More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0778 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
290 aa  600  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0675  alpha/beta hydrolase fold  75.17 
 
 
290 aa  476  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0467323 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  65.16 
 
 
290 aa  412  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0829  alpha/beta hydrolase fold  65.51 
 
 
290 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1299  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  64.08 
 
 
288 aa  402  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1941  alpha/beta hydrolase fold  65.84 
 
 
291 aa  401  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0494053  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0537  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  64.46 
 
 
292 aa  397  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.169084  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0950  alpha/beta hydrolase fold protein  31.69 
 
 
296 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0923  alpha/beta hydrolase fold protein  31.34 
 
 
296 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  32.84 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 
298 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 
301 aa  125  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3102  Alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 
312 aa  125  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.6937 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0155  hypothetical protein  31.85 
 
 
306 aa  121  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0704545  normal  0.0817623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4195  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0185  hypothetical protein  31.56 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 
421 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2256  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 
297 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2307  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 
297 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.960741 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1691  hypothetical protein  26.87 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.517276  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2532  hypothetical protein  28.47 
 
 
299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.236123  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4421  alpha/beta hydrolase fold protein  29.47 
 
 
299 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2433  hypothetical protein  27.15 
 
 
306 aa  108  8.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4828  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  28.04 
 
 
301 aa  108  9.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17861  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  28.2 
 
 
301 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  27.3 
 
 
305 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0062  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 
301 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0068  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  31.54 
 
 
297 aa  106  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 
312 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  26.69 
 
 
331 aa  105  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1174  alpha/beta fold family hydrolase  27.38 
 
 
303 aa  105  9e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0801  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 
305 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0013  Alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 
300 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798898  normal  0.992459 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20491  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  27.38 
 
 
303 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  24.66 
 
 
304 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18081  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  26.87 
 
 
299 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17911  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  26.87 
 
 
299 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.782041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2944  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 
300 aa  102  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.765765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 
314 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2037  Alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 
302 aa  98.2  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1701  alpha/beta hydrolase fold protein  29.35 
 
 
303 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1028  hypothetical protein  28.52 
 
 
318 aa  97.1  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  41.27 
 
 
295 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13371  predicted protein  29.97 
 
 
323 aa  96.3  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014385  normal  0.0363767 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1726  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 
303 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 
350 aa  94.7  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 
290 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0626  Alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
308 aa  90.1  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 
291 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 
291 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 
291 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  36.14 
 
 
291 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25921  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  27.18 
 
 
319 aa  89.4  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 
254 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  27.52 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3781  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.668878  normal  0.527561 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 
316 aa  87.8  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  28.08 
 
 
298 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0442  alpha/beta hydrolase fold protein  26.86 
 
 
334 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.471208 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 
309 aa  87.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0495  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
327 aa  87  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 
280 aa  87  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  25.54 
 
 
287 aa  87  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 
253 aa  86.7  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  27.69 
 
 
333 aa  86.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
246 aa  86.3  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17211  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  26.73 
 
 
314 aa  86.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.951969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
350 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 
287 aa  85.9  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0234  hypothetical protein  25.57 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1721  alpha/beta fold family hydrolase  24.84 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0960045  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0931  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.18 
 
 
370 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  26.47 
 
 
298 aa  84  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  37.25 
 
 
322 aa  83.6  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  26.13 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15323  predicted protein  28.15 
 
 
272 aa  84  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155902  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.74 
 
 
370 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
314 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37370  predicted protein  24.04 
 
 
314 aa  83.6  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.273183  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17551  alpha/beta fold family hydrolase  25.4 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.412462  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18381  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
304 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18201  alpha/beta fold family hydrolase  26.16 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.392562  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.37 
 
 
372 aa  83.2  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 
340 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  40.35 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  31.88 
 
 
341 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  24.89 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  40.35 
 
 
290 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.74 
 
 
368 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  33.1 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1252  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  25.81 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.261139  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.37 
 
 
368 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13201  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  27.11 
 
 
314 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>