30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0343 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3493  FG-GAP repeat protein  54.47 
 
 		 767 aa  796    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.832541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25650  FG-GAP repeat protein  54.19 
 
 		 1082 aa  822    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112985  normal  0.313827 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0488  FG-GAP repeat protein  54.83 
 
 		 851 aa  861    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0343  FG-GAP repeat-containing protein  100 
 
 		 803 aa  1669    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  44.72 
 
 		 833 aa  329  1.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  42.75 
 
 		 1065 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  42.93 
 
 		 1880 aa  302  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  42.39 
 
 		 820 aa  299  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0739  cellulosome protein dockerin type I  40.66 
 
 		 676 aa  288  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000588173  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1678  FG-GAP repeat-containing protein  41.69 
 
 		 618 aa  286  2.0000000000000002e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000385209  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3891  FG-GAP repeat protein  41.4 
 
 		 662 aa  284  6.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0201045  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3413  FG-GAP repeat protein  39.66 
 
 		 672 aa  277  5e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  39.85 
 
 		 773 aa  276  9e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  40.05 
 
 		 743 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3890  FG-GAP repeat protein  39.07 
 
 		 613 aa  268  4e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.100975  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3679  FG-GAP repeat-containing protein  37.96 
 
 		 677 aa  266  8e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000668501  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  40 
 
 		 746 aa  265  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0215  hypothetical protein  38.31 
 
 		 787 aa  263  8.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.247973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  37.32 
 
 		 914 aa  261  5.0000000000000005e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  36.59 
 
 		 1266 aa  258  3e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  38.33 
 
 		 744 aa  255  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1343  YesW  38.15 
 
 		 658 aa  244  3.9999999999999997e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  38.35 
 
 		 774 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4222  FG-GAP repeat-containing protein  36.71 
 
 		 616 aa  237  6e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  42.6 
 
 		 669 aa  187  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2008  putative secreted glycosyl hydrolase  38.02 
 
 		 240 aa  160  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  29.67 
 
 		 848 aa  154  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02543  rhamnogalacturonan lyase (Eurofung)  27.03 
 
 		 606 aa  90.9  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2353  hypothetical protein  24.79 
 
 		 667 aa  48.1  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  37.5 
 
 		 2528 aa  45.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>