264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1285 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1285  DJ-1/PfpI family protein  100 
 
 
357 aa  736    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3438  intracellular protease/amidase-like  45.15 
 
 
366 aa  335  5.999999999999999e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000319638 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2722  putative intracellular protease/amidase-like protein  40.07 
 
 
378 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.268961  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0774  ThiJ/PfpI domain protein  45.95 
 
 
254 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.561024  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0634  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.04 
 
 
258 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6314  ThiJ/PfpI domain protein  39.11 
 
 
230 aa  169  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2067  ThiJ/PfpI domain protein  42.42 
 
 
261 aa  169  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  41.89 
 
 
223 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0621  ThiJ/PfpI domain protein  33.45 
 
 
376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.121561 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2424  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.7 
 
 
232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4294  ThiJ/PfpI domain protein  42.01 
 
 
224 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0479  NonF-related protein  41.44 
 
 
229 aa  164  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0433  ThiJ/PfpI domain protein  39.57 
 
 
230 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  39.45 
 
 
224 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  39.64 
 
 
227 aa  153  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  37.33 
 
 
230 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3240  ThiJ/PfpI domain protein  41.98 
 
 
233 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3360  ThiJ/PfpI domain protein  38.94 
 
 
226 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00683077  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  37.33 
 
 
230 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1020  ThiJ/PfpI domain protein  40.95 
 
 
226 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.276045  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2992  hypothetical protein  36.84 
 
 
273 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.152511  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1995  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.44 
 
 
234 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4591  thiJ/pfpI family protein  35.47 
 
 
229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.526162  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2637  ThiJ/PfpI domain protein  38.46 
 
 
221 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4606  thiJ/pfpI family protein  35.34 
 
 
227 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.62662  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2185  ThiJ/PfpI domain protein  37.33 
 
 
246 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3509  DJ-1/PfpI family protein  36.77 
 
 
270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.962862  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3350  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.6 
 
 
231 aa  146  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.097714  normal  0.411486 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2442  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.61 
 
 
227 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.197595  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.95 
 
 
230 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.95 
 
 
230 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0116  ThiJ/PfpI domain protein  35.65 
 
 
228 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4625  thiJ/pfpI family protein  34.62 
 
 
229 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.904253  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.99 
 
 
228 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4178  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.99 
 
 
228 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0285  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.84 
 
 
225 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000246139 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.95 
 
 
232 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.5 
 
 
230 aa  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.5 
 
 
228 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4222  thiJ/PfpI family protein  34.62 
 
 
229 aa  143  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  37.5 
 
 
230 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0311  ThiJ/PfpI domain protein  36.84 
 
 
232 aa  143  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.0186546 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3926  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.16 
 
 
225 aa  142  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4381  thiJ/pfpI family protein  34.2 
 
 
227 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4720  thiJ/pfpI family protein  34.2 
 
 
227 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.122837  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3190  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.57 
 
 
237 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.687105  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.67 
 
 
225 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226669  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3475  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.53 
 
 
232 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1676  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.48 
 
 
238 aa  141  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.529621  normal  0.596562 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0819  ThiJ/PfpI domain protein  36.65 
 
 
221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3383  ThiJ/PfpI domain protein  34.96 
 
 
225 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29000  hypothetical protein  35.24 
 
 
228 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000723683 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.84 
 
 
227 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4576  thiJ/pfpI family protein  34.2 
 
 
227 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0419  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.05 
 
 
209 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  38.14 
 
 
229 aa  140  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0227  ThiJ/PfpI family protein  34.82 
 
 
235 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4224  thiJ/PfpI family protein  38.99 
 
 
220 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2826  intracellular protease/amidase, putative  37.61 
 
 
227 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0805  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.78 
 
 
225 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10123  ThiJ/PfpI  37.05 
 
 
267 aa  139  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4608  thiJ/pfpI family protein  38.99 
 
 
220 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.65 
 
 
249 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2633  ThiJ/PfpI domain protein  36.6 
 
 
230 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1737  ThiJ/PfpI family protein  36.68 
 
 
228 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276901  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.78 
 
 
224 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0933  ThiJ/PfpI family protein  38.7 
 
 
229 aa  138  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4383  thiJ/pfpI family protein  38.99 
 
 
220 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4722  thiJ/pfpI family protein  38.99 
 
 
220 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.477028  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.11 
 
 
229 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4305  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.62 
 
 
231 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377734  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0093  ThiJ/PfpI  36.05 
 
 
231 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5032  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.62 
 
 
237 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.848966 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4593  thiJ/pfpI family protein  38.99 
 
 
220 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1577  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.84 
 
 
235 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5679  ThiJ/PfpI  31.75 
 
 
260 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6043  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.75 
 
 
260 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0569087 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4627  thiJ/pfpI family protein  38.99 
 
 
220 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1353  ThiJ/PfpI family protein  37.05 
 
 
225 aa  136  7.000000000000001e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2295  ThiJ/PfpI domain protein  36.48 
 
 
230 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159862  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1380  ThiJ/PfpI domain protein  35.68 
 
 
257 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0627  thiJ/pfpI family protein  38.07 
 
 
219 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1011  ThiJ/PfpI  36.61 
 
 
225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3545  ThiJ/PfpI family protein  36.44 
 
 
225 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.809418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4578  thiJ/pfpI family protein  38.53 
 
 
220 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0431  ThiJ/PfpI domain protein  35.56 
 
 
227 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0745  Fis family transcriptional regulator  34.07 
 
 
226 aa  134  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201506  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4210  ThiJ/PfpI domain protein  35.56 
 
 
225 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.414893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0419  ThiJ/PfpI  37.23 
 
 
234 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0948  ThiJ/PfpI domain protein  32.92 
 
 
267 aa  133  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.223812  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4110  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.11 
 
 
227 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9266  predicted protein  35.24 
 
 
224 aa  132  9e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774425  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7474  ThiJ/PfpI family protein  33.62 
 
 
227 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0629  thiJ/pfpI family protein  38.51 
 
 
166 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.2762  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3997  hypothetical protein  35.68 
 
 
228 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0819  ThiJ/PfpI domain protein  36.62 
 
 
230 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1386  ThiJ/PfpI  35.09 
 
 
226 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.694621  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1352  ThiJ/PfpI domain protein  33.78 
 
 
225 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00734  DJ-1/PfpI family protein  32.13 
 
 
223 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02417  ThiJ/PfpI family protein  34.68 
 
 
232 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.847717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>