More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2254 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  85.38 
 
 		 433 aa  754    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  76 
 
 		 429 aa  667    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2254  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 431 aa  877    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0274446  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  73.38 
 
 		 434 aa  628  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  71.36 
 
 		 430 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  71.06 
 
 		 428 aa  622  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  70.7 
 
 		 431 aa  619  1e-176  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  70.7 
 
 		 431 aa  619  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  70.42 
 
 		 430 aa  615  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  68.94 
 
 		 427 aa  610  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  71.7 
 
 		 426 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  70.59 
 
 		 428 aa  602  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  69.05 
 
 		 425 aa  599  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  68.54 
 
 		 430 aa  599  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  67.61 
 
 		 431 aa  594  1e-169  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  69.36 
 
 		 425 aa  596  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3001  phosphopyruvate hydratase  67.28 
 
 		 437 aa  588  1e-167  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000734369  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 431 aa  586  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 431 aa  586  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 431 aa  586  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  67.21 
 
 		 431 aa  587  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 431 aa  586  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  68.71 
 
 		 428 aa  585  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 431 aa  586  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  68.54 
 
 		 431 aa  587  1e-166  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 		 429 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0446  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 434 aa  580  1e-164  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  67.06 
 
 		 432 aa  580  1e-164  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  67.45 
 
 		 431 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  66.27 
 
 		 427 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  67.45 
 
 		 431 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  66.2 
 
 		 429 aa  576  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4067  enolase  65.12 
 
 		 435 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  67.21 
 
 		 431 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0277  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 430 aa  571  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000069334  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  66.9 
 
 		 429 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  66.9 
 
 		 429 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 431 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  64.55 
 
 		 428 aa  570  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4373  enolase  65.95 
 
 		 423 aa  568  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 		 428 aa  565  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  64.8 
 
 		 434 aa  566  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  63.29 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0817  phosphopyruvate hydratase  64.8 
 
 		 434 aa  566  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 		 427 aa  564  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0050  phosphopyruvate hydratase  62.85 
 
 		 429 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0074  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 		 429 aa  561  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00475517  unclonable  0.00000000106415 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4532  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 429 aa  563  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0151  enolase  64.44 
 
 		 427 aa  561  1.0000000000000001e-159  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  65.81 
 
 		 431 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0341  phosphopyruvate hydratase  63.23 
 
 		 433 aa  564  1.0000000000000001e-159  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0050  phosphopyruvate hydratase  62.85 
 
 		 429 aa  560  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  65.26 
 
 		 429 aa  559  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3133  enolase  65.87 
 
 		 427 aa  560  1e-158  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00432064  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  64.94 
 
 		 432 aa  560  1e-158  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0701  phosphopyruvate hydratase  65.4 
 
 		 431 aa  555  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0744  enolase  67.22 
 
 		 426 aa  556  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5032  enolase  65.64 
 
 		 426 aa  556  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  63.29 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 433 aa  555  1e-157  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  64.29 
 
 		 422 aa  555  1e-157  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  64.79 
 
 		 429 aa  554  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  62.59 
 
 		 427 aa  551  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  63.76 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  64.52 
 
 		 427 aa  551  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0684  phosphopyruvate hydratase  63.72 
 
 		 434 aa  551  1e-156  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00725906  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0628  phosphopyruvate hydratase  63.81 
 
 		 435 aa  548  1e-155  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  65.47 
 
 		 425 aa  548  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0174  phosphopyruvate hydratase  60.98 
 
 		 429 aa  548  1e-155  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.165268  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  62.59 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  65.47 
 
 		 425 aa  548  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  61.88 
 
 		 427 aa  549  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  64.17 
 
 		 430 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  62.82 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  62.44 
 
 		 428 aa  548  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05865  enolase  65.18 
 
 		 428 aa  550  1e-155  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2689  phosphopyruvate hydratase  63.28 
 
 		 437 aa  548  1e-155  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3739  phosphopyruvate hydratase  63.92 
 
 		 431 aa  548  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535822  normal  0.0352048 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  65.23 
 
 		 425 aa  548  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  62.82 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  62.44 
 
 		 428 aa  549  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  62.59 
 
 		 427 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  62.82 
 
 		 427 aa  545  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  63.06 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  63.42 
 
 		 428 aa  546  1e-154  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  63.06 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0358  enolase  64.55 
 
 		 429 aa  543  1e-153  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1162  enolase  64.2 
 
 		 430 aa  541  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  61.5 
 
 		 429 aa  542  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  62.82 
 
 		 427 aa  542  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1972  phosphopyruvate hydratase  62.59 
 
 		 437 aa  542  1e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0278  phosphopyruvate hydratase  63.51 
 
 		 437 aa  544  1e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301795 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0368  phosphopyruvate hydratase  65.81 
 
 		 430 aa  542  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2015  enolase  62.12 
 
 		 427 aa  542  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000117332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  61.86 
 
 		 433 aa  543  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  64.03 
 
 		 425 aa  543  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  62.59 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  62.59 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0223  phosphopyruvate hydratase  63.28 
 
 		 437 aa  542  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  61.74 
 
 		 428 aa  542  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>