More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05255 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05255  phenylacetic acid degradation protein  100 
 
 		 204 aa  423  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.524726  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1555  phenyl acetic acid degradation protein  59.38 
 
 		 205 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0225  regulatory PhaM protein  51.65 
 
 		 199 aa  207  8e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.436924 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2406  phenylacetic acid degradation protein PaaY  49.45 
 
 		 208 aa  202  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.572897 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1586  phenylacetic acid degradation protein PaaY  48.63 
 
 		 196 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3084  phenylacetic acid degradation protein PaaY  47.54 
 
 		 198 aa  198  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.264252 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2245  phenylacetic acid degradation protein PaaY  49.18 
 
 		 196 aa  197  7e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.3221  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1487  phenylacetic acid degradation protein PaaY  48.63 
 
 		 196 aa  197  9e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2255  phenylacetic acid degradation protein PaaY  48.63 
 
 		 196 aa  197  9e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.438675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1239  phenylacetic acid degradation protein PaaY  48.35 
 
 		 200 aa  194  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0039  carnitine operon protein CaiE  46.74 
 
 		 196 aa  193  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3564  transferase hexapeptide repeat containing protein  46.74 
 
 		 196 aa  193  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3620  carnitine operon protein CaiE  46.2 
 
 		 196 aa  192  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.29388 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0037  carnitine operon protein CaiE  46.74 
 
 		 196 aa  192  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0036  carnitine operon protein CaiE  46.2 
 
 		 196 aa  192  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0039  carnitine operon protein CaiE  46.74 
 
 		 196 aa  192  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0385  phenylacetic acid degradation protein PaaY  45.41 
 
 		 203 aa  191  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00144851  normal  0.0147726 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0076  carnitine operon protein CaiE  47.25 
 
 		 198 aa  191  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0077  carnitine operon protein CaiE  47.25 
 
 		 198 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.81711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0073  carnitine operon protein CaiE  47.25 
 
 		 198 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0073  carnitine operon protein CaiE  47.25 
 
 		 198 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0662  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  50.83 
 
 		 196 aa  191  7e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3223  carnitine operon protein CaiE  47.25 
 
 		 196 aa  190  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0983  transferase  44.5 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2624  phenylacetic acid degradation protein PaaY  46.49 
 
 		 199 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0766069 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0075  carnitine operon protein CaiE  47.25 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.903191 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00039  predicted acyl transferase  46.2 
 
 		 196 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00038  hypothetical protein  46.2 
 
 		 196 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1515  phenylacetic acid degradation protein PaaY  43.22 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2474  phenylacetic acid degradation protein PaaY  44.32 
 
 		 199 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29781  normal  0.884241 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3285  phenylacetic acid degradation protein PaaY  44.86 
 
 		 199 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3102  regulatory PhaM protein  45.11 
 
 		 195 aa  184  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0237996  decreased coverage  0.0000286211 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2998  phenylacetic acid degradation protein PaaY  45.65 
 
 		 202 aa  184  7e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2611  phenylacetic acid degradation protein PaaY  44.32 
 
 		 199 aa  184  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.178031  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1467  carbonic anhydrase  44.19 
 
 		 175 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0618569  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4032  carnitine operon protein CaiE  40.66 
 
 		 222 aa  164  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4358  hexapaptide repeat-containing transferase  44.38 
 
 		 171 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3897  carbonic anhydrase  42.44 
 
 		 176 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0917  hexapaptide repeat-containing transferase  40.88 
 
 		 175 aa  138  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000456928  normal  0.0606057 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1461  carbonic anhydrase  42.57 
 
 		 185 aa  124  9e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000178452  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2851  hypothetical protein  34.91 
 
 		 173 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2773  hypothetical protein  41.1 
 
 		 172 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000332346  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1069  hypothetical protein  41.46 
 
 		 173 aa  122  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0370  transferase family protein  39.73 
 
 		 170 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3431  putative acetyltransferase/acyltransferase  40 
 
 		 170 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0660  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.84 
 
 		 182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4870  transferase family protein  39.73 
 
 		 170 aa  118  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4905  transferase family protein  39.04 
 
