More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0919 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0919  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  379  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1931  GCN5-related N-acetyltransferase  51.34 
 
 
186 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000333496  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2374  GCN5-related N-acetyltransferase  43.39 
 
 
193 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148578  normal  0.427567 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1974  hypothetical protein  42.55 
 
 
188 aa  179  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.252487  normal  0.46439 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1712  GCN5-related N-acetyltransferase  44.26 
 
 
187 aa  168  4e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896279  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02198  GCN5-related N-acetyltransferase  45.06 
 
 
172 aa  164  6.9999999999999995e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2259  GCN5-related N-acetyltransferase  42.02 
 
 
202 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000198313  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5257  acetyltransferase, putative  37.89 
 
 
200 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.727946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0983  hypothetical protein  36.36 
 
 
189 aa  107  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5396  hypothetical protein  35.62 
 
 
187 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2570  GCN5-related N-acetyltransferase  37.27 
 
 
192 aa  105  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.345636  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2749  GCN5-related N-acetyltransferase  31.74 
 
 
207 aa  90.9  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.583104  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2370  GCN5-related N-acetyltransferase  31.11 
 
 
189 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21710  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  31.29 
 
 
185 aa  84.3  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5042  GCN5-related N-acetyltransferase  30.91 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668366  normal  0.445888 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5041  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2013  GCN5-related N-acetyltransferase  30.97 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1795  GCN5-related N-acetyltransferase  31.17 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.116453  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1088  GCN5-related N-acetyltransferase  32.21 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4398  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397365  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4065  acetyltransferase, GNAT family protein  30.72 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811342  normal  0.114074 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1212  hypothetical protein  31.33 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000065025  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4917  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1069  GCN5-related N-acetyltransferase  29.68 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321375  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2792  ribosomal protein N-acetylase-like protein  30.26 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12840  acetyltransferase  28.48 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.70989 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1841  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000324552  normal  0.0183454 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2510  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000402264  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1081  GCN5-related N-acetyltransferase  27.54 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0412368 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2503  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0136  hypothetical protein  32.75 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1637  acetyltransferase  30.67 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1591  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 
174 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00525459  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0757  GCN5-related N-acetyltransferase  29.81 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583099  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
165 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000174029  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  29.87 
 
 
165 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  29.87 
 
 
165 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3943  GCN5-related N-acetyltransferase  30.32 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000968058  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0926  GCN5-related N-acetyltransferase  28.93 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639831  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4294  histone deacetylase family protein  26.51 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1218  hypothetical protein  29.33 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0900  GCN5-related N-acetyltransferase  29.45 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513382  hitchhiker  0.00121698 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1660  GCN5-related N-acetyltransferase  29.68 
 
 
166 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000280495  normal  0.382849 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1808  acetyltransferase  29.87 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1031  acetyltransferase  29.87 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.462594  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1272  acetyltransferase  29.87 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.149301  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1960  acetyltransferase  29.87 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00531041  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  28.29 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3816  peptidase S26A, signal peptidase I  28.67 
 
 
185 aa  67  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000746245  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1787  acetyltransferase  29.87 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.600218  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0135  acetyltransferase  29.87 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1760  acetyltransferase  29.75 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.319622  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1419  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 
180 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 
180 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.845634  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3114  acetyltransferase  26.42 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22757  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1936  acetyltransferase  28.57 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4991  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0659078  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1163  hypothetical protein  27.27 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00311886  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4661  acetyltransferase, GNAT family  26.32 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4439  GCN5-related N-acetyltransferase  26.11 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3442  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.140269  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3398  GCN5-related N-acetyltransferase  27.85 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6663  GCN5-related N-acetyltransferase  27.67 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705865  decreased coverage  0.00424532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0657  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000154743  normal  0.388985 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  26.78 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4775  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110817  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08539  GNAT family acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03650)  28.97 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2264  GCN5-related N-acetyltransferase  27.63 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3711  GNAT family acetyltransferase  26.55 
 
 
195 aa  64.7  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1513  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.667629  hitchhiker  0.000592502 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1537  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 
180 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1057  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 
180 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1733  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.67 
 
 
167 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0110114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2032  GCN5-related N-acetyltransferase  26.29 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4634  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
206 aa  63.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.490299  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1783  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
190 aa  63.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1717  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
180 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00372665 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4677  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 
180 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121511  normal  0.198748 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4730  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
189 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000259757  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3637  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
189 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00282394  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3561  putative acetyltransferase  32.89 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4763  acetyltransferase  28.26 
 
 
178 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000011701  decreased coverage  0.000662492 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  26.49 
 
 
195 aa  62.4  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349296  normal  0.801839 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0502  hypothetical protein  24.12 
 
 
188 aa  62.8  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2810  acetyltransferase  30 
 
 
188 aa  62  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1680  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
173 aa  62  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292432 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3517  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.75 
 
 
167 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0509  GCN5-related N-acetyltransferase  26.78 
 
 
176 aa  62  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1341  acetyltransferase  29.45 
 
 
186 aa  61.6  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1311  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
179 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0373  GCN5-related N-acetyltransferase  27.16 
 
 
187 aa  61.2  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5570  GCN5-related N-acetyltransferase  30.12 
 
 
189 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144352  hitchhiker  0.00667719 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  27.71 
 
 
188 aa  60.5  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1834  acetyltransferase  23.17 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12850  acetyltransferase  25.9 
 
 
192 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.82898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>