More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1538 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1538  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 102 aa  201  3e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1340  50S ribosomal protein L21  86.27 
 
 		 102 aa  174  4e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0383215  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0997  50S ribosomal protein L21  86.14 
 
 		 104 aa  174  4e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1724  50S ribosomal protein L21  84.16 
 
 		 104 aa  169  1e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0089  50S ribosomal protein L21  78.43 
 
 		 102 aa  160  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199465  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0098  50S ribosomal protein L21  78.43 
 
 		 102 aa  160  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0129  50S ribosomal protein L21  78.43 
 
 		 102 aa  160  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0183  50S ribosomal protein L21  78.43 
 
 		 102 aa  160  6e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0502  ribosomal protein L21  72.55 
 
 		 102 aa  150  4e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1416  50S ribosomal protein L21  66.67 
 
 		 102 aa  139  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 102 aa  99.4  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 105 aa  97.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 102 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 102 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 104 aa  96.7  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 102 aa  96.7  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 105 aa  96.7  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  96.7  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  49.51 
 
 		 103 aa  96.7  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  48.54 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 104 aa  94.7  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  48.08 
 
 		 104 aa  94.4  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  49 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 102 aa  92.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  92  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  92  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3652  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  44.66 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3219  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 104 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 102 aa  90.9  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 104 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 104 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1008  50S ribosomal protein L21P  47.52 
 
 		 103 aa  90.9  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  90.5  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 102 aa  90.5  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 104 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  43.14 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 102 aa  90.1  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  90.1  9e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  89.4  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3738  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000915025  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 104 aa  88.2  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 102 aa  88.2  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  46.94 
 
 		 100 aa  88.6  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  88.2  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  88.2  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  87.8  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  87.8  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  48.48 
 
 		 99 aa  87.8  5e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000107304  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>