More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1965 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1965  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 393 aa  797    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2093  aspartate aminotransferase  58.78 
 
 		 393 aa  492  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0580  aspartate aminotransferase  55.98 
 
 		 397 aa  474  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1313  aspartate aminotransferase  55.98 
 
 		 397 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211162 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2600  aspartate aminotransferase  53.08 
 
 		 397 aa  441  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00026488  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1148  aspartate aminotransferase  53.32 
 
 		 395 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000148908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0961  aspartate aminotransferase  52.56 
 
 		 397 aa  430  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.173671 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1888  aspartate aminotransferase  50.51 
 
 		 396 aa  428  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000042706  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3354  aspartate aminotransferase  52.94 
 
 		 396 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3287  aspartate aminotransferase  53.08 
 
 		 397 aa  431  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1061  aspartate aminotransferase  50.51 
 
 		 398 aa  425  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0613658  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1046  aspartate aminotransferase  51.28 
 
 		 398 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2311  aspartate aminotransferase  51.53 
 
 		 398 aa  420  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000726355  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0732  aspartate aminotransferase  50.51 
 
 		 397 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3530  aspartate aminotransferase  53.18 
 
 		 395 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1171  aspartate aminotransferase  47.21 
 
 		 396 aa  378  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2889  aspartate aminotransferase  48.06 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.425013 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0081  aspartate aminotransferase  47.97 
 
 		 395 aa  371  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0248669  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2089  aspartate aminotransferase  46.39 
 
 		 398 aa  363  4e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3303  aspartate aminotransferase  47.34 
 
 		 397 aa  362  8e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.597513  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2140  aspartate aminotransferase  44.7 
 
 		 393 aa  352  7e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2027  aspartate aminotransferase  44.09 
 
 		 396 aa  351  1e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277317  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1103  aspartate aminotransferase  45.04 
 
 		 461 aa  339  5e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01850  aspartate aminotransferase  43.77 
 
 		 395 aa  325  7e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02010  aspartate aminotransferase  42.11 
 
 		 393 aa  318  1e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.951604 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0522  aspartate aminotransferase  40.05 
 
 		 396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.138181  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0565  aspartate aminotransferase  39.59 
 
 		 398 aa  299  5e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0562  aspartate aminotransferase  39.59 
 
 		 398 aa  298  8e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0108  aspartate aminotransferase  39.63 
 
 		 394 aa  294  2e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.301084 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27170  aspartate aminotransferase  38.46 
 
 		 393 aa  291  9e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0186  aspartate aminotransferase  40.36 
 
 		 393 aa  292  9e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0533  aspartate aminotransferase  40.42 
 
 		 400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.865322  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2832  aminotransferase class I and II  32.11 
 
 		 404 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5530  aminotransferase class I and II  31.67 
 
 		 397 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  34.34 
 
 		 377 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  34.34 
 
 		 377 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0897  aspartate aminotransferase  34.31 
 
 		 389 aa  189  5e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0789129  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  32.45 
 
 		 389 aa  187  4e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  32.99 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  32.66 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  31.4 
 
 		 370 aa  182  7e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3157  aminotransferase  30.59 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  31.73 
 
 		 375 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3525  aminotransferase  29.52 
 
 		 403 aa  179  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  31.82 
 
 		 367 aa  177  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  32.59 
 
 		 387 aa  176  5e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  31.58 
 
 		 375 aa  176  9e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  32.99 
 
 		 388 aa  175  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0928  aspartate aminotransferase  33.09 
 
 		 392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436477  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  32.71 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1274  aspartate aminotransferase  32.32 
 
 		 392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.175604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2116  aminotransferase class I and II  30.77 
 
 		 400 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  32.87 
 
 		 385 aa  173  5e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  31.3 
 
 		 375 aa  173  5e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3133  aminotransferase  31.27 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.367697  normal  0.475875 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2206  aminotransferase class I and II  30.29 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  31.08 
 
 		 400 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1731  L-aspartate aminotransferase  30.29 
 
 		 400 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  31.47 
 
 		 375 aa  170  4e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2315  aminotransferase  29.3 
 
 		 389 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  32.61 
 
 		 388 aa  169  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0973  aminotransferase class I and II  29.08 
 
 		 379 aa  169  7e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  29.92 
 
 		 392 aa  168  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1558  aminotransferase class I and II  29.58 
 
 		 389 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3724  aminotransferase class I and II  30.57 
 
 		 404 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.856402  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1633  aminotransferase class I and II  29.3 
 
 		 389 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0513  aminotransferase class I and II  30.68 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548158 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  32.84 
 
 		 397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  31.28 
 
 		 404 aa  167  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0583  aspartate aminotransferase  33.58 
 
 		 388 aa  167  4e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.404967  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  30.49 
 
 		 396 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  32.09 
 
 		 397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  31.93 
 
 		 397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0426  aminotransferase class I and II  32.11 
 
 		 374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  30.54 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1250  aspartate aminotransferase  33.69 
 
 		 389 aa  165  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000188564  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  31.65 
 
 		 396 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  31.2 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  31.07 
 
 		 396 aa  164  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  31.72 
 
 		 397 aa  163  6e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  31.71 
 
 		 373 aa  162  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  31.35 
 
 		 380 aa  161  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  30.5 
 
 		 393 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  31.3 
 
 		 402 aa  160  3e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0853  aspartate aminotransferase  32.21 
 
 		 389 aa  159  6e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0056  aspartate aminotransferase  29.66 
 
 		 379 aa  159  8e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  30.79 
 
 		 396 aa  159  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0746  aminotransferase class I and II  31.98 
 
 		 387 aa  158  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000316977  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  30.52 
 
 		 396 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  31.59 
 
 		 379 aa  157  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07471  aminotransferases class-I  32.82 
 
 		 393 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.503554  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  31.88 
 
 		 392 aa  157  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  30.6 
 
 		 396 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  30.6 
 
 		 396 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  30.6 
 
 		 396 aa  157  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  29.27 
 
 		 389 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  30.6 
 
 		 396 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  30.52 
 
 		 396 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  30.6 
 
 		 396 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  32.16 
 
 		 398 aa  156  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>