More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0040 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  473  1e-133  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0311  hypothetical protein  74.15 
 
 
237 aa  360  8e-99  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.322092  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0288  hypothetical protein  61.6 
 
 
239 aa  293  1e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  59.92 
 
 
239 aa  285  5e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  37.66 
 
 
240 aa  173  2e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  37.5 
 
 
241 aa  171  1e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0514  methyltransferase domain-containing protein  40.5 
 
 
242 aa  156  3e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  36.36 
 
 
261 aa  93.6  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  24.89 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  26.61 
 
 
253 aa  73.9  2e-12  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  30.83 
 
 
292 aa  70.1  3e-11  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  26.11 
 
 
286 aa  67.4  2e-10  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  28.89 
 
 
299 aa  66.2  5e-10  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  31.21 
 
 
294 aa  65.5  7e-10  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  33.33 
 
 
270 aa  64.7  1e-09  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  29.71 
 
 
323 aa  64.7  1e-09  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  30 
 
 
279 aa  60.1  3e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  29.46 
 
 
275 aa  59.7  4e-08  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 
218 aa  58.5  8e-08  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  31.67 
 
 
241 aa  57.4  2e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  28.57 
 
 
279 aa  57.4  2e-07  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  32.95 
 
 
286 aa  57  3e-07  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  28.79 
 
 
284 aa  56.2  4e-07  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  29.77 
 
 
289 aa  55.8  5e-07  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  26.83 
 
 
268 aa  55.8  5e-07  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  26.71 
 
 
288 aa  56.2  5e-07  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8959  hypothetical protein  24.14 
 
 
261 aa  55.5  7e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.66 
 
 
291 aa  55.5  7e-07  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  27.08 
 
 
284 aa  55.1  9e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  35.63 
 
 
275 aa  54.7  1e-06  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  28.7 
 
 
260 aa  54.3  1e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  27.74 
 
 
263 aa  53.9  2e-06  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  34.34 
 
 
265 aa  54.3  2e-06  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  30.36 
 
 
203 aa  53.9  2e-06  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  26.55 
 
 
265 aa  53.5  3e-06  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  40.86 
 
 
243 aa  53.1  3e-06  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  40 
 
 
218 aa  53.5  3e-06  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.49 
 
 
236 aa  52.8  4e-06  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930008  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  28.24 
 
 
283 aa  52.8  5e-06  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  35.14 
 
 
251 aa  52  7e-06  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  29.55 
 
 
286 aa  52  8e-06  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2236  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.68 
 
 
253 aa  51.6  9e-06  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0596269  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0680  hypothetical protein  34.83 
 
 
280 aa  51.2  1e-05  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
276 aa  51.2  1e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_002936  DET0646  hypothetical protein  34.83 
 
 
280 aa  51.2  1e-05  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  28.33 
 
 
283 aa  51.2  1e-05  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  25.26 
 
 
270 aa  51.6  1e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  25 
 
 
279 aa  51.2  1e-05  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  29.92 
 
 
202 aa  50.4  2e-05  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
293 aa  50.4  2e-05  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  24.4 
 
 
298 aa  50.4  2e-05  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  24.24 
 
 
287 aa  50.1  3e-05  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  26.09 
 
 
291 aa  50.1  3e-05  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  28.92 
 
 
258 aa  49.7  3e-05  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 
270 aa  50.1  3e-05  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 
252 aa  50.4  3e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  30.11 
 
 
221 aa  50.1  3e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0403  putative methyltransferase  28.7 
 
 
210 aa  49.7  4e-05  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00297063  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  28.32 
 
 
274 aa  49.7  4e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 
267 aa  49.7  4e-05  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 
209 aa  49.3  5e-05  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  8.51252e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  34.78 
 
 
278 aa  49.3  5e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  4.79797e-05 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 
252 aa  48.9  6e-05  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  31.94 
 
 
214 aa  48.9  6e-05  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0218  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
212 aa  49.3  6e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0911  Methyltransferase type 11  41.27 
 
 
247 aa  48.9  6e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  23.5 
 
 
273 aa  48.9  6e-05  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  36.46 
 
 
246 aa  49.3  6e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.67 
 
 
255 aa  48.9  7e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
256 aa  48.9  7e-05  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  25.47 
 
 
280 aa  48.9  7e-05  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  4.70965e-06  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
247 aa  48.9  7e-05  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0981  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  30.19 
 
 
187 aa  48.5  8e-05  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  28.85 
 
 
291 aa  48.5  9e-05  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  33.02 
 
 
246 aa  48.5  9e-05  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  33 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1076  Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II-like protein  30.19 
 
 
176 aa  47.8  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1113  bifunctional 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase and 2-octaprenyl-6-hydroxy phenol methylase  34.21 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3390  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.93 
 
 
449 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.02988  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  35.23 
 
 
199 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  2.3308e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.06 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1453  SAM-dependent methyltransferase  41.54 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.938233  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.52 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.38 
 
 
234 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  3.60433e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.52 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0352  RNA methyltransferase  29.13 
 
 
434 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4628  MCP methyltransferase, CheR-type  41.3 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  23.98 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  31.51 
 
 
305 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4039  methyltransferase type 12  27.33 
 
 
209 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668919  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0618  methyltransferase type 12  32.58 
 
 
280 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00582618  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0552  RNA methyltransferase  28.16 
 
 
439 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2138  Methyltransferase type 11  42.22 
 
 
260 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  35.59 
 
 
232 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3549  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.9 
 
 
449 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.029326  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  27.12 
 
 
302 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  35.14 
 
 
216 aa  46.6  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.13 
 
 
207 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>