More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2413 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2413  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  100 
 
 
352 aa  727    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208408  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5544  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.77 
 
 
357 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5780  dihydrokaempferol 4-reductase  59.49 
 
 
357 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42555 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5668  dihydrokaempferol 4-reductase  56.98 
 
 
363 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6522  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.55 
 
 
363 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6032  dihydrokaempferol 4-reductase  56.98 
 
 
363 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1666  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.93 
 
 
355 aa  409  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0378933  normal  0.767388 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31257  predicted protein  50.14 
 
 
354 aa  364  1e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.367524  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50500  predicted protein  48.16 
 
 
358 aa  335  7e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.650002  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5234  hypothetical protein  41.12 
 
 
349 aa  286  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.69 
 
 
348 aa  244  9.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.621455 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.72 
 
 
348 aa  242  7.999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.03 
 
 
347 aa  236  3e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.85 
 
 
346 aa  226  4e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1931  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.54 
 
 
349 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.593459  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0547  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  36.83 
 
 
347 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.403557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.44 
 
 
352 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
346 aa  161  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.17 
 
 
346 aa  159  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153396  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.05 
 
 
325 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05977  ketoreductase (AFU_orthologue; AFUA_2G10280)  34.37 
 
 
334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.396271 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3990  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.24 
 
 
351 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80185  CAD family protein  35.89 
 
 
331 aa  151  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.101414  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.95 
 
 
351 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3396  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03540  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  34.62 
 
 
346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.66 
 
 
351 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249443  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03550  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  33.98 
 
 
346 aa  142  7e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0529  dihydrokaempferol 4-reductase  32.43 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 
319 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5514  putative dihydrokaempferol 4-reductase (NAD-dependent epimerase/dehydratase)  32.94 
 
 
340 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0377  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.46 
 
 
341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0387  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.46 
 
 
341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.831837  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34417  hypothetical protein  32.41 
 
 
328 aa  130  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.584917  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.29 
 
 
332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31128  cinnamoyl-Coa reductase  32.65 
 
 
328 aa  127  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_58065  dihydroflavonol-4-reductases  30.31 
 
 
335 aa  127  4.0000000000000003e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72153  NADPH-dependent methylglyoxal reductase GRE2  31.62 
 
 
337 aa  127  4.0000000000000003e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00635585 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.2 
 
 
347 aa  126  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0426426  normal  0.159992 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00765  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02250)  31.08 
 
 
343 aa  123  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03560  dihydrokaempferol 4-reductase, putative  30.92 
 
 
346 aa  122  8e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42452  dihydroflavonol-4-reductases  29.63 
 
 
336 aa  119  6e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56924  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  31.14 
 
 
332 aa  119  6e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.302956 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56762  protein induced by osmotic stress  32.39 
 
 
334 aa  119  7e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.516497  normal  0.0996379 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01830  oxidoreductase, putative  29.43 
 
 
357 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15511  dihydroflavonol-4-reductase  32.41 
 
 
322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.738069  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32463  protein induced by osmotic stress  30.31 
 
 
334 aa  113  5e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.254213  normal  0.336313 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34974  NADPH-dependent Cinnamyl-alcohol dehydrogenase.  30.4 
 
 
336 aa  113  6e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.577054 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.01 
 
 
341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.558578  normal  0.0371472 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36555  Cinnamyl-alcohol dehydrogenase Flavonol reductase/cinnamoyl-CoA reductase  30.14 
 
 
339 aa  110  5e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0121063  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39216  GRE2-like protein  30.48 
 
 
335 aa  106  5e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.239106  hitchhiker  0.00871069 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  29.55 
 
 
329 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  29.55 
 
 
329 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  29.01 
 
 
342 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 
329 aa  99.8  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49223  protein induced by osmotic stress  30.22 
 
 
336 aa  97.8  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.376808 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.24 
 
 
329 aa  96.3  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.88 
 
 
339 aa  95.9  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  25.71 
 
 
340 aa  95.9  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  27.83 
 
 
329 aa  92.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3275  hopanoid-associated sugar epimerase  30.77 
 
 
328 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 
361 aa  90.9  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  29.65 
 
 
329 aa  90.9  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  29.65 
 
 
329 aa  90.9  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.23 
 
 
392 aa  90.5  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.08 
 
 
339 aa  90.1  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  25.21 
 
 
349 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1218  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.93 
 
 
327 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.61 
 
 
331 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 
339 aa  87.8  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.45 
 
 
322 aa  87  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0240  dihydroflavonol 4-reductase family protein  28.49 
 
 
329 aa  86.7  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00224634  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  28.08 
 
 
363 aa  86.7  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  27.5 
 
 
329 aa  86.3  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.14 
 
 
335 aa  85.5  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2290  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.51 
 
 
329 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  30.58 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.09 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.66 
 
 
342 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08583  aldehyde reductase II (AFU_orthologue; AFUA_1G11360)  29.25 
 
 
341 aa  83.6  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.835406  normal  0.302961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.54 
 
 
313 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
331 aa  83.2  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  26.67 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.66 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  29.51 
 
 
338 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1952  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.99 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.755227  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 
358 aa  80.5  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3239  hopanoid-associated sugar epimerase  26.4 
 
 
332 aa  80.1  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  27.1 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  27.14 
 
 
329 aa  78.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.956027  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.06 
 
 
355 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1017  nucleoside diphosphate sugar epimerase family protein  27.46 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.582194  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.733793  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01033  hypothetical protein  35.96 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00365727  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06133  hypothetical protein  35.96 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.112537  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  24.72 
 
 
328 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>