More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3219 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  54.39 
 
 
717 aa  796    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  59.89 
 
 
722 aa  817    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  56.47 
 
 
716 aa  808    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.73 
 
 
722 aa  767    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  56.07 
 
 
738 aa  809    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  55.88 
 
 
720 aa  756    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  56.8 
 
 
716 aa  787    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  49.93 
 
 
704 aa  725    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  100 
 
 
712 aa  1427    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  52.15 
 
 
722 aa  773    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  55.86 
 
 
717 aa  741    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  56.81 
 
 
746 aa  734    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  53.35 
 
 
713 aa  786    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  53.41 
 
 
717 aa  772    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  53.17 
 
 
713 aa  742    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  54.48 
 
 
705 aa  644    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  35.83 
 
 
714 aa  416  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  35.86 
 
 
714 aa  414  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  45.19 
 
 
475 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  45.19 
 
 
475 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  45.82 
 
 
473 aa  391  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  43.61 
 
 
510 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  45.41 
 
 
472 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1976  mercuric reductase  44.23 
 
 
515 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121394  normal  0.267836 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  43 
 
 
510 aa  353  5e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  44.59 
 
 
482 aa  349  9e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  41.93 
 
 
507 aa  349  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0341  mercuric reductase  44.54 
 
 
513 aa  348  2e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.262154  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0309  mercuric reductase  42.8 
 
 
525 aa  347  6e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1315  mercuric reductase  41.94 
 
 
505 aa  346  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.47 
 
 
472 aa  343  4e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2431  mercuric reductase  40.7 
 
 
509 aa  339  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2535  mercuric reductase  40.55 
 
 
508 aa  339  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  40.84 
 
 
516 aa  336  1e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1429  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  39.62 
 
 
515 aa  327  4.0000000000000003e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.44 
 
 
484 aa  327  5e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.28 
 
 
471 aa  323  8e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.75 
 
 
480 aa  320  6e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  39.5 
 
 
507 aa  318  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0457  mercuric reductase  39.71 
 
 
507 aa  318  3e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0751  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.63 
 
 
473 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.78 
 
 
482 aa  312  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1481  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.48 
 
 
494 aa  312  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.89 
 
 
482 aa  310  8e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0304  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.14 
 
 
474 aa  308  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1498  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.82 
 
 
488 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000511741  hitchhiker  0.0000458564 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.33 
 
 
475 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1239  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.19 
 
 
495 aa  303  6.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.375161 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16069  predicted protein  36.91 
 
 
532 aa  300  6e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258027  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1463  mercuric reductase, putative  39.45 
 
 
486 aa  298  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0144411  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0335  putative mercuric reductase MerA  41.79 
 
 
470 aa  295  3e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0257756  normal  0.865003 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2549  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.92 
 
 
472 aa  293  6e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0494976  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3132  mercuric reductase  37.47 
 
 
504 aa  290  8e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  41.5 
 
 
557 aa  289  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0898  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.09 
 
 
508 aa  287  4e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00115945 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0072  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.92 
 
 
470 aa  283  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6515  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  40.62 
 
 
520 aa  282  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1057  putative mercuric reductase protein  40.48 
 
 
470 aa  278  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180423  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0645  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  39.91 
 
 
472 aa  276  7e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  36.3 
 
 
546 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2718  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.26 
 
 
470 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.403702  normal  0.0190809 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  34.97 
 
 
546 aa  270  5e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  34.97 
 
 
546 aa  270  5.9999999999999995e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_638  mercuric reductase-like protein  34.38 
 
 
499 aa  267  4e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000028153  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  35.88 
 
 
767 aa  266  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  38.63 
 
 
745 aa  263  6e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  38.9 
 
 
767 aa  263  6.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0732  mercuric reductase, putative  34.73 
 
 
489 aa  259  9e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000844078  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  37.28 
 
 
546 aa  259  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0664  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.07 
 
 
489 aa  257  6e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.04 
 
 
484 aa  256  8e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  35.08 
 
 
550 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.89 
 
 
585 aa  255  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.62 
 
 
456 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.21 
 
 
473 aa  254  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  36.73 
 
 
475 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.82 
 
 
484 aa  253  6e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.62 
 
 
562 aa  253  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.24 
 
 
458 aa  252  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.84 
 
 
468 aa  251  3e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.41 
 
 
458 aa  251  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.68 
 
 
484 aa  251  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0084  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.91 
 
 
473 aa  251  5e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.23 
 
 
481 aa  250  6e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.62 
 
 
470 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.62 
 
 
464 aa  248  3e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.7 
 
 
463 aa  248  4e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4269  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.4 
 
 
462 aa  248  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.170998  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.35 
 
 
468 aa  247  6e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.04 
 
 
464 aa  247  6e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.23 
 
 
465 aa  246  9e-64  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.34 
 
 
467 aa  246  9e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.4 
 
 
468 aa  246  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.34 
 
 
467 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.4 
 
 
468 aa  246  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  32.52 
 
 
460 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.44 
 
 
459 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.34 
 
 
467 aa  244  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1158  mercuric reductase  36.11 
 
 
484 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0843858  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1668  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.58 
 
 
459 aa  243  9e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0297676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>