298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2458 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  100 
 
 
117 aa  235  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  84.35 
 
 
118 aa  204  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  83.9 
 
 
118 aa  197  5e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  76.92 
 
 
117 aa  194  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  80.51 
 
 
118 aa  194  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  82.2 
 
 
118 aa  194  5.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  72.03 
 
 
118 aa  183  8e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 
102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  41.9 
 
 
137 aa  94.7  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  46.94 
 
 
106 aa  94  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  55.84 
 
 
109 aa  92.8  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  46.67 
 
 
106 aa  90.9  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  44.68 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  50.63 
 
 
125 aa  88.2  3e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  39.09 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  38.54 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 
106 aa  85.9  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 
112 aa  84  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  39.6 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  42.71 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  42.5 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2443  protein translocase subunit yajC  44.32 
 
 
101 aa  81.6  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0348045  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 
106 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  39.24 
 
 
91 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  46.34 
 
 
111 aa  80.9  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  41.67 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  37.65 
 
 
111 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 
107 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  44.71 
 
 
107 aa  78.2  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 
111 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  38.53 
 
 
168 aa  77.4  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  37.36 
 
 
108 aa  77  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  44.44 
 
 
108 aa  76.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  41.77 
 
 
110 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  43.9 
 
 
93 aa  76.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  41.77 
 
 
109 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1348  preprotein translocase, YajC subunit  36.17 
 
 
123 aa  75.1  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  44.58 
 
 
91 aa  74.7  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0680  preprotein translocase, YajC subunit  37.37 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0730138  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  38.95 
 
 
95 aa  73.9  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  39.39 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  41.25 
 
 
94 aa  73.9  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  38.04 
 
 
119 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  40.74 
 
 
91 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4501  preprotein translocase subunit YajC  42.05 
 
 
86 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4550  preprotein translocase subunit YajC  42.05 
 
 
86 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000437166  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  42.35 
 
 
86 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  43.68 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  37.65 
 
 
115 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4311  preprotein translocase subunit YajC  41.18 
 
 
86 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000102118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4149  preprotein translocase subunit YajC  41.18 
 
 
86 aa  72  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000425836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4646  preprotein translocase subunit YajC  41.18 
 
 
86 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00688005  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1358  preprotein translocase, YajC subunit  37.93 
 
 
90 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00135815  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  37.65 
 
 
110 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4496  preprotein translocase subunit YajC  41.18 
 
 
86 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000482906 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0416  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 
150 aa  72  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  33.67 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  42.53 
 
 
109 aa  72  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  36.26 
 
 
114 aa  72  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  35.64 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  38.46 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4160  preprotein translocase subunit YajC  40.91 
 
 
86 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152675  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  36.59 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  36.59 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  35.71 
 
 
91 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  37.8 
 
 
108 aa  71.2  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  39.77 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0530  protein translocase subunit yajC  34.41 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  41.67 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2203  preprotein translocase, YajC subunit  43.59 
 
 
91 aa  71.2  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.935333  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4748  preprotein translocase, YajC subunit  35.37 
 
 
110 aa  70.5  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0608539 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4535  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
86 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000852882  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  39.02 
 
 
108 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  39.02 
 
 
108 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  31.87 
 
 
110 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0700  preprotein translocase subunit YajC  38.82 
 
 
86 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000310911  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  31.87 
 
 
110 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  39.74 
 
 
109 aa  70.1  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4263  preprotein translocase subunit YajC  38.82 
 
 
86 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  39.24 
 
 
92 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  37.23 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  36.63 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6327  preprotein translocase, YajC subunit  43.88 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0523  preprotein translocase, YajC subunit  35.37 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0420  hypothetical protein  48.48 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  38.82 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  37.97 
 
 
93 aa  68.6  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  43.02 
 
 
114 aa  69.3  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3621  preprotein translocase, YajC subunit  37.35 
 
 
118 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000152664  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  37.23 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  38.04 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  42.17 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  32.63 
 
 
111 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  37.23 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  37.23 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  37.23 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  37.23 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  37.23 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  41.38 
 
 
93 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>