43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1664 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1664  membrane protein-like protein  100 
 
 		 604 aa  1155    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0012251  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4864  hypothetical protein  30.73 
 
 		 556 aa  122  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4372  hypothetical protein  33.91 
 
 		 678 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323753 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2155  hypothetical protein  32.09 
 
 		 603 aa  117  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230042  normal  0.0266885 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1635  membrane protein-like protein  30.14 
 
 		 542 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0819881 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55820  hypothetical protein  31.21 
 
 		 556 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2697  hypothetical protein  25.49 
 
 		 590 aa  106  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2319  membrane protein  25.7 
 
 		 596 aa  106  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0636  hypothetical protein  29.6 
 
 		 659 aa  103  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4453  hypothetical protein  26.27 
 
 		 589 aa  101  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4832  hypothetical protein  31.8 
 
 		 672 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.608231  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4365  hypothetical protein  28.23 
 
 		 552 aa  94.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.878571  normal  0.937445 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4255  putative transmembrane protein  28.23 
 
 		 552 aa  94.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.179894 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0838  hypothetical protein  29.24 
 
 		 651 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1343  hypothetical protein  27.22 
 
 		 571 aa  88.6  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404143  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3661  hypothetical protein  27.19 
 
 		 575 aa  83.2  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1041  hypothetical protein  29.2 
 
 		 602 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184089  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1771  hypothetical protein  29.2 
 
 		 602 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00140523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0124  hypothetical protein  29.2 
 
 		 602 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000266977  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1796  hypothetical protein  29.2 
 
 		 602 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00710697  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1775  hypothetical protein  28.95 
 
 		 602 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00194073  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1950  hypothetical protein  28.71 
 
 		 602 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000061585  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1283  hypothetical protein  29.22 
 
 		 568 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00406005  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1048  membrane protein  26.63 
 
 		 603 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.795857  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1528  membrane protein  26.63 
 
 		 603 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.721881  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1504  membrane protein  26.94 
 
 		 608 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000532172 
 
 
-
 
NC_003296  RS02587  hypothetical protein  25.64 
 
 		 541 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2535  hypothetical protein  29.61 
 
 		 602 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0608  hypothetical protein  30.3 
 
 		 598 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0969981  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5416  transmembrane protein  26.4 
 
 		 563 aa  70.5  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191412  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2328  membrane protein-like protein  28.03 
 
 		 717 aa  67.8  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.548737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4668  membrane protein  26.24 
 
 		 603 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270258  decreased coverage  0.000905292 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1725  hypothetical protein  25.81 
 
 		 626 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299353  hitchhiker  0.00000909946 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2791  hypothetical protein  27.62 
 
 		 595 aa  56.6  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116145  normal  0.246235 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1698  hypothetical protein  27.91 
 
 		 620 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2401  hypothetical protein  27.64 
 
 		 649 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.612705  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0355  hypothetical protein  27.91 
 
 		 620 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1502  hypothetical protein  27.91 
 
 		 620 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0321  hypothetical protein  27.91 
 
 		 597 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2544  hypothetical protein  27.37 
 
 		 649 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7801  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0849  hypothetical protein  27.64 
 
 		 740 aa  50.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1660  cyclic nucleotide-binding protein  26.03 
 
 		 596 aa  47  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.712845 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  30.06 
 
 		 424 aa  44.3  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>