More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1190 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1190  ISCpe7, transposase  100 
 
 		 137 aa  284  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0283879  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0681  ISCpe7, transposase  97.08 
 
 		 340 aa  280  7.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0802  ISCpe7, transposase  97.08 
 
 		 340 aa  280  7.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0691516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0784  ISCpe7, transposase  97.08 
 
 		 340 aa  279  9e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.653929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1537  ISCpe7, transposase  96.35 
 
 		 340 aa  277  4e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.10688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0982  ISCpe7, transposase  94.89 
 
 		 340 aa  275  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1313  ISCpe7, transposase  94.89 
 
 		 340 aa  275  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0190357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0947  ISCpe7, transposase  94.89 
 
 		 340 aa  273  4e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0680749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0930  ISCpe7, transposase  95.62 
 
 		 156 aa  273  7e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00303612  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0809  ISCpe7, transposase  94.89 
 
 		 340 aa  272  9e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.313897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0634  ISCpe7, transposase  94.89 
 
 		 156 aa  271  3e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0755  integrase catalytic subunit  59.42 
 
 		 343 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000147635  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0037  Integrase catalytic region  50.72 
 
 		 353 aa  143  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1065  Integrase catalytic region  50.72 
 
 		 353 aa  143  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.106559 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2409  Integrase catalytic region  50.72 
 
 		 353 aa  143  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2179  Integrase catalytic region  50.72 
 
 		 353 aa  143  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000521095  hitchhiker  1.88153e-16 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0243  Integrase catalytic region  50.72 
 
 		 353 aa  143  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1912  Integrase catalytic region  50.72 
 
 		 353 aa  143  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2243  Integrase catalytic region  50.72 
 
 		 353 aa  143  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.781166 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2640  Integrase catalytic region  50 
 
 		 353 aa  142  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0674  Integrase catalytic region  50 
 
 		 353 aa  142  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1944  Integrase catalytic region  50 
 
 		 353 aa  142  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.704589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2422  Integrase catalytic region  50 
 
 		 353 aa  142  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1473  ISCpe7, transposase  95.65 
 
 		 253 aa  140  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.804077  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1472  hypothetical protein  96.61 
 
 		 78 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.380106  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0170  integrase catalytic subunit  37.96 
 
 		 319 aa  84.3  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0337001  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1078  ISCpe7, transposase  31.78 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000101857  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0745  ISCpe7, transposase  31.78 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000815737  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0315  ISCpe7, transposase  31.78 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00611234  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1261  ISCpe7, transposase  31.78 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118886  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0035  ISCpe7, transposase  31.78 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.800546  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1412  ISCpe7, transposase  31.78 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618416  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0694  transposase  26.85 
 
 		 478 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000208331  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0539  transposase  26.85 
 
 		 478 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000512999  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2050  transposase  26.85 
 
 		 478 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0319  transposase  26.85 
 
 		 470 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1574  ISCpe7, transposase  32.43 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0422  insertion element protein  32.43 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0903  ISCpe7, transposase  32.43 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000597662  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0727  insertion element protein  32.43 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0337  ISCpe7, transposase  32.43 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.500965  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1581  ISCpe7, transposase  32.43 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1164  ISCpe7, transposase  32.43 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0509  ISCpe7, transposase  32.43 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1196  ISCpe7, transposase  32.43 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0799  ISCpe7, transposase  32.43 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0030  insertion element protein  32.43 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000855614  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1361  ISCpe7, transposase  32.43 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0203024  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0078  ISCpe7, transposase  32.43 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.516266  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0556  ISCpe7, transposase  32.43 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00138013  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  29.6 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  36.99 
 
 		 232 aa  54.3  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3925  integrase catalytic region  29.37 
 
 		 251 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00155278  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0124  Integrase catalytic region  29.37 
 
 		 272 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2277  Integrase catalytic region  29.37 
 
 		 272 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000868543  normal  0.0420034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2286  Integrase catalytic region  29.37 
 
 		 272 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.102637  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3838  Integrase catalytic region  29.37 
 
 		 272 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6171  Integrase catalytic region  29.37 
 
 		 272 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1369  integrase catalytic subunit  28.78 
 
 		 272 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1155  Integrase catalytic region  27.61 
 
 		 284 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.667808  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0069  integrase core subunit  27.97 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.8827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0221  Integrase catalytic region  27.61 
 
 		 285 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0383  Integrase catalytic region  27.61 
 
 		 284 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0288014  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1490  Integrase catalytic region  27.61 
 
 		 284 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00848161  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1027  Integrase catalytic region  27.61 
 
 		 284 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3290  Integrase catalytic region  27.61 
 
 		 285 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2945  transposase  30.51 
 
 		 237 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3017  transposase  30.51 
 
 		 237 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3086  transposase  30.51 
 
 		 237 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0067  integrase catalytic region  26.9 
 
 		 251 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3074  transposase  30.51 
 
 		 237 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2913  transposase  30.51 
 
 		 237 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2997  transposase  30.51 
 
 		 237 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3012  transposase  30.51 
 
 		 237 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0133  transposase B  27.97 
 
 		 269 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.809419  normal  0.0748006 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0219  integrase catalytic subunit  37.31 
 
 		 231 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.465023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  27.14 
 
 		 283 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3665  Integrase catalytic region  27.82 
 
 		 305 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2763  integrase catalytic subunit  31.86 
 
 		 224 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.776965  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2758  integrase catalytic subunit  31.86 
 
 		 224 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2803  integrase catalytic region  31.86 
 
 		 224 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2808  integrase catalytic region  31.86 
 
 		 224 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0988586  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  27.35 
 
 		 235 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0109  integrase catalytic subunit  29.41 
 
 		 273 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2021  integrase catalytic subunit  29.41 
 
 		 273 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2783  integrase catalytic subunit  29.41 
 
 		 273 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.983973  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2592  integrase catalytic subunit  26.95 
 
 		 276 aa  47.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000687739  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2526  IS431mec-like transposase  31.86 
 
 		 224 aa  47  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000275342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0026  integrase catalytic region  31.86 
 
 		 224 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.509582  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2782  integrase catalytic subunit  37.31 
 
 		 231 aa  47  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0026  integrase catalytic subunit  31.86 
 
 		 224 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.159143  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0008  IS431mec-like transposase  31.86 
 
 		 224 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297638  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0020  IS431mec-like transposase  31.86 
 
 		 224 aa  47  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0021  truncated IS431mec-like transposase  29.57 
 
 		 208 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0094  integrase core subunit  27.27 
 
 		 269 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.445692 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0539  putative transposase  27.34 
 
 		 293 aa  46.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1993  integrase catalytic subunit  25 
 
 		 278 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2000  integrase catalytic subunit  25 
 
 		 278 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.887951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2012  integrase catalytic subunit  25 
 
 		 278 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00348364  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2135  integrase catalytic subunit  25 
 
 		 278 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>