More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0580 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0580  pyruvate kinase  100 
 
 		 456 aa  922    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000249893  decreased coverage  0.00109263 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0063  pyruvate kinase  37.47 
 
 		 449 aa  303  5.000000000000001e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0330  pyruvate kinase  38.13 
 
 		 464 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1106  pyruvate kinase  36.34 
 
 		 448 aa  281  2e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.25736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0029  pyruvate kinase  34.86 
 
 		 456 aa  273  6e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  36.21 
 
 		 481 aa  256  6e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  36.78 
 
 		 471 aa  255  9e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  34.68 
 
 		 585 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1412  pyruvate kinase  39.11 
 
 		 445 aa  255  1.0000000000000001e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000231842  hitchhiker  0.00097059 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  34.19 
 
 		 582 aa  252  8.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  35.82 
 
 		 581 aa  251  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  36.24 
 
 		 481 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1961  pyruvate kinase  37.75 
 
 		 452 aa  250  3e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  32.04 
 
 		 476 aa  249  7e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  34.05 
 
 		 578 aa  249  7e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  35.33 
 
 		 594 aa  249  9e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0630  pyruvate kinase  33.19 
 
 		 477 aa  248  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2858  pyruvate kinase  33.33 
 
 		 477 aa  248  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.810748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0202  pyruvate kinase  36.71 
 
 		 484 aa  247  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0922  pyruvate kinase  34.73 
 
 		 470 aa  247  3e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000158299  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  34.35 
 
 		 583 aa  247  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  34.61 
 
 		 483 aa  247  4e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  35.53 
 
 		 480 aa  246  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0383  pyruvate kinase  35.48 
 
 		 465 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140284  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  34.89 
 
 		 597 aa  246  9e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  34.44 
 
 		 586 aa  245  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0716  pyruvate kinase  36.81 
 
 		 466 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  35.82 
 
 		 588 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0558  pyruvate kinase  36.03 
 
 		 473 aa  244  1.9999999999999999e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  31.48 
 
 		 583 aa  244  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  34.07 
 
 		 482 aa  243  3.9999999999999997e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  34.89 
 
 		 596 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0432  pyruvate kinase  34.81 
 
 		 484 aa  243  6e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0263  pyruvate kinase  36.23 
 
 		 484 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1917  pyruvate kinase  33.62 
 
 		 478 aa  243  7e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1400  pyruvate kinase  34.29 
 
 		 470 aa  243  7e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0174  pyruvate kinase  36.23 
 
 		 484 aa  243  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.326455  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  35.23 
 
 		 478 aa  243  7e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  34.82 
 
 		 477 aa  242  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0740  pyruvate kinase  36.81 
 
 		 466 aa  242  1e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  34.08 
 
 		 480 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1638  pyruvate kinase  36.23 
 
 		 484 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0582  pyruvate kinase  34.18 
 
 		 477 aa  241  2e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  34.68 
 
 		 596 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  33.91 
 
 		 476 aa  240  4e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  34.79 
 
 		 585 aa  240  4e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  34.81 
 
 		 474 aa  238  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  34.39 
 
 		 494 aa  238  2e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  32.05 
 
 		 580 aa  238  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  33.77 
 
 		 577 aa  237  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1063  pyruvate kinase  33.85 
 
 		 488 aa  236  4e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.175798  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1999  pyruvate kinase  33.47 
 
 		 479 aa  237  4e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  34.19 
 
 		 470 aa  237  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  32.7 
 
 		 474 aa  236  7e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  34.62 
 
 		 584 aa  236  8e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  34.07 
 
 		 472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1701  pyruvate kinase  34.96 
 
 		 478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1209  hypothetical protein  31.74 
 
 		 481 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000430892 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1032  pyruvate kinase  35.53 
 
 		 470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2465  pyruvate kinase  33.11 
 
 		 478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  34.68 
 
 		 596 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1115  pyruvate kinase  34.14 
 
 		 490 aa  235  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000141137  hitchhiker  0.0000000000000541512 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  34.55 
 
 		 587 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2030  pyruvate kinase  33.11 
 
 		 476 aa  235  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587872 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3020  pyruvate kinase  32.63 
 
 		 487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  33.69 
 
 		 485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2983  pyruvate kinase  35.87 
 
 		 483 aa  234  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5207  pyruvate kinase  33.04 
 
 		 478 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0792274  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2370  pyruvate kinase  34.65 
 
 		 518 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2276  pyruvate kinase  31.91 
 
 		 481 aa  233  5e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756319  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15431  pyruvate kinase  33.55 
 
 		 605 aa  233  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.284197 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  33.84 
 
 		 477 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3090  pyruvate kinase  31.93 
 
 		 479 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  35.02 
 
 		 480 aa  232  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1693  pyruvate kinase  32.9 
 
 		 496 aa  232  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.119526  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  34.73 
 
 		 474 aa  232  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3331  pyruvate kinase  34.97 
 
 		 480 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616475  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  32.97 
 
 		 476 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  33.62 
 
 		 485 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1688  pyruvate kinase  32.26 
 
 		 496 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000849836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5962  pyruvate kinase  33.85 
 
 		 478 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814276  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  34.46 
 
 		 471 aa  231  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0406  pyruvate kinase  32.53 
 
 		 491 aa  230  4e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  34.57 
 
 		 479 aa  230  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3378  pyruvate kinase  34.37 
 
 		 479 aa  230  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  31.91 
 
 		 590 aa  229  5e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  33.19 
 
 		 592 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  33.19 
 
 		 592 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  31.58 
 
 		 488 aa  229  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2959  pyruvate kinase  33.76 
 
 		 505 aa  229  6e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4452  pyruvate kinase  34.35 
 
 		 484 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0972834  hitchhiker  0.00114079 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1362  pyruvate kinase  34.35 
 
 		 484 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.195831 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4362  pyruvate kinase  34.35 
 
 		 484 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0914278  normal  0.0371458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  32.6 
 
 		 487 aa  229  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4660  pyruvate kinase  33.33 
 
 		 470 aa  229  9e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  33.33 
 
 		 590 aa  228  1e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  33.19 
 
 		 472 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1054  pyruvate kinase  33.77 
 
 		 471 aa  229  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157797  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2305  pyruvate kinase  33.04 
 
 		 472 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.810817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  32.06 
 
 		 476 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>