More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0492 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0360  pyruvate kinase  72.96 
 
 
476 aa  664    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00195757 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0840  pyruvate kinase  78.08 
 
 
478 aa  749    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0572  pyruvate kinase  94.15 
 
 
479 aa  894    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0290  pyruvate kinase  74.63 
 
 
478 aa  691    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0208405 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0492  pyruvate kinase  100 
 
 
479 aa  969    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0671  pyruvate kinase  78.08 
 
 
478 aa  728    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0298  pyruvate kinase  78.08 
 
 
478 aa  749    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0676132  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3595  pyruvate kinase  68.75 
 
 
477 aa  650    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103054 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3276  pyruvate kinase  77.36 
 
 
478 aa  741    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.376428  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1490  pyruvate kinase  66.46 
 
 
484 aa  638    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.262532  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0558  pyruvate kinase  87 
 
 
478 aa  822    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5100  pyruvate kinase  72.73 
 
 
482 aa  679    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0996  pyruvate kinase  78.08 
 
 
478 aa  749    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0479  pyruvate kinase  99.37 
 
 
479 aa  964    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2547  pyruvate kinase  78.08 
 
 
478 aa  727    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.138922  normal  0.914992 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5958  pyruvate kinase  78.5 
 
 
478 aa  727    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.169405 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0664  pyruvate kinase  78.29 
 
 
564 aa  749    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.873714  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1816  pyruvate kinase  67.3 
 
 
478 aa  634    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0923913  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0205  pyruvate kinase  72.84 
 
 
476 aa  678    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0460  pyruvate kinase  77.36 
 
 
478 aa  739    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31073  normal  0.427557 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4634  pyruvate kinase  74.37 
 
 
477 aa  690    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0690  pyruvate kinase  77.15 
 
 
478 aa  740    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3305  pyruvate kinase  73 
 
 
478 aa  683    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0502  pyruvate kinase  87.21 
 
 
479 aa  807    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0039  pyruvate kinase  78.08 
 
 
478 aa  749    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0835  pyruvate kinase  78.08 
 
 
478 aa  749    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2016  pyruvate kinase  78.29 
 
 
478 aa  728    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2427  pyruvate kinase  78.08 
 
 
478 aa  749    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.637493  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2656  pyruvate kinase  78.29 
 
 
478 aa  728    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610216  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2674  pyruvate kinase  78.5 
 
 
478 aa  732    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2627  pyruvate kinase  78.29 
 
 
478 aa  728    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326659  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1531  pyruvate kinase  67.3 
 
 
478 aa  642    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0930  pyruvate kinase  73.05 
 
 
478 aa  682    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4581  pyruvate kinase  72.9 
 
 
478 aa  676    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3873  pyruvate kinase  73.89 
 
 
477 aa  681    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3956  pyruvate kinase  73.42 
 
 
478 aa  674    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0593  pyruvate kinase  78.08 
 
 
478 aa  749    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0196  pyruvate kinase  72.84 
 
 
496 aa  645    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0162  pyruvate kinase  64.23 
 
 
477 aa  597  1e-169  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.158793 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2244  pyruvate kinase  62.84 
 
 
480 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0168966 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0385  pyruvate kinase  60.08 
 
 
484 aa  557  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3249  pyruvate kinase II  58.87 
 
 
479 aa  526  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152379  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2850  pyruvate kinase  58.87 
 
 
479 aa  526  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0406  pyruvate kinase  57.53 
 
 
491 aa  514  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2890  Pyruvate kinase  55.02 
 
 
480 aa  508  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2597  pyruvate kinase  54.58 
 
 
488 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.384426  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1362  pyruvate kinase  52.92 
 
 
484 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.195831 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1002  pyruvate kinase  52.92 
 
 
484 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614648  hitchhiker  0.00000000209752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4362  pyruvate kinase  52.92 
 
 
484 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0914278  normal  0.0371458 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2805  pyruvate kinase  54.15 
 
