More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0077 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0077  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 400 aa  810    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0713  putative periplasmic protein  68 
 
 		 395 aa  555  1e-157  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0471  folylpolyglutamate synthase  51.79 
 
 		 391 aa  392  1e-108  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0734  folylpolyglutamate synthase  48.4 
 
 		 389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00291399  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1042  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  45.02 
 
 		 389 aa  326  5e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0635  folC bifunctional protein  45.41 
 
 		 390 aa  325  1e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1231  folC bifunctional protein  44.91 
 
 		 390 aa  322  8e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1106  folC bifunctional protein  44.91 
 
 		 390 aa  322  8e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1569  folylpolyglutamate synthetase  44.86 
 
 		 382 aa  313  4.999999999999999e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1616  FolC bifunctional protein  44.02 
 
 		 383 aa  295  1e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1492  FolC bifunctional protein  29.37 
 
 		 432 aa  149  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.744207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1480  FolC bifunctional protein  29.97 
 
 		 432 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.293616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1427  FolC bifunctional protein  29.13 
 
 		 432 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.361934  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3067  FolC bifunctional protein  28.32 
 
 		 431 aa  137  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  28.88 
 
 		 423 aa  136  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  28.88 
 
 		 423 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0448  folylpolyglutamate synthase / dihydrofolate synthase  33.02 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  28.5 
 
 		 423 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  28.5 
 
 		 423 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  31.31 
 
 		 425 aa  132  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  27.93 
 
 		 423 aa  132  9e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2149  FolC bifunctional protein  27.36 
 
 		 421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.341709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  30.21 
 
 		 434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1558  FolC bifunctional protein  28.86 
 
 		 428 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.330747  normal  0.124911 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2308  FolC bifunctional protein  30.09 
 
 		 442 aa  130  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000091683  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1023  folylpolyglutamate synthetase  28.19 
 
 		 432 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2151  FolC bifunctional protein  28.77 
 
 		 452 aa  130  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1997  FolC bifunctional protein  29.14 
 
 		 436 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.708043 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  30 
 
 		 428 aa  129  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2076  dihydrofolate synthase  32.7 
 
 		 427 aa  129  9.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  31.4 
 
 		 428 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3764  FolC bifunctional protein  29.53 
 
 		 435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0809  FolC bifunctional protein  29.9 
 
 		 423 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0844236 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  30.66 
 
 		 447 aa  127  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2305  FolC bifunctional protein  30.03 
 
 		 430 aa  126  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.639794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2653  FolC bifunctional protein  27.59 
 
 		 422 aa  126  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1531  FolC bifunctional protein  29.88 
 
 		 435 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1487  FolC bifunctional protein  29.41 
 
 		 448 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00152366  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  29.43 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1396  FolC bifunctional protein  28.57 
 
 		 425 aa  125  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06680  putative folylpolyglutamate synthase  30.09 
 
 		 404 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  30.75 
 
 		 436 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  31.08 
 
 		 416 aa  124  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1653  dihydrofolate synthase  27.49 
 
 		 421 aa  123  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0133997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1264  FolC bifunctional protein  30.63 
 
 		 437 aa  123  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  30.5 
 
 		 428 aa  122  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1159  FolC bifunctional protein  27.3 
 
 		 448 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0522  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.17 
 
 		 421 aa  122  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.250389  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  27.23 
 
 		 431 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2622  FolC bifunctional protein  29.87 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132417  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0464  bifunctional protein FolC  27.01 
 
 		 485 aa  122  9.999999999999999e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  28.5 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  32.27 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2714  FolC bifunctional protein  28.76 
 
 		 425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.20841  normal  0.0950332 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.61 
 
 		 427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1739  FolC bifunctional protein  26.7 
 
 		 444 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.281034  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23880  folylpolyglutamate synthetase  28.46 
 
 		 429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.351749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0505  FolC bifunctional protein  26.63 
 
 		 407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.267277  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0218  folylpolyglutamate synthase  27.17 
 
 		 543 aa  121  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.296373  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1532  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  29.34 
 
 		 434 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182883  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  30 
 
 		 440 aa  119  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3331  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  28.92 
 
 		 420 aa  119  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0040495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1695  FolC bifunctional protein  28.87 
 
 		 432 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.382044 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  29.78 
 
 		 431 aa  119  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3814  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  29.6 
 
 		 434 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2983  FolC bifunctional protein  31.04 
 
 		 421 aa  119  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00108921  normal  0.642049 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1883  FolC bifunctional protein  32.55 
 
 		 407 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1899  folylpolyglutamate synthetase  29.74 
 
 		 435 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0715  folylpolyglutamate synthase  30.45 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1166  FolC bifunctional protein  28.45 
 
 		 452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343564  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2797  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  29.82 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0088  FolC bifunctional protein  30.84 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2397  FolC bifunctional protein  27.5 
 
 		 452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0236925  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1423  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  29.08 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  41.01 
 
 		 424 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0358  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  29.08 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3391  FolC bifunctional protein  30.33 
 
 		 450 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3265  cytoplasmic peptidoglycan synthetase C-terminal domain  29.62 
 
 		 448 aa  117  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.165848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  30.5 
 
 		 441 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47685  predicted protein  29.58 
 
 		 598 aa  117  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.54676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7286  FolC bifunctional protein  28.28 
 
 		 440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0401599  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  29.08 
 
 		 408 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1665  folylpolyglutamate synthetase  32.29 
 
 		 434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.157637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0806  FolC bifunctional protein  28.29 
 
 		 425 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1685  FolC bifunctional protein  31.14 
 
 		 437 aa  117  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2045  FolC bifunctional protein  30.54 
 
 		 418 aa  116  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0860305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0333  FolC bifunctional protein  30.25 
 
 		 414 aa  116  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0256813  normal  0.0230172 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  28.53 
 
 		 424 aa  116  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  30.15 
 
 		 429 aa  116  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1295  hypothetical protein  26.9 
 
 		 428 aa  116  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  29.23 
 
 		 444 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  29.94 
 
 		 422 aa  116  8.999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2353  FolC bifunctional protein  29.45 
 
 		 430 aa  116  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167549  normal  0.0264715 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  30.39 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1968  FolC bifunctional protein  30.41 
 
 		 428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.843796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  29.33 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0958  dihydrofolate synthase  26.87 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.245953  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  28.71 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1053  FolC bifunctional protein  26.87 
 
 		 416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3058  FolC bifunctional protein  28.01 
 
 		 435 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>