More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2097 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
103 aa  200  5e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  1.74433e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
103 aa  200  5e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  66.02 
 
 
114 aa  143  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  66.02 
 
 
103 aa  137  5e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  62.14 
 
 
103 aa  135  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.62091e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  64.08 
 
 
103 aa  135  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  66.67 
 
 
104 aa  132  2e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  63.37 
 
 
103 aa  126  1e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  1.21247e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  55.88 
 
 
104 aa  125  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  64.08 
 
 
102 aa  122  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  1.83343e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  56.31 
 
 
104 aa  122  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  62.14 
 
 
103 aa  121  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  61.39 
 
 
102 aa  119  2e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  5.98947e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  57.28 
 
 
132 aa  119  2e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.0004e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  58.42 
 
 
105 aa  118  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  3.14721e-11  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  61.39 
 
 
146 aa  118  4e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 
104 aa  117  4e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 
104 aa  117  5e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 
104 aa  117  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  1.35569e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 
102 aa  117  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.07252e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  61.17 
 
 
156 aa  117  6e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.1212e-14  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  54.81 
 
 
104 aa  117  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  1.43983e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 
102 aa  116  8e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 
102 aa  115  2e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  5.41425e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 
102 aa  115  2e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.04874e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 
102 aa  115  2e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  5.8928e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 
102 aa  115  2e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 
102 aa  115  2e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  7.92007e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 
102 aa  115  2e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 
102 aa  115  2e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.21763e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 
102 aa  115  2e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.15855e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
102 aa  115  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  3.16052e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  55.88 
 
 
103 aa  114  4e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  5.64167e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
102 aa  112  1e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  2.4347e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
102 aa  112  1e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  6.81834e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
102 aa  112  1e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  2.6821e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 
102 aa  112  2e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.40365e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
102 aa  112  2e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59032e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  54.37 
 
 
104 aa  111  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  1.52954e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  57.43 
 
 
105 aa  111  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  52.43 
 
 
103 aa  110  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 
104 aa  110  6e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
102 aa  109  1e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
104 aa  109  1e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  52.48 
 
 
103 aa  109  1e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 
104 aa  108  2e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  1.69225e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  108  2e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 
102 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.39742e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
102 aa  107  4e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  1.56169e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2653  ribosomal protein L21  59.41 
 
 
102 aa  107  4e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  5.99107e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
102 aa  107  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  2.33925e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0231  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 
104 aa  107  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
102 aa  106  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  1.08547e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  50.49 
 
 
103 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.80256e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  106  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  51.92 
 
 
104 aa  106  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.33447e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  106  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  6.34591e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  105  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  105  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  3.99206e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  50.49 
 
 
103 aa  104  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0997  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 
104 aa  105  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1340  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
102 aa  105  3e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0383215  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  104  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  2.76317e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1538  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
102 aa  104  4e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1416  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
102 aa  104  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  104  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0183  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
102 aa  103  6e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2001  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 
120 aa  103  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536247  normal  0.99837 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
102 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4328  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
138 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.665904 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  102  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  5.83134e-08  unclonable  1.78409e-08 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  6.20592e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  102  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  2.70537e-12  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  53.4 
 
 
103 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
101 aa  102  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
102 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  101  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  48.51 
 
 
131 aa  101  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  52 
 
 
99 aa  101  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  1.07304e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  101  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  101  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  101  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 
104 aa  102  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  2.86753e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  101  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 
102 aa  101  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  6.94207e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  101  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  101  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  49.5 
 
 
102 aa  100  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  1.44419e-06  hitchhiker  2.01625e-07 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  100  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  6.19372e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  1.032e-07  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  100  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  1.78483e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>