More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1190 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1190  ISCpe7, transposase  100 
 
 
137 aa  284  3e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0283879  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0681  ISCpe7, transposase  97.08 
 
 
340 aa  280  7e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0802  ISCpe7, transposase  97.08 
 
 
340 aa  280  7e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0691516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0784  ISCpe7, transposase  97.08 
 
 
340 aa  279  9e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.653929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1537  ISCpe7, transposase  96.35 
 
 
340 aa  277  4e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.10688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1313  ISCpe7, transposase  94.89 
 
 
340 aa  275  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0190357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0982  ISCpe7, transposase  94.89 
 
 
340 aa  275  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  5.45032e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0947  ISCpe7, transposase  94.89 
 
 
340 aa  273  4e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0680749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0930  ISCpe7, transposase  95.62 
 
 
156 aa  273  7e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00303612  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0809  ISCpe7, transposase  94.89 
 
 
340 aa  272  9e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.313897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0634  ISCpe7, transposase  94.89 
 
 
156 aa  271  3e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0755  integrase catalytic subunit  59.42 
 
 
343 aa  172  2e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.47635e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2409  Integrase catalytic region  50.72 
 
 
353 aa  143  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2179  Integrase catalytic region  50.72 
 
 
353 aa  143  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  5.21095e-09  hitchhiker  1.88153e-16 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1912  Integrase catalytic region  50.72 
 
 
353 aa  143  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0037  Integrase catalytic region  50.72 
 
 
353 aa  143  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0243  Integrase catalytic region  50.72 
 
 
353 aa  143  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2243  Integrase catalytic region  50.72 
 
 
353 aa  143  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.781166 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1065  Integrase catalytic region  50.72 
 
 
353 aa  143  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.106559 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1944  Integrase catalytic region  50 
 
 
353 aa  142  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.704589  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2422  Integrase catalytic region  50 
 
 
353 aa  142  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0674  Integrase catalytic region  50 
 
 
353 aa  142  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2640  Integrase catalytic region  50 
 
 
353 aa  142  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1473  ISCpe7, transposase  95.65 
 
 
253 aa  140  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.804077  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1472  hypothetical protein  96.61 
 
 
78 aa  119  2e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.380106  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0170  integrase catalytic subunit  37.96 
 
 
319 aa  84.3  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0337001  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1261  ISCpe7, transposase  31.78 
 
 
316 aa  65.9  2e-10  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  1.18886e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1412  ISCpe7, transposase  31.78 
 
 
316 aa  65.9  2e-10  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  6.18416e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1078  ISCpe7, transposase  31.78 
 
 
316 aa  65.9  2e-10  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  1.01857e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0745  ISCpe7, transposase  31.78 
 
 
316 aa  65.9  2e-10  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  8.15737e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0035  ISCpe7, transposase  31.78 
 
 
316 aa  65.9  2e-10  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.800546  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0315  ISCpe7, transposase  31.78 
 
 
316 aa  65.9  2e-10  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00611234  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0539  transposase  26.85 
 
 
478 aa  64.7  4e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  5.12999e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2050  transposase  26.85 
 
 
478 aa  64.7  4e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  9.63714e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0694  transposase  26.85 
 
 
478 aa  64.7  4e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  2.08331e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0319  transposase  26.85 
 
 
470 aa  64.7  4e-10  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0422  insertion element protein  32.43 
 
 
312 aa  56.6  1e-07  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1196  ISCpe7, transposase  32.43 
 
 
312 aa  56.6  1e-07  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0509  ISCpe7, transposase  32.43 
 
 
312 aa  56.6  1e-07  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0556  ISCpe7, transposase  32.43 
 
 
312 aa  56.6  1e-07  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00138013  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0727  insertion element protein  32.43 
 
 
312 aa  56.6  1e-07  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0030  insertion element protein  32.43 
 
 
312 aa  56.6  1e-07  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  8.55614e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0337  ISCpe7, transposase  32.43 
 
 
312 aa  56.6  1e-07  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.500965  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1581  ISCpe7, transposase  32.43 
 
 
312 aa  56.6  1e-07  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0799  ISCpe7, transposase  32.43 
 
 
312 aa  56.6  1e-07  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0903  ISCpe7, transposase  32.43 
 
 
312 aa  56.6  1e-07  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  5.97662e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1164  ISCpe7, transposase  32.43 
 
 
312 aa  56.6  1e-07  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1361  ISCpe7, transposase  32.43 
 
