33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3211 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3211  putative integral membrane protein  100 
 
 		 249 aa  505  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  0.0103033 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5922  hypothetical protein  29.27 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235163  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5090  hypothetical protein  30.96 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.496626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1668  hypothetical protein  31.51 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575966  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1721  hypothetical protein  32 
 
 		 224 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00456561  normal  0.931616 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0221  hypothetical protein  22.55 
 
 		 263 aa  86.3  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0032159  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0943  hypothetical protein  25.1 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1357  hypothetical protein  26.43 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.767422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1030  hypothetical protein  23.81 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.275581  normal  0.132673 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1275  hypothetical protein  24.19 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.298884  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0538  hypothetical protein  25.66 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86943  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3176  hypothetical protein  22.49 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.441176  hitchhiker  0.000145856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3012  hypothetical protein  24.58 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0438797  decreased coverage  0.00331074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2997  hypothetical protein  24.58 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.322506  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4120  hypothetical protein  23.27 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3043  hypothetical protein  24.58 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0192  hypothetical protein  26.07 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2097  hypothetical protein  25.61 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.206136 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1148  hypothetical protein  25.1 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1773  hypothetical protein  24.59 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.938201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1837  hypothetical protein  21.55 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2950  hypothetical protein  21.78 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0576  hypothetical protein  22.61 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0714  hypothetical protein  23.87 
 
 		 270 aa  52.4  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.570099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9307  hypothetical protein  24.1 
 
 		 262 aa  52  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0632  hypothetical protein  25 
 
 		 279 aa  50.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.889205 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2130  hypothetical protein  23.51 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.133112 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3349  hypothetical protein  28.99 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4133  hypothetical protein  25.82 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1999  hypothetical protein  25.87 
 
 		 278 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.783842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3391  hypothetical protein  25.37 
 
 		 278 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3303  hypothetical protein  28.85 
 
 		 274 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5841  hypothetical protein  25.62 
 
 		 266 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>