More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1517 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1517  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
335 aa  679    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2836  aspartate carbamoyltransferase  68.85 
 
 
354 aa  414  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917959  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3919  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.78 
 
 
315 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.01 
 
 
315 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.01 
 
 
317 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.01 
 
 
315 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2555  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.23 
 
 
319 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4725  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.78 
 
 
317 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3190  aspartate carbamoyltransferase  64.71 
 
 
319 aa  403  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482997  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  65.69 
 
 
315 aa  403  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1010  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  65.03 
 
 
334 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174033  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3848  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.95 
 
 
316 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0236185 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2282  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  65.47 
 
 
317 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47523  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0936  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  65.46 
 
 
313 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0143291  normal  0.350081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.23 
 
 
316 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0733  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  63.31 
 
 
311 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.6361  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2007  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.82 
 
 
362 aa  394  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3310  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  65.25 
 
 
316 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2424  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  65.81 
 
 
317 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0394509 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2247  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.45 
 
 
317 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.414785 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3028  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  65.81 
 
 
317 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285295  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3527  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  65.18 
 
 
317 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3070  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  63.73 
 
 
319 aa  390  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.87496  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3091  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.9 
 
 
316 aa  388  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559987  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1002  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  63.19 
 
 
320 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.891139  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0223  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  62.87 
 
 
320 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.40055  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2662  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  63.19 
 
 
320 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1391  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.45 
 
 
318 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621598  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0599  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.44 
 
 
322 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0564  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.44 
 
 
322 aa  384  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0602  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.92 
 
 
316 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3666  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.11 
 
 
322 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1299  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  66.11 
 
 
318 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0235362  hitchhiker  0.00573061 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1762  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.44 
 
 
318 aa  381  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1359  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  65.78 
 
 
319 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118486  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1641  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  61.51 
 
 
321 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.452041 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0839  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  63.46 
 
 
321 aa  374  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.111278  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3061  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  61.09 
 
 
341 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.280506  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3902  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  59.87 
 
 
314 aa  368  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.159237  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0924  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  61.11 
 
 
344 aa  353  2e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463158  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  59.87 
 
 
311 aa  347  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1713  aspartate carbamoyltransferase  54.79 
 
 
320 aa  342  5.999999999999999e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  56.31 
 
 
329 aa  341  1e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  56.27 
 
 
302 aa  328  7e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  56.08 
 
 
313 aa  325  5e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0365  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.19 
 
 
324 aa  324  1e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2805  Aspartate carbamoyltransferase  55.93 
 
 
310 aa  324  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0542  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.85 
 
 
334 aa  323  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.686364  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  53.18 
 
 
313 aa  323  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3761  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.85 
 
 
336 aa  323  3e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2582  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.96 
 
 
317 aa  322  5e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.71 
 
 
323 aa  322  6e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3150  aspartate carbamoyltransferase  57.97 
 
 
309 aa  322  7e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  hitchhiker  0.000518906 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.82 
 
 
311 aa  322  8e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1054  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.93 
 
 
313 aa  318  1e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.38137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.49 
 
 
310 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.15 
 
 
310 aa  315  5e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2333  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.81 
 
 
328 aa  315  9e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.993872  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3136  aspartate carbamoyltransferase  55.89 
 
 
306 aa  314  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.604866  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2481  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.97 
 
 
316 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  56.52 
 
 
312 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.46 
 
 
309 aa  312  5.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.7 
 
 
328 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1846  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.04 
 
 
308 aa  310  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258176  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0622  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.28 
 
 
323 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03120  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.84 
 
 
336 aa  309  4e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0295366  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.59 
 
 
318 aa  309  5e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.95 
 
 
323 aa  309  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2102  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.31 
 
 
317 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.95 
 
 
323 aa  308  9e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880032  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1769  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.83 
 
 
311 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0422268  normal  0.117103 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3698  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.92 
 
 
319 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1853  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.04 
 
 
308 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.502816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.82 
 
 
311 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0678  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.95 
 
 
323 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2085  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.16 
 
 
310 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148257  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3005  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.66 
 
 
323 aa  306  4.0000000000000004e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0964  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.33 
 
 
308 aa  305  6e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1475  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.32 
 
 
310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2529  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.67 
 
 
310 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3808  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.65 
 
 
341 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5324  aspartate carbamoyltransferase  50.95 
 
 
326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0708  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.82 
 
 
320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.162015  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0708  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.29 
 
 
323 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5314  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.84 
 
 
334 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.165994  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0871  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.65 
 
 
341 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2521  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.65 
 
 
343 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.191298 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0838  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.65 
 
 
343 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.677096  hitchhiker  0.0028837 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0385  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.65 
 
 
343 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0867  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.65 
 
 
343 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3965  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.65 
 
 
381 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.603902 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2893  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.49 
 
 
320 aa  301  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0482  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.51 
 
 
334 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2913  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.51 
 
 
336 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2660  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.28 
 
 
315 aa  301  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.49 
 
 
320 aa  301  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.503342 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2324  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.99 
 
 
346 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0736648 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5040  aspartate carbamoyltransferase  51.51 
 
 
334 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3167  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.32 
 
 
343 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1465  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.32 
 
 
343 aa  300  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.981882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>