More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0406 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0406  pyruvate kinase  100 
 
 		 491 aa  998    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2890  Pyruvate kinase  64.78 
 
 		 480 aa  613  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2387  pyruvate kinase  65.89 
 
 		 476 aa  594  1e-168  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0280741 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2805  pyruvate kinase  60.92 
 
 		 483 aa  567  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1078  pyruvate kinase  59.62 
 
 		 482 aa  557  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.346201  hitchhiker  0.000000814857 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22190  Pyruvate kinase  60.91 
 
 		 481 aa  550  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27240  Pyruvate kinase  60.62 
 
 		 481 aa  548  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0968  pyruvate kinase  60.21 
 
 		 487 aa  550  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.797845  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43370  Pyruvate kinase  60.71 
 
 		 481 aa  548  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.692487  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51360  Pyruvate kinase  60.5 
 
 		 481 aa  545  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49990  Pyruvate kinase  60.5 
 
 		 481 aa  545  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01242  pyruvate kinase II  59.58 
 
 		 478 aa  540  9.999999999999999e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.01193  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003011  pyruvate kinase  57.44 
 
 		 480 aa  535  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1308  pyruvate kinase  58.4 
 
 		 480 aa  536  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0412594 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2843  pyruvate kinase  56.93 
 
 		 484 aa  536  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2597  pyruvate kinase  58.21 
 
 		 488 aa  533  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.384426  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3595  pyruvate kinase  57.98 
 
 		 477 aa  533  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103054 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1594  pyruvate kinase II  57.53 
 
 		 481 aa  531  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2138  pyruvate kinase  58.53 
 
 		 480 aa  528  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0047703  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01825  pyruvate kinase  58.53 
 
 		 480 aa  525  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000225917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1786  pyruvate kinase  58.53 
 
 		 480 aa  525  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00016701  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0162  pyruvate kinase  58.26 
 
 		 477 aa  526  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.158793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1947  pyruvate kinase  58.53 
 
 		 480 aa  525  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.327094  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2114  pyruvate kinase  58.11 
 
 		 480 aa  526  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2246  pyruvate kinase  58.32 
 
 		 480 aa  527  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2590  pyruvate kinase  58.53 
 
 		 480 aa  526  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153756  normal  0.679884 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1830  pyruvate kinase  58.11 
 
 		 480 aa  525  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2084  pyruvate kinase  58.53 
 
 		 480 aa  526  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00593722  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1778  pyruvate kinase  58.53 
 
 		 480 aa  525  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077358  normal  0.39747 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2130  pyruvate kinase  58.53 
 
 		 480 aa  525  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01813  hypothetical protein  58.53 
 
 		 480 aa  525  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000183599  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1332  pyruvate kinase  58.53 
 
 		 480 aa  525  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0207404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02874  pyruvate kinase II  57.14 
 
 		 518 aa  523  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1236  pyruvate kinase  58.32 
 
 		 480 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0173546  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2042  pyruvate kinase  58.32 
 
 		 480 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2102  pyruvate kinase  58.32 
 
 		 480 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.590561 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0690  pyruvate kinase  57.44 
 
 		 478 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1360  pyruvate kinase  58.32 
 
 		 480 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106873 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2770  pyruvate kinase  58.32 
 
 		 480 aa  524  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00459379  hitchhiker  0.00854909 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2047  pyruvate kinase  58.32 
 
 		 480 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.203446 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3276  pyruvate kinase  57.65 
 
 		 478 aa  524  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.376428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1831  pyruvate kinase  56.58 
 
 		 482 aa  523  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2414  pyruvate kinase  57.56 
 
 		 480 aa  518  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000465691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2423  pyruvate kinase  57.68 
 
 		 480 aa  520  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0231497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2337  pyruvate kinase  58.79 
 
 		 478 aa  520  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2024  pyruvate kinase  57.77 
 
 		 480 aa  521  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0139067  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2136  pyruvate kinase  57.77 
 
 		 480 aa  521  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2068  pyruvate kinase  58.4 
 
 		 479 aa  519  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000423476  decreased coverage  0.0000129577 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2050  pyruvate kinase  58.19 
 
