279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0722 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 		 198 aa  404  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.26 
 
 		 183 aa  196  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 		 198 aa  191  7e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  47.09 
 
 		 191 aa  189  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.25 
 
 		 200 aa  188  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  44.86 
 
 		 183 aa  165  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  42.08 
 
 		 187 aa  162  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  40.98 
 
 		 184 aa  156  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1676  NifU domain-containing protein  43.72 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  41.62 
 
 		 186 aa  150  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  40.44 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  43.55 
 
 		 190 aa  148  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  43.55 
 
 		 190 aa  148  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  39.89 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  42.47 
 
 		 190 aa  147  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  40.64 
 
 		 201 aa  147  9e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  42.02 
 
 		 192 aa  147  9e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  39.78 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  39.78 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  40.76 
 
 		 189 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  39.89 
 
 		 187 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  41.62 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3394  Scaffold protein Nfu/NifU  39.47 
 
 		 188 aa  143  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1955  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.7 
 
 		 299 aa  143  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  40 
 
 		 189 aa  142  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  39.13 
 
 		 188 aa  141  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  42.78 
 
 		 187 aa  141  8e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  39.57 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  39.47 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3522  Scaffold protein Nfu/NifU  38.95 
 
 		 188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.128195  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3198  scaffold protein Nfu/NifU  38.95 
 
 		 188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113842  normal  0.941743 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  40.32 
 
 		 186 aa  138  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01075  NifU-like domain protein  41.29 
 
 		 305 aa  138  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2380  scaffold protein Nfu/NifU-like protein  39.9 
 
 		 192 aa  137  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  40 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  41.4 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  38.5 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3394  scaffold protein Nfu/NifU  38.17 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.252706 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  36.19 
 
 		 326 aa  134  6.0000000000000005e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  38.22 
 
 		 188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  39.34 
 
 		 186 aa  134  7.000000000000001e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  38.58 
 
 		 242 aa  134  7.000000000000001e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0202  NifU domain-containing protein  39.33 
 
 		 186 aa  134  9.999999999999999e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4429  Scaffold protein Nfu/NifU  36.84 
 
 		 187 aa  132  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.021918  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  36.36 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0009  nitrogen-fixing NifU  36.87 
 
 		 190 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964123  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  40.64 
 
 		 185 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  37.02 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  37.29 
 
 		 188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  41.18 
 
 		 254 aa  125  5e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  38.5 
 
 		 180 aa  124  7e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  36.46 
 
 		 195 aa  124  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0016  nitrogen-fixing NifU-like  36.67 
 
 		 191 aa  123  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00443934  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  35.23 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0644  scaffold protein Nfu/NifU  36.27 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.728561 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0019  scaffold protein Nfu/NifU  35.29 
 
 		 189 aa  118  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.01661  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1051  scaffold protein Nfu/NifU  37.7 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.906453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  36.22 
 
 		 195 aa  111  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01900  iron ion homeostasis-related protein, putative  36.14 
 
 		 309 aa  103  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2988  nitrogen-fixing NifU domain protein  26.49 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0701  nitrogen-fixing NifU-like  26.37 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1865  nitrogen-fixing NifU-like  25 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.54 
 
 		 72 aa  70.5  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.3 
 
 		 79 aa  69.7  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.3 
 
 		 81 aa  68.2  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  46.48 
 
 		 73 aa  67.4  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.53 
 
 		 73 aa  65.9  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  47.54 
 
 		 75 aa  63.9  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2324  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.55 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.575512  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2284  NifU domain-containing protein  44.93 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000278833  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  44.12 
 
 		 72 aa  63.2  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_002936  DET1632  NifU-like protein  53.23 
 
 		 72 aa  62.8  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000186996  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  40.7 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  43.24 
 
 		 80 aa  62  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  43.24 
 
 		 80 aa  62  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  41.46 
 
 		 81 aa  62  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  40.85 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  41.46 
 
 		 81 aa  62  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  41.46 
 
 		 81 aa  62  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.29 
 
 		 87 aa  62  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  45.76 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.93 
 
 		 73 aa  60.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  47.46 
 
 		 81 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  47.46 
 
 		 81 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.83 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  45.9 
 
 		 81 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  44.26 
 
 		 81 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.38 
 
 		 73 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  43.75 
 
 		 80 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  40.35 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  48.39 
 
 		 74 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  44.26 
 
 		 81 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.83 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.93 
 
 		 73 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  44.78 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  44.83 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0260  NifU domain-containing protein  43.48 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1514  NifU domain protein  53.03 
 
 		 72 aa  58.9  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000120627  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.55 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.98 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>