More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2547 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2547  pyruvate kinase  100 
 
 		 478 aa  972    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.138922  normal  0.914992 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0290  pyruvate kinase  71.58 
 
 		 478 aa  677    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208405 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0835  pyruvate kinase  93.31 
 
 		 478 aa  914    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0572  pyruvate kinase  78.91 
 
 		 479 aa  733    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3276  pyruvate kinase  88.91 
 
 		 478 aa  875    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.376428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1490  pyruvate kinase  68.48 
 
 		 484 aa  650    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.262532  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0039  pyruvate kinase  93.31 
 
 		 478 aa  914    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1816  pyruvate kinase  66.25 
 
 		 478 aa  634    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0923913  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0298  pyruvate kinase  93.31 
 
 		 478 aa  914    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0676132  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3595  pyruvate kinase  68.2 
 
 		 477 aa  645    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103054 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0492  pyruvate kinase  78.08 
 
 		 479 aa  728    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2427  pyruvate kinase  93.31 
 
 		 478 aa  914    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.637493  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0558  pyruvate kinase  77.15 
 
 		 478 aa  729    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0930  pyruvate kinase  71.58 
 
 		 478 aa  681    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0996  pyruvate kinase  93.31 
 
 		 478 aa  914    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5958  pyruvate kinase  98.74 
 
 		 478 aa  959    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.169405 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0460  pyruvate kinase  88.03 
 
 		 478 aa  861    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31073  normal  0.427557 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0479  pyruvate kinase  78.08 
 
 		 479 aa  728    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0664  pyruvate kinase  92.89 
 
 		 564 aa  912    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.873714  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5100  pyruvate kinase  71.88 
 
 		 482 aa  685    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0205  pyruvate kinase  71.31 
 
 		 476 aa  674    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2656  pyruvate kinase  98.95 
 
 		 478 aa  961    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4634  pyruvate kinase  71.52 
 
 		 477 aa  668    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0690  pyruvate kinase  88.28 
 
 		 478 aa  871    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0502  pyruvate kinase  77.15 
 
 		 479 aa  711    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0840  pyruvate kinase  93.31 
 
 		 478 aa  914    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2016  pyruvate kinase  98.95 
 
 		 478 aa  961    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0360  pyruvate kinase  71.58 
 
 		 476 aa  656    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00195757 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2674  pyruvate kinase  99.58 
 
 		 478 aa  966    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2627  pyruvate kinase  98.95 
 
 		 478 aa  961    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326659  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1531  pyruvate kinase  66.04 
 
 		 478 aa  639    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0671  pyruvate kinase  96.23 
 
 		 478 aa  915    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3305  pyruvate kinase  70.68 
 
 		 478 aa  674    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4581  pyruvate kinase  70.17 
 
 		 478 aa  664    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3873  pyruvate kinase  72.15 
 
 		 477 aa  675    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3956  pyruvate kinase  71.31 
 
 		 478 aa  669    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0593  pyruvate kinase  93.31 
 
 		 478 aa  914    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0196  pyruvate kinase  70.04 
 
 		 496 aa  632  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0162  pyruvate kinase  62.18 
 
 		 477 aa  579  1e-164  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.158793 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2244  pyruvate kinase  60.96 
 
 		 480 aa  570  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0168966 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0385  pyruvate kinase  58.8 
 
 		 484 aa  542  1e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0406  pyruvate kinase  56.9 
 
 		 491 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2890  Pyruvate kinase  54.93 
 
 		 480 aa  511  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3249  pyruvate kinase II  56.88 
 
 		 479 aa  501  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152379  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2850  pyruvate kinase  56.88 
 
 		 479 aa  501  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2597  pyruvate kinase  54.45 
 
 		 488 aa  489  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.384426  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2843  pyruvate kinase  54.49 
 
 		 484 aa  489  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003011  pyruvate kinase  53.33 
 
 		 480 aa  483  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1040  pyruvate kinase  53.75 
 
 		 478 aa  484  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1078  pyruvate kinase  54.34 
 
 		 482 aa  481  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.346201  hitchhiker  0.000000814857 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2805  pyruvate kinase  52.82 
 
