20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1549 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1549  putative outer membrane protein  100 
 
 		 644 aa  1332    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0233  putative outer membrane protein  63.44 
 
 		 638 aa  844    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317467  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0468  protein of unknown function DUF1565  46.89 
 
 		 653 aa  608  1e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.672167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1881  hypothetical protein  53.18 
 
 		 571 aa  595  1e-168  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000514477  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  31.91 
 
 		 1024 aa  66.6  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0099  hypothetical protein  37.5 
 
 		 520 aa  54.3  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4387  hypothetical protein  37.33 
 
 		 502 aa  51.6  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1882  hypothetical protein  31.25 
 
 		 92 aa  51.2  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000000163845  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  21.01 
 
 		 1206 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  32.35 
 
 		 951 aa  49.7  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3115  hypothetical protein  36.9 
 
 		 368 aa  48.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2876  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.49 
 
 		 512 aa  48.1  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0816  hypothetical protein  20 
 
 		 556 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3111  hypothetical protein  35.71 
 
 		 446 aa  46.2  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0662  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.47 
 
 		 500 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000522571  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  30.77 
 
 		 665 aa  45.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  21.28 
 
 		 1236 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3056  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  34.62 
 
 		 694 aa  45.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1121 aa  44.3  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  33.02 
 
 		 965 aa  43.9  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>