223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0998 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  100 
 
 		 267 aa  524  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  49.19 
 
 		 273 aa  175  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  46.46 
 
 		 273 aa  174  9e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  33.19 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  29.21 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  40.86 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  42.11 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  45.16 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  32.26 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1107  putative metal-dependent membrane protease  40 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.402277  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0154  abortive infection protein  38.14 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  34.96 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  35.71 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  29.11 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  28.98 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  29.11 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  34.82 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  35.56 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  28.99 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  41.38 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  28.39 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  33.04 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0142  abortive infection protein  38.2 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0827934 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 337 aa  62  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 337 aa  62  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  30.6 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  33.04 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  33.04 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2041  protease, putative  36.84 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00120483  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1829  metal-dependent membrane protease  32.39 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000168416  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  32.69 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0542  metal-dependent membrane protease  31.67 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.67642  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  31.4 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0717  metal-dependent membrane protease  30.19 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1192  abortive infection protein  36.67 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1092  abortive infection protein  39.02 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1283  abortive infection protein  30.34 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237963  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  28.12 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  28.65 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  34.48 
 
 		 527 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  30.53 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  34.48 
 
 		 527 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0659  abortive infection protein  42.39 
 
 		 328 aa  57  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  30.97 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  36 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  34.55 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  29.29 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  34.55 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  30.92 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  34.55 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  30.92 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0055  hypothetical protein  40.2 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  0.0480998 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  34.55 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  35.11 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  33.88 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0563  caax amino protease family  35.92 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000143586  hitchhiker  0.000000000286497 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  34.44 
 
 		 225 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0255  Abortive infection protein  32.73 
 
 		 176 aa  54.7  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4768  abortive infection protein  36.05 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4396  abortive infection protein  35 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4680  caax amino protease family protein  36.11 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24966e-38 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  35 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3105  Abortive infection protein  29.21 
 
 		 432 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.439358  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1024  abortive infection protein  33 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  33.33 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  32.17 
 
 		 528 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0060  abortive infection protein  40.23 
 
 		 192 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3796  abortive infection protein  30.95 
 
 		 602 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4829  abortive infection protein  38.89 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0252  abortive infection protein  34.48 
 
 		 399 aa  53.5  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000621218  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0086  abortive infection protein  31.79 
 
 		 193 aa  53.5  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.49455  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_002950  PG0518  hypothetical protein  28.57 
 
 		 241 aa  53.1  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4461  CAAX amino terminal protease family protein  38.71 
 
 		 242 aa  53.1  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000426946  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  34.55 
 
 		 312 aa  53.1  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4809  caax amino terminal protease family protein  38.71 
 
 		 242 aa  53.1  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00449457  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0845  abortive infection protein  33.09 
 
 		 272 aa  52.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  32.94 
 
 		 234 aa  52.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1735  abortive infection protein  27.21 
 
 		 272 aa  52.4  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  33.57 
 
 		 249 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000029132  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2118  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 240 aa  52.4  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.602781  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1880  abortive infection protein  35.48 
 
 		 279 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  37.33 
 
 		 362 aa  52  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  34.15 
 
 		 538 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5083  CAAX amino terminal protease family protein  34.88 
 
 		 225 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4460  CAAX amino terminal protease family protein  34 
 
 		 236 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581148  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2471  Abortive infection protein  33.71 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4308  CAAX amino terminal protease family protein  26.78 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5091  CAAX amino terminal protease family protein  34.88 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1146  CAAX amino terminal protease family protein  34.72 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4808  caax amino terminal protease family protein  34 
 
 		 236 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000012688  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  35.63 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4679  CAAX amino terminal protease family protein  34 
 
 		 236 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13068e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1018  CAAX amino terminal protease family protein  35.8 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.300686  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0145  caax amino protease family protein  25.36 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353026 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  32.69 
 
 		 448 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0359  Abortive infection protein  31.3 
 
 		 321 aa  50.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0229  Abortive infection protein  31.19 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000154218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0296  CAAX amino terminal protease family protein  31.39 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00879326  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05181  membrane-associated protease  34.12 
 
 		 453 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>