 		 483 aa  479  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1362  pyruvate kinase  52.39 
 
 		 484 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.195831 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4362  pyruvate kinase  52.39 
 
 		 484 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0914278  normal  0.0371458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4452  pyruvate kinase  52.6 
 
 		 484 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0972834  hitchhiker  0.00114079 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3261  pyruvate kinase  54.47 
 
 		 483 aa  473  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.793172 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1002  pyruvate kinase  52.18 
 
 		 484 aa  475  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614648  hitchhiker  0.00000000209752 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1559  pyruvate kinase  53.43 
 
 		 489 aa  474  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33744  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2114  pyruvate kinase  52.93 
 
 		 480 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0968  pyruvate kinase  52.6 
 
 		 487 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.797845  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2337  pyruvate kinase  52.49 
 
 		 478 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02874  pyruvate kinase II  52.4 
 
 		 518 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1830  pyruvate kinase  52.93 
 
 		 480 aa  467  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2050  pyruvate kinase  51.87 
 
 		 479 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000311706  normal  0.406012 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38410  pyruvate kinase  53.22 
 
 		 483 aa  465  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22190  Pyruvate kinase  52.99 
 
 		 481 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1978  pyruvate kinase  52.19 
 
 		 484 aa  467  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.65271  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2048  pyruvate kinase  53.11 
 
 		 479 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.802342  normal  0.234102 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1927  pyruvate kinase  53.11 
 
 		 479 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315658  normal  0.805143 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0227  pyruvate kinase  52.19 
 
 		 484 aa  467  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.930918  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2153  pyruvate kinase  52.9 
 
 		 479 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.39397  normal  0.789871 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2361  pyruvate kinase  53 
 
 		 476 aa  468  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.011501 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2491  pyruvate kinase II  52.89 
 
 		 479 aa  463  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2246  pyruvate kinase  53.14 
 
 		 480 aa  464  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2387  pyruvate kinase  52.93 
 
 		 476 aa  463  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0280741 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2541  pyruvate kinase  51.87 
 
 		 479 aa  462  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1596  normal  0.0943114 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2138  pyruvate kinase  52.93 
 
 		 480 aa  463  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0047703  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43370  Pyruvate kinase  52.78 
 
 		 481 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.692487  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1308  pyruvate kinase  52.07 
 
 		 480 aa  462  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0412594 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2081  pyruvate kinase  51.86 
 
 		 479 aa  464  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51360  Pyruvate kinase  52.78 
 
 		 481 aa  463  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01242  pyruvate kinase II  52.38 
 
 		 478 aa  463  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.01193  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3622  pyruvate kinase  52.3 
 
 		 480 aa  462  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.241256  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1814  pyruvate kinase  52.9 
 
 		 479 aa  462  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000221923  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01825  pyruvate kinase  52.81 
 
 		 480 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000225917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1786  pyruvate kinase  52.81 
 
 		 480 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00016701  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2243  pyruvate kinase  52.89 
 
 		 479 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1360  pyruvate kinase  52.81 
 
 		 480 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106873 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4029  pyruvate kinase  50.94 
 
 		 483 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2256  pyruvate kinase  52.89 
 
 		 479 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00711643  hitchhiker  0.0000287855 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2173  pyruvate kinase  52.89 
 
 		 479 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0938169  normal  0.15404 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2047  pyruvate kinase  52.81 
 
 		 480 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.203446 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1778  pyruvate kinase  52.81 
 
 		 480 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077358  normal  0.39747 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1947  pyruvate kinase  52.81 
 
 		 480 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.327094  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1594  pyruvate kinase II  51.97 
 
 		 481 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2590  pyruvate kinase  52.6 
 
 		 480 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153756  normal  0.679884 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2128  pyruvate kinase  52.69 
 
 		 479 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00068452  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2102  pyruvate kinase  52.81 
 
 		 480 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.590561 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1890  pyruvate kinase  51.66 
 
 		 479 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01813  hypothetical protein  52.81 
 
 		 480 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000183599  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2042  pyruvate kinase  52.81 
 
 		 480 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>