15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0918 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0918  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  627  1e-179  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0020279  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0917  hypothetical protein  57.28 
 
 
303 aa  360  2e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0467358  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4259  hypothetical protein  30.11 
 
 
281 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.183136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5743  hypothetical protein  28.26 
 
 
238 aa  89.7  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5110  hypothetical protein  27.9 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3620  hypothetical protein  27.73 
 
 
359 aa  79  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00523905  normal  0.600946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3409  hypothetical protein  26.38 
 
 
327 aa  78.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.850986 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2403  hypothetical protein  24.81 
 
 
298 aa  77  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0659  hypothetical protein  27.4 
 
 
335 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.237778 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1050  hypothetical protein  26.12 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103943  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3365  hypothetical protein  28.51 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0984  hypothetical protein  29.82 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3621  hypothetical protein  24.35 
 
 
230 aa  57.4  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00670204  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3470  hypothetical protein  29.14 
 
 
311 aa  57  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.172698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0660  hypothetical protein  24.6 
 
 
223 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.213475 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>