169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1578 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1578  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  646  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  7.06252e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2454  protein of unknown function DUF1568  81.93 
 
 
321 aa  530  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  2.57297e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  68.34 
 
 
321 aa  437  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  68.34 
 
 
321 aa  432  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  68.97 
 
 
321 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  63.64 
 
 
321 aa  409  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  62.81 
 
 
321 aa  401  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  63.12 
 
 
321 aa  399  1e-110  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  63.12 
 
 
321 aa  399  1e-110  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  62.81 
 
 
321 aa  396  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  62.81 
 
 
321 aa  395  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  62.07 
 
 
327 aa  391  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  60.19 
 
 
321 aa  380  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  58.93 
 
 
319 aa  375  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  54.04 
 
 
324 aa  341  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  53.09 
 
 
325 aa  330  1e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  53.58 
 
 
324 aa  331  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  53.12 
 
 
506 aa  325  5e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  52.04 
 
 
327 aa  321  1e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  51.54 
 
 
321 aa  319  3e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  52.19 
 
 
325 aa  318  6e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  49.38 
 
 
325 aa  317  2e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  51.56 
 
 
323 aa  313  2e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  49.53 
 
 
336 aa  311  9e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  53.29 
 
 
295 aa  295  7e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  46.56 
 
 
320 aa  293  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  47.52 
 
 
333 aa  288  9e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0255  hypothetical protein  48.57 
 
 
288 aa  256  4e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0724188  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  74.83 
 
 
160 aa  240  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  39.81 
 
 
335 aa  225  8e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  38.84 
 
 
340 aa  215  1e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  37.61 
 
 
338 aa  213  3e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  37.69 
 
 
335 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.61863e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  38.39 
 
 
334 aa  201  2e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  38.36 
 
 
326 aa  175  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  34.98 
 
 
323 aa  172  7e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  37.06 
 
 
323 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2224  hypothetical protein  72.38 
 
 
112 aa  159  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00479916  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  47.06 
 
 
180 aa  156  5e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.79858e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  29.17 
 
 
316 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  30.82 
 
 
313 aa  136  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  31.42 
 
 
318 aa  132  1e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  32.35 
 
 
321 aa  131  2e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  1.90963e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  34.06 
 
 
316 aa  125  8e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  30.28 
 
 
319 aa  125  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  31.09 
 
 
315 aa  122  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0741  protein of unknown function DUF1568  66.67 
 
 
97 aa  122  1e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117883  normal  0.0672697 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  34.64 
 
 
251 aa  121  2e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  32.02 
 
 
314 aa  120  2e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2247  hypothetical protein  63.74 
 
 
101 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  27.56 
 
 
316 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2207  hypothetical protein  73.08 
 
 
81 aa  118  1e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  31.02 
 
 
282 aa  115  1e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  27.76 
 
 
312 aa  115  1e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0167  hypothetical protein  55.45 
 
 
101 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  30.61 
 
 
305 aa  113  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  33.51 
 
 
312 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  34.34 
 
 
252 aa  110  4e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0922  protein of unknown function DUF1568  38.73 
 
 
176 aa  105  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  39.31 
 
 
250 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  28.09 
 
 
277 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  1.03135e-09 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  29.96 
 
 
326 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  40 
 
 
239 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  26.54 
 
 
321 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2216  hypothetical protein  67.61 
 
 
72 aa  99.8  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.136455  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  25.4 
 
 
288 aa  98.6  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  25.39 
 
 
288 aa  98.6  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  31.89 
 
 
289 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  31.35 
 
 
289 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.73385e-07 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  28.11 
 
 
253 aa  97.8  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  25.1 
 
 
258 aa  97.4  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  25.57 
 
 
287 aa  96.7  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2050  protein of unknown function DUF1568  31.82 
 
 
336 aa  96.3  6e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.633564  normal  0.705399 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  28.63 
 
 
322 aa  95.9  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  27.57 
 
 
253 aa  95.5  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  33.74 
 
 
236 aa  95.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  29.23 
 
 
241 aa  95.5  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  33.74 
 
 
236 aa  95.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  24.76 
 
 
288 aa  94.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  29.23 
 
 
323 aa  93.6  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  35.61 
 
 
241 aa  92.4  8e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  35.86 
 
 
231 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  35.86 
 
 
234 aa  90.9  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  34.48 
 
 
235 aa  90.1  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  28.57 
 
 
287 aa  89  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  34.48 
 
 
232 aa  89  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  30.17 
 
 
245 aa  88.2  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  28.57 
 
 
181 aa  86.3  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  30.16 
 
 
236 aa  85.9  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  33.33 
 
 
165 aa  85.5  1e-15  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  35.17 
 
 
234 aa  84.7  2e-15  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3078  protein of unknown function DUF1568  28.34 
 
 
190 aa  84  3e-15  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3105  protein of unknown function DUF1568  28.34 
 
 
192 aa  84  3e-15  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  6.25853e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  34.48 
 
 
232 aa  83.6  4e-15  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  31.03 
 
 
231 aa  82.8  8e-15  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  30.86 
 
 
310 aa  82  1e-14  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  33.1 
 
 
232 aa  81.6  2e-14  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  31.39 
 
 
304 aa  81.3  2e-14  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  1.64254e-05  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  35.16 
 
 
234 aa  80.9  3e-14  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  1.50021e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  32.87 
 
 
248 aa  80.9  3e-14  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>