94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0676 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0676  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  393  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2786  hypothetical protein  53.65 
 
 
195 aa  223  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1607  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  55.9 
 
 
168 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881746  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0996  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  54.87 
 
 
168 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2322  TRAP dicarboxylate family transporter DctQ subunit  54.36 
 
 
168 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31669  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0673  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  48.21 
 
 
168 aa  185  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27655 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4544  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  46.94 
 
 
178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2930  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  40.61 
 
 
178 aa  159  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3878  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  40.82 
 
 
183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1162  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  44.51 
 
 
147 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1242  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  27.13 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000810509  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2871  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.63 
 
 
202 aa  63.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3030  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.75 
 
 
184 aa  62.4  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261237 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3769  hypothetical protein  27.41 
 
 
179 aa  61.6  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0885  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.62 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000127189 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3132  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.21 
 
 
206 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2649  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  24.23 
 
 
184 aa  59.7  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.531292  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2479  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  28.21 
 
 
206 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.447781  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1292  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.94 
 
 
180 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0444  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.8 
 
 
182 aa  58.5  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4220  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.41 
 
 
207 aa  58.2  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0174615 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0099  TRAP dicarboxylate family transporter DctQ subunit  25.89 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0669056  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0453  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  26.77 
 
 
198 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0983838  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1735  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.89 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418155  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1565  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.47 
 
 
207 aa  56.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.124017  normal  0.0201638 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0359  hypothetical protein  25.26 
 
 
182 aa  55.8  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.537959  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1688  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.4 
 
 
199 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0343  hypothetical protein  25.26 
 
 
182 aa  55.8  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.292372  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1711  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.24 
 
 
191 aa  55.1  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0725939  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2246  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.88 
 
 
202 aa  55.1  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.417251  normal  0.0283707 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0672  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  32.39 
 
 
179 aa  54.7  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1202  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  24.06 
 
 
183 aa  53.9  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00964001  normal  0.857795 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0601  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.47 
 
 
197 aa  53.9  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.452096  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1415  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.27 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0190  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.43 
 
 
176 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4951  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  25.27 
 
 
222 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0694  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.9 
 
 
180 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617853  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2923  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.91 
 
 
210 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.640281 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3372  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  23.04 
 
 
179 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.779768 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3756  permease protein  32.26 
 
 
193 aa  51.6  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.969395 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3674  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  22.68 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.396791 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0345  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.69 
 
 
204 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57383  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3390  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.37 
 
 
201 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.126574 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3017  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  35.63 
 
 
190 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2544  TRAP-type transport system, small permease component  23.66 
 
 
168 aa  50.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.809029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2072  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.37 
 
 
198 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0033  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.6 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2752  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.98 
 
 
180 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.328918  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0417  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  22.56 
 
 
185 aa  50.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000370406  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3805  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.26 
 
 
196 aa  50.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.969823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5133  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  27.78 
 
 
184 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140851 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1504  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.12 
 
 
199 aa  49.3  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2190  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  23.86 
 
 
198 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592644  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2150  TRAP transporter, small subunit  28.28 
 
 
179 aa  49.7  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.2063 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2881  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  33.96 
 
 
179 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.901818  hitchhiker  0.000150044 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3868  hypothetical protein  34.88 
 
 
190 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1940  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.62 
 
 
222 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.80655 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1476  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.13 
 
 
179 aa  48.5  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.661481  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2051  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.37 
 
 
197 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3371  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  34.48 
 
 
190 aa  48.5  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123148  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1218  tripartite ATP-independent periplasmic transporter, DctQ component  24.51 
 
 
179 aa  48.5  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0122  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.23 
 
 
198 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591808  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3364  hypothetical protein  23.78 
 
 
206 aa  47.4  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.306175  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2033  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  26.2 
 
 
732 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105106  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1574  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  24.5 
 
 
198 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.803003  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2891  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.05 
 
 
222 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0961  tripartite ATP-independent periplasmic transporter, DctQ component  27.07 
 
 
168 aa  46.2  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.093725  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3621  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25 
 
 
173 aa  45.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.767464  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3478  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.79 
 
 
181 aa  45.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0364  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.06 
 
 
198 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.166619 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3061  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  38.1 
 
 
186 aa  45.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.287187  hitchhiker  0.000081525 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4052  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  21.31 
 
 
206 aa  45.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654471  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3083  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  26.79 
 
 
224 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502464  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1622  tripartite ATP-independent periplasmic transporter, DctQ component  24.35 
 
 
184 aa  45.1  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1814  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.27 
 
 
185 aa  44.7  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3654  TRAP transporter DctQ family protein  27.84 
 
 
170 aa  44.7  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.724435 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1506  triosephosphate isomerase (TIM; Triose-phosphateisomerase)  28.57 
 
 
169 aa  44.7  0.0009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0697  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  38.18 
 
 
187 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.940748  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3000  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  29.09 
 
 
197 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0959  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  22.84 
 
 
208 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3119  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  29.09 
 
 
197 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000112797  normal  0.654316 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4424  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.68 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0654  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.4 
 
 
183 aa  42.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.197985  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2934  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.43 
 
 
187 aa  42.4  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.65832 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1612  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.27 
 
 
180 aa  42  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3640  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.6 
 
 
165 aa  42  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.6832  normal  0.687836 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4765  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  32.11 
 
 
212 aa  42  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010311 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1041  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  22.34 
 
 
208 aa  41.6  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0743648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6903  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  30.77 
 
 
625 aa  41.6  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4299  trap dicarboxylate transporter, dctq subunit  25.45 
 
 
171 aa  41.6  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4270  trap dicarboxylate transporter dctq subunit  25.45 
 
 
171 aa  41.6  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.299964  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4383  trap dicarboxylate transporter subunit DctQ  25.45 
 
 
171 aa  41.6  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.725084  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4339  trap dicarboxylate transporter subunit DctQ  25.45 
 
 
171 aa  41.6  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3474  putative TRAP C4-dicarboxylate transport system, DctQ subunit (small permease component)  26.67 
 
 
179 aa  41.6  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>