 
 		 251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  37.92 
 
 		 236 aa  163  3e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  37.82 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  38.03 
 
 		 268 aa  162  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  35.83 
 
 		 251 aa  162  6e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  39.05 
 
 		 249 aa  162  7e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  36.4 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2418  zinc ABC transporter ATP-binding protein  41 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  36.63 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  42.11 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1536  ABC transporter related  37.6 
 
 		 257 aa  158  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.591155 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  38.72 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0623  ABC transporter related  39.83 
 
 		 294 aa  157  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  36.32 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  41.43 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  42.65 
 
 		 222 aa  157  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  38.43 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  35.04 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  36.89 
 
 		 247 aa  156  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0995  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  35.48 
 
 		 246 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  36.44 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  36.44 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  35.9 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  35.77 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3438  ABC transporter related  38.46 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.824241  normal  0.104948 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  40.59 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1936  ABC transporter related  37.67 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681734  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  33.76 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0137  cation ABC transporter, ATP-binding protein  40.81 
 
 		 284 aa  152  7e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  40.42 
 
 		 240 aa  152  7e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  34.57 
 
 		 262 aa  151  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0517  manganese transport system ATP-binding protein MntA  39.27 
 
 		 273 aa  151  8.999999999999999e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  34.89 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0178  cation ABC transporter, ATP-binding protein  41.26 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0155  cation ABC transporter, ATP-binding protein  40.81 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1057  ABC transporter related  36.32 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  38.24 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  36.51 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1729  ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>