More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2179 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  100 
 
 		 373 aa  769    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2865  cysteine desulfurase  53.42 
 
 		 373 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0379  cysteine desulfurase  53.15 
 
 		 373 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1225  cysteine desulfurase  53.42 
 
 		 414 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0422  cysteine desulfurase  53.15 
 
 		 373 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1568  cysteine desulfurase  53.15 
 
 		 373 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1755  cysteine desulfurase  53.15 
 
 		 373 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.983783  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  52.39 
 
 		 380 aa  408  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2808  aminotransferase, class V  52.6 
 
 		 379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  50.41 
 
 		 385 aa  389  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21090  cysteine desulfurase family protein  52.99 
 
 		 392 aa  359  5e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.14044 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  49.73 
 
 		 404 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  48.68 
 
 		 379 aa  351  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  50.27 
 
 		 384 aa  350  2e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  50.95 
 
 		 384 aa  350  3e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  47.3 
 
 		 382 aa  348  1e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  47.33 
 
 		 394 aa  347  2e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0997  cysteine desulfurase  47.25 
 
 		 415 aa  345  7e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  48.91 
 
 		 396 aa  345  7e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  48.4 
 
 		 398 aa  345  8.999999999999999e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  46.28 
 
 		 382 aa  344  1e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  47.43 
 
 		 398 aa  343  2e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  47.43 
 
 		 398 aa  343  2e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  47.06 
 
 		 392 aa  343  2.9999999999999997e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  45.64 
 
 		 417 aa  341  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  44.97 
 
 		 406 aa  339  5.9999999999999996e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.78 
 
 		 388 aa  338  9e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  48.09 
 
 		 399 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  45.04 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  46.09 
 
 		 394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  45.72 
 
 		 404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  45.72 
 
 		 404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  45.72 
 
 		 404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  45.72 
 
 		 404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  46.01 
 
 		 403 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  45.72 
 
 		 404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  45.72 
 
 		 404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  45.72 
 
 		 404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  45.72 
 
 		 404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  45.72 
 
 		 404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  45.43 
 
 		 398 aa  336  5e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  45.69 
 
 		 394 aa  336  5e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  45.23 
 
 		 394 aa  334  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  46.21 
 
 		 392 aa  334  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4051  Cysteine desulfurase  46.51 
 
 		 380 aa  333  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0863916  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  44.65 
 
 		 404 aa  333  4e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  43.62 
 
 		 403 aa  333  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  43.62 
 
 		 436 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  44.65 
 
 		 404 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  43.62 
 
 		 436 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  44.65 
 
 		 404 aa  332  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  44.65 
 
 		 404 aa  332  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  44.65 
 
 		 404 aa  332  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  44.65 
 
 		 404 aa  332  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  45.65 
 
 		 382 aa  332  6e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  45.05 
 
 		 422 aa  332  7.000000000000001e-90  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  44.86 
 
 		 404 aa  331  1e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  45.05 
 
 		 410 aa  331  1e-89  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  44.77 
 
 		 404 aa  331  1e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  44.57 
 
 		 405 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01356  cysteine desulfurase  45.48 
 
 		 388 aa  330  3e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.350506  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  43.35 
 
 		 403 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  44.39 
 
 		 404 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  46.9 
 
 		 396 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  44.77 
 
 		 404 aa  329  5.0000000000000004e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  44.39 
 
 		 404 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  43.85 
 
 		 404 aa  329  6e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  45.07 
 
 		 400 aa  328  7e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  44.29 
 
 		 407 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  44.86 
 
 		 389 aa  327  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  45.41 
 
 		 404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  44.41 
 
 		 407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  44.92 
 
 		 404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  43.94 
 
 		 407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  45.31 
 
 		 404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  46.03 
 
 		 400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  44.41 
 
 		 407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  45.82 
 
 		 384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  43.94 
 
 		 407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  43.67 
 
 		 407 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  43.67 
 
 		 407 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  44.14 
 
 		 407 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  44.14 
 
 		 407 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  44.14 
 
 		 407 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1493  cysteine desulfurase IscS  44.57 
 
 		 419 aa  325  7e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  45.9 
 
 		 404 aa  325  7e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  43.94 
 
 		 407 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  43.94 
 
 		 407 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  43.9 
 
 		 388 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  43.55 
 
 		 388 aa  324  1e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  43.94 
 
 		 407 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  43.94 
 
 		 407 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  44.05 
 
 		 404 aa  324  1e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  43.87 
 
 		 407 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  46.85 
 
 		 407 aa  324  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  44.84 
 
 		 403 aa  324  2e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  46.35 
 
 		 398 aa  323  3e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  43.87 
 
 		 407 aa  323  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  43.9 
 
 		 388 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  43.48 
 
 		 405 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>