80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1883 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1883  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  787    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2538  hypothetical protein  70.94 
 
 		 382 aa  563  1.0000000000000001e-159  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1872  hypothetical protein  70.18 
 
 		 381 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2247  hypothetical protein  67.02 
 
 		 382 aa  535  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3140  hypothetical protein  51.21 
 
 		 387 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2171  hypothetical protein  50.4 
 
 		 387 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2663  hypothetical protein  50.67 
 
 		 387 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1939  hypothetical protein  50.27 
 
 		 384 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3320  hypothetical protein  50.4 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38990  hypothetical protein  50.13 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.880326  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6102  domain of unknown function DUF1745  39.07 
 
 		 386 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  40.38 
 
 		 386 aa  288  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2230  hypothetical protein  39.57 
 
 		 392 aa  285  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0710  hypothetical protein  39.57 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1924  hypothetical protein  39.3 
 
 		 392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1717  hypothetical protein  39.3 
 
 		 392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0600  hypothetical protein  39.3 
 
 		 392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2313  GfdT protein  39.3 
 
 		 392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1661  hypothetical protein  39.3 
 
 		 384 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2339  domain of unknown function DUF1745  35.97 
 
 		 383 aa  263  6e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2479  hypothetical protein  35.6 
 
 		 379 aa  251  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3518  hypothetical protein  36.68 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.689004 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2675  hypothetical protein  36.57 
 
 		 399 aa  246  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0296571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4193  domain of unknown function DUF1745  35.61 
 
 		 386 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2724  domain of unknown function DUF1745  36.8 
 
 		 374 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43445  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4045  hypothetical protein  36.22 
 
 		 378 aa  242  7.999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0700  hypothetical protein  35.85 
 
 		 380 aa  239  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  0.0832434 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2201  domain of unknown function DUF1745  34.32 
 
 		 398 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3617  hypothetical protein  34.56 
 
 		 378 aa  236  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0308687  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1925  hypothetical protein  34.76 
 
 		 398 aa  236  7e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.795435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1816  protein of unknown function DUF1745  34.47 
 
 		 389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.988519 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2940  hypothetical protein  36.65 
 
 		 402 aa  227  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4519  domain of unknown function DUF1745  34.36 
 
 		 387 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317884  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1139  hypothetical protein  32.78 
 
 		 392 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3953  hypothetical protein  34.43 
 
 		 389 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3668  hypothetical protein  36.73 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432885  hitchhiker  0.00253652 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2592  hypothetical protein  33.89 
 
 		 386 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1250  hypothetical protein  33.89 
 
 		 386 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1527  hypothetical protein  32.58 
 
 		 390 aa  219  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.039182 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2881  hypothetical protein  32.58 
 
 		 390 aa  219  5e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  32.66 
 
 		 385 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1931  hypothetical protein  35.53 
 
 		 385 aa  212  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2353  hypothetical protein  30.81 
 
 		 393 aa  196  7e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.18015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  31.3 
 
 		 460 aa  176  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2474  hypothetical protein  30.54 
 
 		 447 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3551  hypothetical protein  31.32 
 
 		 371 aa  169  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3344  hypothetical protein  31.3 
 
 		 464 aa  162  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2993  hypothetical protein  30.29 
 
 		 368 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.34 
 
 		 669 aa  101  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2083  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.91 
 
 		 647 aa  89  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0223967  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2590  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 675 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182127  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0982  domain of unknown function DUF1745  25.13 
 
 		 666 aa  79.7  0.00000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.505903  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5004  chemotaxis sensory transducer  26.17 
 
 		 672 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.71371 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  22.91 
 
 		 408 aa  76.3  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1866  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.3 
 
 		 650 aa  71.2  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  26.29 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0690  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 		 1186 aa  70.1  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  23.88 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  22.37 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0331  hypothetical protein  24.12 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  23.85 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  24.43 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  22.05 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  22.32 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  22.19 
 
 		 376 aa  57  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  23.62 
 
 		 379 aa  55.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  22.93 
 
 		 402 aa  53.9  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  23.68 
 
 		 1101 aa  53.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  22.34 
 
 		 373 aa  53.1  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  23.46 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  21.81 
 
 		 400 aa  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  26.15 
 
 		 395 aa  49.7  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  23.82 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0696  transcriptional regulator, TrmB  18.41 
 
 		 512 aa  47.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  22.34 
 
 		 389 aa  46.6  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  24 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  21.49 
 
 		 396 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  23.48 
 
 		 934 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  19.11 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1054  hypothetical protein  23.79 
 
 		 405 aa  44.3  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>