More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1668 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1668  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 175 aa  350  7e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.197637  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3480  50S ribosomal protein L9  66.89 
 
 		 146 aa  197  5e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.34024  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  58.11 
 
 		 149 aa  180  8.000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  50 
 
 		 179 aa  165  4e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0741  ribosomal protein L9  53.38 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0681469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2593  50S ribosomal protein L9  47.3 
 
 		 147 aa  134  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1112  ribosomal protein L9  46.26 
 
 		 147 aa  133  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573323  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2007  ribosomal protein L9  44.22 
 
 		 148 aa  125  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  45.64 
 
 		 149 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  41.06 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 148 aa  112  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 151 aa  111  6e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6995  ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 148 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 151 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 148 aa  103  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 147 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  39.42 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  38.56 
 
 		 153 aa  102  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 149 aa  102  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 151 aa  102  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  38.69 
 
 		 147 aa  102  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  38.69 
 
 		 147 aa  102  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1642  50S ribosomal protein L9  37.65 
 
 		 164 aa  102  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0557513  normal  0.0367892 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 151 aa  101  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 148 aa  100  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  39.86 
 
 		 148 aa  99.8  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 149 aa  99.8  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  38.16 
 
 		 171 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 147 aa  99.8  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  36 
 
 		 151 aa  99.4  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  36.36 
 
 		 170 aa  99  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 148 aa  98.2  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 148 aa  98.2  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  38.3 
 
 		 148 aa  97.1  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  36.5 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 167 aa  97.1  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  38.67 
 
 		 152 aa  96.3  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  36.31 
 
 		 167 aa  95.5  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 148 aa  95.1  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 151 aa  94.4  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  39.47 
 
 		 148 aa  94.4  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 		 168 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  41.18 
 
 		 150 aa  94  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  35.37 
 
 		 150 aa  93.6  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  35.77 
 
 		 160 aa  94  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  31.76 
 
 		 148 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  35.14 
 
 		 149 aa  93.2  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  35.82 
 
 		 168 aa  92.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0222  ribosomal protein L9  42.67 
 
 		 151 aa  91.7  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1329  50S ribosomal protein L9P  34.46 
 
 		 148 aa  91.7  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.556068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  37.96 
 
 		 147 aa  91.3  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  36.5 
 
 		 151 aa  90.9  9e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  38.69 
 
 		 149 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  39.42 
 
 		 149 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  31.51 
 
 		 148 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2196  50S ribosomal protein L9  35.33 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0214296  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  31.88 
 
 		 149 aa  90.5  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  36.24 
 
 		 148 aa  90.5  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  35.37 
 
 		 149 aa  90.5  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  38.69 
 
 		 149 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0120  50S ribosomal protein L9  36.76 
 
 		 149 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0927016  normal  0.199932 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1219  50S ribosomal protein L9P  35.81 
 
 		 148 aa  89.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 151 aa  89.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  34.69 
 
 		 150 aa  90.1  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  35.14 
 
 		 148 aa  89.7  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  37.75 
 
 		 149 aa  89  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  36.67 
 
 		 153 aa  89  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  37.09 
 
 		 150 aa  89.4  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  32.76 
 
 		 168 aa  88.6  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  33.11 
 
 		 149 aa  88.6  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  36.96 
 
 		 148 aa  88.2  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6031  50S ribosomal protein L9  37.01 
 
 		 151 aa  88.2  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.827335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 146 aa  87.8  6e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  35.82 
 
 		 165 aa  88.2  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  36.24 
 
 		 150 aa  88.2  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  37.09 
 
 		 149 aa  87.8  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  33.56 
 
 		 148 aa  87.8  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  37.66 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  0.000000062237 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  37.66 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  33.77 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  37.66 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  36.05 
 
 		 149 aa  87  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1339  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.361215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  33.33 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1948  ribosomal protein L9  37.09 
 
 		 151 aa  86.7  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  34.23 
 
 		 150 aa  86.3  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1030  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  34.9 
 
 		 149 aa  86.3  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  34.01 
 
 		 148 aa  85.9  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5226  ribosomal protein L9  36.91 
 
 		 150 aa  85.9  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  36.24 
 
 		 150 aa  85.5  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  35.76 
 
 		 151 aa  85.5  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  36.36 
 
 		 148 aa  85.1  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  34.44 
 
 		 146 aa  85.1  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  34.44 
 
 		 150 aa  84.7  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  33.11 
 
 		 150 aa  84.7  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>