 
312 aa  56.6  1e-07  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0203024  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0078  ISCpe7, transposase  32.43 
 
 
312 aa  56.6  1e-07  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.516266  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1574  ISCpe7, transposase  32.43 
 
 
312 aa  56.6  1e-07  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  29.6 
 
 
233 aa  55.1  3e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  36.99 
 
 
232 aa  54.3  5e-07  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2277  Integrase catalytic region  29.37 
 
 
272 aa  52.4  2e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  8.68543e-05  normal  0.0420034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3838  Integrase catalytic region  29.37 
 
 
272 aa  52.4  2e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3925  integrase catalytic region  29.37 
 
 
251 aa  52.4  2e-06  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00155278  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2286  Integrase catalytic region  29.37 
 
 
272 aa  52.4  2e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.102637  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0124  Integrase catalytic region  29.37 
 
 
272 aa  52.4  2e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6171  Integrase catalytic region  29.37 
 
 
272 aa  52.4  2e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1369  integrase catalytic subunit  28.78 
 
 
272 aa  50.8  6e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0383  Integrase catalytic region  27.61 
 
 
284 aa  50.1  1e-05  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0288014  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1490  Integrase catalytic region  27.61 
 
 
284 aa  50.1  1e-05  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00848161  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1027  Integrase catalytic region  27.61 
 
 
284 aa  50.1  1e-05  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0069  integrase core subunit  27.97 
 
 
178 aa  49.7  1e-05  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.8827  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0221  Integrase catalytic region  27.61 
 
 
285 aa  50.1  1e-05  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3290  Integrase catalytic region  27.61 
 
 
285 aa  50.1  1e-05  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1155  Integrase catalytic region  27.61 
 
 
284 aa  50.1  1e-05  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.667808  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2945  transposase  30.51 
 
 
237 aa  49.3  2e-05  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2913  transposase  30.51 
 
 
237 aa  49.3  2e-05  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2997  transposase  30.51 
 
 
237 aa  49.3  2e-05  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3017  transposase  30.51 
 
 
237 aa  49.3  2e-05  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3012  transposase  30.51 
 
 
237 aa  49.3  2e-05  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3074  transposase  30.51 
 
 
237 aa  49.3  2e-05  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3086  transposase  30.51 
 
 
237 aa  49.3  2e-05  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0067  integrase catalytic region  26.9 
 
 
251 aa  49.3  2e-05  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0219  integrase catalytic subunit  37.31 
 
 
231 aa  48.5  3e-05  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.465023  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0133  transposase B  27.97 
 
 
269 aa  48.5  3e-05  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.809419  normal  0.0748006 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  27.14 
 
 
283 aa  48.5  3e-05  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2758  integrase catalytic subunit  31.86 
 
 
224 aa  47.8  5e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2808  integrase catalytic region  31.86 
 
 
224 aa  47.8  5e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0988586  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2803  integrase catalytic region  31.86 
 
 
224 aa  47.8  5e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2763  integrase catalytic subunit  31.86 
 
 
224 aa  47.8  5e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.776965  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3665  Integrase catalytic region  27.82 
 
 
305 aa  47.8  5e-05  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  27.35 
 
 
235 aa  47.4  6e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0109  integrase catalytic subunit  29.41 
 
 
273 aa  47.4  7e-05  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2783  integrase catalytic subunit  29.41 
 
 
273 aa  47.4  7e-05  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.983973  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2021  integrase catalytic subunit  29.41 
 
 
273 aa  47.4  7e-05  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2592  integrase catalytic subunit  26.95 
 
 
276 aa  47.4  7e-05  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000687739  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0026  integrase catalytic subunit  31.86 
 
 
224 aa  47  9e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.159143  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2782  integrase catalytic subunit  37.31 
 
 
231 aa  47  9e-05  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0856154  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2526  IS431mec-like transposase  31.86 
 
 
224 aa  47  9e-05  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  2.75342e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0026  integrase catalytic region  31.86 
 
 
224 aa  47  9e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.509582  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0094  integrase core subunit  27.27 
 
 
269 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.445692 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2135  integrase catalytic subunit  25 
 
 
278 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2773  integrase catalytic subunit  25 
 
 
278 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0144895  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4852  integrase catalytic region  25 
 
 
260 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0318827 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  26.81 
 
 
289 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  26.81 
 
 
289 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2012  integrase catalytic subunit  25 
 
 
278 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00348364  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2000  integrase catalytic subunit  25 
 
 
278 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.887951  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1579  IS431mec-like transposase  31.86 
 
 
224 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>