 		 170 aa  118  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4655  transferase family protein  39.04 
 
 		 170 aa  118  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4511  transferase; acetyltransferase/acyltransferase  39.04 
 
 		 170 aa  118  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5010  transferase family protein  39.04 
 
 		 170 aa  118  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4879  transferase family protein  39.04 
 
 		 170 aa  118  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0598  hexapaptide repeat-containing transferase  37.14 
 
 		 171 aa  118  7e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.815519  hitchhiker  0.000000000000309138 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4587  acetyltransferase/acyltransferase  39.73 
 
 		 170 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  31.58 
 
 		 175 aa  117  9e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4493  transferase; acetyltransferase/acyltransferase  38.36 
 
 		 170 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4896  transferase family protein  38.36 
 
 		 170 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.58 
 
 		 166 aa  116  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1203  putative regulator  34.87 
 
 		 175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00319738  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1187  siderophore binding protein  34.94 
 
 		 172 aa  111  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2121  hexapaptide repeat-containing transferase  36.9 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105256 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0023  hypothetical protein  38.12 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.727004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3205  hypothetical protein  35.63 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04630  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  38.89 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.506175  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5974  hexapaptide repeat-containing transferase  35.71 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2103  hexapaptide repeat-containing transferase  35.71 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1171  hexapaptide repeat-containing transferase  36.31 
 
 		 174 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940435  hitchhiker  0.000000671897 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1265  hexapaptide repeat-containing transferase  33.92 
 
 		 173 aa  109  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1111  siderophore binding protein  37.5 
 
 		 173 aa  109  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.791842  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1579  hexapaptide repeat-containing transferase  36.26 
 
 		 175 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2013  hexapaptide repeat-containing transferase  36.31 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858963  hitchhiker  0.00330641 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0624  carbonic anhydrase  36.02 
 
 		 171 aa  108  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000010495  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2140  hexapaptide repeat-containing transferase  36.31 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1260  ferripyochelin-binding protein, putative  33.71 
 
 		 175 aa  108  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164066  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6251  hexapaptide repeat-containing transferase  33.92 
 
 		 194 aa  108  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2707  hexapeptide repeat-containing transferase  36.26 
 
 		 192 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1221  putative ferripyochelin-binding protein  33.71 
 
 		 175 aa  108  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1898  hexapeptide repeat-containing transferase  36.26 
 
 		 174 aa  108  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1133  hypothetical protein  32.56 
 
 		 175 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5409  carbonic anhydrase  35.12 
 
 		 174 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1059  hexapaptide repeat-containing transferase  32.16 
 
 		 174 aa  107  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2573  hexapeptide repeat-containing transferase  36.26 
 
 		 174 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2627  hexapeptide repeat-containing transferase  36.26 
 
 		 174 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0435  hexapaptide repeat-containing transferase  35.14 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2058  transferase hexapeptide repeat  32.56 
 
 		 174 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0961  ferripyochelin binding protein  36.18 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1435  hexapaptide repeat-containing transferase  35.67 
 
 		 174 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1933  ferripyochelin-binding protein  33.14 
 
 		 175 aa  106  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1095  hexapaptide repeat-containing transferase  31.98 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2190  hypothetical protein  36.75 
 
 		 181 aa  105  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0134235  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1562  ferripyochelin binding protein  37.67 
 
 		 172 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2096  hypothetical protein  33.75 
 
 		 173 aa  105  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2918  ferripyochelin binding protein  37.67 
 
 		 172 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1599  acetyltransferase/acyltransferase  36.42 
 
 		 173 aa  105  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4906  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  36.26 
 
 		 196 aa  105  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2439  transferase hexapeptide protein  36.05 
 
 		 172 aa  105  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020264 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0648  ferripyochelin binding protein (fbp)  36.99 
 
 		 168 aa  105  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2189  hexapeptide repeat-containing transferase  35.67 
 
 		 174 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1462  hexapeptide repeat-containing transferase  35.67 
 
 		 174 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3129  hexapeptide repeat-containing transferase  35.67 
 
 		 174 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.316555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>