 		 479 aa  520  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000311706  normal  0.406012 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1040  pyruvate kinase  55.63 
 
 		 478 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1559  pyruvate kinase  57.5 
 
 		 489 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33744  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2541  pyruvate kinase  57.56 
 
 		 479 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1596  normal  0.0943114 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1490  pyruvate kinase  56.09 
 
 		 484 aa  512  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.262532  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3261  pyruvate kinase  55.65 
 
 		 483 aa  509  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.793172 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0227  pyruvate kinase  54.53 
 
 		 484 aa  508  1e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.930918  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0579  pyruvate kinase II  56.42 
 
 		 481 aa  509  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0460  pyruvate kinase  56.6 
 
 		 478 aa  508  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31073  normal  0.427557 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2244  pyruvate kinase  54.76 
 
 		 480 aa  509  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0168966 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1814  pyruvate kinase  58.44 
 
 		 479 aa  511  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000221923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1978  pyruvate kinase  54.53 
 
 		 484 aa  508  1e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.65271  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0840  pyruvate kinase  55.97 
 
 		 478 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0298  pyruvate kinase  55.97 
 
 		 478 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0676132  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0835  pyruvate kinase  55.97 
 
 		 478 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0593  pyruvate kinase  55.97 
 
 		 478 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0996  pyruvate kinase  55.97 
 
 		 478 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0664  pyruvate kinase  55.15 
 
 		 564 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.873714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2427  pyruvate kinase  55.97 
 
 		 478 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.637493  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0039  pyruvate kinase  55.97 
 
 		 478 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2048  pyruvate kinase  56.93 
 
 		 479 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.802342  normal  0.234102 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1927  pyruvate kinase  56.93 
 
 		 479 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315658  normal  0.805143 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2279  pyruvate kinase  54.51 
 
 		 483 aa  503  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206289  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2491  pyruvate kinase II  56.3 
 
 		 479 aa  502  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2153  pyruvate kinase  56.72 
 
 		 479 aa  503  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.39397  normal  0.789871 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2173  pyruvate kinase  56.51 
 
 		 479 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0938169  normal  0.15404 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4529  hypothetical protein  56.51 
 
 		 479 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4448  pyruvate kinase  55.46 
 
 		 483 aa  500  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1864  pyruvate kinase  56.51 
 
 		 479 aa  501  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2128  pyruvate kinase  56.51 
 
 		 479 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00068452  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2243  pyruvate kinase  56.51 
 
 		 479 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2081  pyruvate kinase  55.88 
 
 		 479 aa  500  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2256  pyruvate kinase  56.51 
 
 		 479 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00711643  hitchhiker  0.0000287855 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2016  pyruvate kinase  57.11 
 
 		 478 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2656  pyruvate kinase  57.11 
 
 		 478 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2627  pyruvate kinase  57.11 
 
 		 478 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326659  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2361  pyruvate kinase  54.95 
 
 		 476 aa  501  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.011501 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2850  pyruvate kinase  56.81 
 
 		 479 aa  495  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0572  pyruvate kinase  57.02 
 
 		 479 aa  495  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5958  pyruvate kinase  56.69 
 
 		 478 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.169405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38410  pyruvate kinase  54.28 
 
 		 483 aa  498  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2547  pyruvate kinase  56.9 
 
 		 478 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.138922  normal  0.914992 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0479  pyruvate kinase  57.74 
 
 		 479 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3249  pyruvate kinase II  56.81 
 
 		 479 aa  495  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152379  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1890  pyruvate kinase  55.88 
 
 		 479 aa  495  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2674  pyruvate kinase  56.9 
 
 		 478 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0671  pyruvate kinase  56.69 
 
 		 478 aa  495  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4029  pyruvate kinase  53.77 
 
 		 483 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1002  pyruvate kinase  53.77 
 
 		 484 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614648  hitchhiker  0.00000000209752 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1086  pyruvate kinase  55.6 
 
 		 479 aa  493  9.999999999999999e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0492  pyruvate kinase  57.53 
 
 		 479 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1362  pyruvate kinase  53.36 
 
 		 484 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.195831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>