More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1698 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1882  xanthine/uracil/vitamin C permease  82.68 
 
 		 433 aa  703    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1589  Xanthine/uracil/vitamin C permease  76.21 
 
 		 434 aa  656    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0847  Xanthine/uracil/vitamin C permease  70.67 
 
 		 433 aa  635    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0132652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1698  Xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 433 aa  858    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1067  Xanthine/uracil/vitamin C permease  82.22 
 
 		 435 aa  684    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1074  xanthine/uracil permease family protein  74.83 
 
 		 433 aa  630  1e-179  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1494  xanthine/uracil permease family protein  67.44 
 
 		 435 aa  587  1e-166  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1019  xanthine/uracil permease family protein  57.77 
 
 		 433 aa  527  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0388541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1032  Xanthine/uracil/vitamin C permease  58.47 
 
 		 433 aa  527  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2715  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  58 
 
 		 436 aa  523  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0553  Xanthine/uracil/vitamin C permease  60.84 
 
 		 436 aa  518  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000333886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0540  Xanthine/uracil/vitamin C permease  60.37 
 
 		 436 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000138914  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3003  xanthine/uracil/vitamin C permease  61.02 
 
 		 433 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2295  xanthine/uracil/vitamin C transporter  53.01 
 
 		 436 aa  485  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.9 
 
 		 433 aa  374  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.33 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.84 
 
 		 433 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.08 
 
 		 433 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.32 
 
 		 433 aa  371  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.47 
 
 		 442 aa  359  4e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.33 
 
 		 446 aa  350  3e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.21 
 
 		 430 aa  349  5e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5908  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.39 
 
 		 432 aa  347  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.688151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.5 
 
 		 463 aa  347  3e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.39 
 
 		 441 aa  344  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.81 
 
 		 453 aa  341  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.69 
 
 		 429 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.65 
 
 		 431 aa  339  5e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.86 
 
 		 446 aa  339  5e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  42.42 
 
 		 431 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  42.42 
 
 		 431 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.26 
 
 		 440 aa  338  9.999999999999999e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3669  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.72 
 
 		 446 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.4 
 
 		 434 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.4 
 
 		 434 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.94 
 
 		 431 aa  335  9e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.47 
 
 		 431 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1827  xanthine/uracil permease family protein  42.52 
 
 		 429 aa  334  1e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.38 
 
 		 446 aa  335  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.84 
 
 		 431 aa  335  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  42.89 
 
 		 430 aa  333  4e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.47 
 
 		 441 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  41.81 
 
 		 431 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.04 
 
 		 431 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1547  permease  42.52 
 
 		 429 aa  332  7.000000000000001e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198208  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.36 
 
 		 437 aa  332  8e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.47 
 
 		 431 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3956  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.62 
 
 		 449 aa  332  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550955  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  41.86 
 
 		 434 aa  330  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  42.66 
 
 		 430 aa  330  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.09 
 
 		 430 aa  330  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.38 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.56 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.84 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  41.91 
 
 		 430 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5121  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.02 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.560875  normal  0.502437 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1078  NCS2 family nucleobase/cation symporter  42.33 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234361  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44800  putative transporter  42.24 
 
 		 449 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0281  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.24 
 
 		 436 aa  326  5e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681236  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0429  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.72 
 
 		 435 aa  326  5e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.39 
 
 		 431 aa  325  9e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.03 
 
 		 432 aa  325  9e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4284  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.39 
 
 		 449 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.59 
 
 		 454 aa  324  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3848  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.39 
 
 		 449 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0846  xanthine/uracil family permease  40.38 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  41.26 
 
 		 429 aa  324  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3610  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.39 
 
 		 449 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482914  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0936  xanthine/uracil permease family protein  40.74 
 
 		 433 aa  322  7e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0512099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3815  putative transporter  41.77 
 
 		 449 aa  322  8e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231468  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07810  Xanthine/uracil/vitamin C permease family  43.16 
 
 		 494 aa  322  9.000000000000001e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1584  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.16 
 
 		 449 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  40.65 
 
 		 429 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  41.47 
 
 		 453 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0702  xanthine/uracil/vitamin C transporter  41.86 
 
 		 433 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.86 
 
 		 446 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3644  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.09 
 
 		 433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4915  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.09 
 
 		 433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4217  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.33 
 
 		 445 aa  319  5e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4396  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.09 
 
 		 433 aa  319  5e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323664  normal  0.0500816 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  41.19 
 
 		 430 aa  319  6e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.55 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5312  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.33 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0101725  normal  0.154403 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1814  permease  42.33 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3392  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.33 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4975  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.33 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900295  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0897  AzgA family purine transporter  42.09 
 
 		 433 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196873  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2164  permease  42.09 
 
 		 433 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0806  AzgA family purine transporter  42.09 
 
 		 433 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.21 
 
 		 431 aa  318  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1722  permease  42.2 
 
 		 465 aa  316  4e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.644208  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5815  putative xanthine/uracil permease  40.88 
 
 		 453 aa  316  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2004  xanthine/uracil permease family protein  41.67 
 
 		 465 aa  316  5e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.461655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.18 
 
 		 462 aa  315  8e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3244  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.8 
 
 		 461 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.05 
 
 		 429 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.52 
 
 		 429 aa  312  9e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0039  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.69 
 
 		 444 aa  311  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0035  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.69 
 
 		 444 aa  311  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3877  sulfate permease family inorganic anion transporter  38.69 
 
 		 470 aa  311  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>