 
483 aa  483  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2387  pyruvate kinase  55.23 
 
 
476 aa  483  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0280741 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1308  pyruvate kinase  53.11 
 
 
480 aa  482  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0412594 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1559  pyruvate kinase  54.79 
 
 
489 aa  482  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33744  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4452  pyruvate kinase  52.92 
 
 
484 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0972834  hitchhiker  0.00114079 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4029  pyruvate kinase  52.81 
 
 
483 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4448  pyruvate kinase  53.54 
 
 
483 aa  478  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1078  pyruvate kinase  53.31 
 
 
482 aa  476  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.346201  hitchhiker  0.000000814857 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2081  pyruvate kinase  51.66 
 
 
479 aa  476  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0968  pyruvate kinase  52.39 
 
 
487 aa  475  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.797845  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38410  pyruvate kinase  54.47 
 
 
483 aa  476  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2361  pyruvate kinase  53.22 
 
 
476 aa  478  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.011501 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1831  pyruvate kinase  53.32 
 
 
482 aa  478  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1040  pyruvate kinase  52.9 
 
 
478 aa  476  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4337  pyruvate kinase  53.22 
 
 
483 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003011  pyruvate kinase  51.04 
 
 
480 aa  472  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01242  pyruvate kinase II  53.21 
 
 
478 aa  474  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.01193  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3261  pyruvate kinase  54.68 
 
 
483 aa  474  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.793172 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1849  pyruvate kinase  53.12 
 
 
489 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0292343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56240  pyruvate kinase  54.77 
 
 
483 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2279  pyruvate kinase  52.7 
 
 
483 aa  469  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206289  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22190  Pyruvate kinase  54.55 
 
 
481 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2843  pyruvate kinase  53.54 
 
 
484 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1890  pyruvate kinase  51.66 
 
 
479 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2246  pyruvate kinase  52.51 
 
 
480 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4898  pyruvate kinase  54.26 
 
 
483 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0247  pyruvate kinase  52.72 
 
 
480 aa  468  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000162471  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2138  pyruvate kinase  52.72 
 
 
480 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0047703  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0579  pyruvate kinase II  51.57 
 
 
481 aa  466  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51360  Pyruvate kinase  54.13 
 
 
481 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2050  pyruvate kinase  51.04 
 
 
479 aa  462  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000311706  normal  0.406012 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02874  pyruvate kinase II  51.36 
 
 
518 aa  463  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3622  pyruvate kinase  52.09 
 
 
480 aa  463  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.241256  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2114  pyruvate kinase  51.88 
 
 
480 aa  462  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27240  Pyruvate kinase  54.13 
 
 
481 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1814  pyruvate kinase  51.67 
 
 
479 aa  464  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000221923  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43370  Pyruvate kinase  54.13 
 
 
481 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.692487  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1830  pyruvate kinase  51.88 
 
 
480 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2491  pyruvate kinase II  51.65 
 
 
479 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1360  pyruvate kinase  51.88 
 
 
480 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106873 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1236  pyruvate kinase  51.88 
 
 
480 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0173546  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2337  pyruvate kinase  51.87 
 
 
478 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49990  Pyruvate kinase  54.13 
 
 
481 aa  461  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2541  pyruvate kinase  50.21 
 
 
479 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1596  normal  0.0943114 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2042  pyruvate kinase  51.88 
 
 
480 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2048  pyruvate kinase  51.65 
 
 
479 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.802342  normal  0.234102 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1927  pyruvate kinase  51.65 
 
 
479 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315658  normal  0.805143 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2102  pyruvate kinase  51.88 
 
 
480 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.590561 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2047  pyruvate kinase  51.88 
 
 
480 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.203446 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2153  pyruvate kinase  51.85 
 
 
479 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.39397  normal  0.789871 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1947  pyruvate kinase  51.67 
 
 
480 aa  456  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.327094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>