More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03040 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03040  putative ATP synthase A chain  100 
 
 		 361 aa  723    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1718  ATP synthase F0, A subunit  48.88 
 
 		 355 aa  343  2e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0314608  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  53.05 
 
 		 373 aa  310  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1055  ATP synthase F0, A subunit  50 
 
 		 391 aa  309  5.9999999999999995e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0179  ATP synthase, subunit A (H(+)-transporting two-sector ATPase)  49.86 
 
 		 376 aa  292  8e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.412196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  44.88 
 
 		 373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  47.27 
 
 		 364 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0061  ATP synthase F0 subunit A  42.42 
 
 		 339 aa  246  6e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0311  ATP synthase F0, A subunit  40.12 
 
 		 400 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00150281  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1229  ATP synthase F0, A subunit  41.11 
 
 		 380 aa  203  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.896245 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2098  F0F1 ATP synthase subunit A  47.39 
 
 		 341 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  45.19 
 
 		 345 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2885  F0F1 ATP synthase subunit A  44.35 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677372  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  43.83 
 
 		 342 aa  170  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2502  F0F1 ATP synthase subunit A  46.81 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4487  F0F1 ATP synthase subunit A  39.92 
 
 		 406 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.553444  normal  0.0963007 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2247  F0F1 ATP synthase subunit A  43.63 
 
 		 324 aa  149  7e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.608191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4495  F0F1 ATP synthase subunit A  40.66 
 
 		 384 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4340  F0F1 ATP synthase subunit A  39 
 
 		 381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.35318  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4476  F0F1 ATP synthase subunit A  39 
 
 		 384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  36.51 
 
 		 303 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  34.94 
 
 		 258 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0894  ATP synthase F0 subunit A  35.96 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  32.1 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  36.73 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3922  ATP synthase F0, A subunit  33.76 
 
 		 267 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  31.25 
 
 		 283 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1665  F0F1 ATP synthase subunit A  31.93 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2454  ATP synthase F0, A subunit  35.11 
 
 		 272 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  32.77 
 
 		 241 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09970  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  32.49 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  35.68 
 
 		 247 aa  103  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  33.79 
 
 		 283 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4142  ATP synthase F0, A subunit  31.92 
 
 		 275 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1129  F0F1 ATP synthase subunit A  30.42 
 
 		 270 aa  102  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  31.33 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  33.05 
 
 		 268 aa  99.8  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  33.47 
 
 		 251 aa  99.4  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  30.52 
 
 		 251 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  30.52 
 
 		 251 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1515  ATP synthase F0, A subunit  30.54 
 
 		 248 aa  98.6  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000105454 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  32.76 
 
 		 265 aa  97.1  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1066  ATP synthase F0, A subunit  32.49 
 
 		 261 aa  97.1  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  34.02 
 
 		 263 aa  95.9  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  29.72 
 
 		 251 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  33.82 
 
 		 261 aa  94.7  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  31.94 
 
 		 284 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  37.35 
 
 		 248 aa  95.1  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2119  ATP synthase F0, A subunit  28.15 
 
 		 270 aa  93.6  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00507952  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0170  ATP synthase F0, A subunit  35.56 
 
 		 339 aa  93.6  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.222204  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29610  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  32.64 
 
 		 272 aa  94  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  32.93 
 
 		 285 aa  93.6  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  28.82 
 
 		 251 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0330  ATP synthase F0, A subunit  33.64 
 
 		 280 aa  93.2  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  33.92 
 
 		 265 aa  92.8  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  32.75 
 
 		 261 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  30.13 
 
 		 251 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  32.31 
 
 		 261 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1757  ATP synthase F0, A subunit  34.75 
 
 		 276 aa  90.9  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.731668  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  32.31 
 
 		 247 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  27.71 
 
 		 251 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3636  ATP synthase F0, A subunit  31.51 
 
 		 259 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1301  ATP synthase F0, A subunit  29.82 
 
 		 282 aa  86.7  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2611  F0F1 ATP synthase subunit A  32.05 
 
 		 266 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.183518  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2344  F0F1 ATP synthase subunit A  33.19 
 
 		 266 aa  86.7  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801138 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  31.86 
 
 		 243 aa  86.7  6e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  29.82 
 
 		 247 aa  86.3  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  28.57 
 
 		 260 aa  86.3  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  30.13 
 
 		 247 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  32.22 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1264  ATP synthase F0, A subunit  28.27 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0142  ATP synthase F0, A subunit  30.29 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4624  ATP synthase F0, A subunit  29.96 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  31.8 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  29.09 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  33.18 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2312  F0F1 ATP synthase subunit A  29.71 
 
 		 259 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  30 
 
 		 243 aa  82  0.00000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  32.61 
 
 		 250 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08120  F0F1 ATP synthase subunit A  30.59 
 
 		 266 aa  82  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.823185  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  30.7 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4483  F0F1 ATP synthase subunit A  31.98 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  29.39 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11331  F0F1 ATP synthase subunit A  30.91 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  29.06 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  29.31 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4334  F0F1 ATP synthase subunit A  31.82 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442286  normal  0.0425099 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3868  F0F1 ATP synthase subunit A  32.33 
 
 		 251 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal  0.0791726 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3882  F0F1 ATP synthase subunit A  32.33 
 
 		 251 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3956  F0F1 ATP synthase subunit A  32.33 
 
 		 251 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0660881 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  29.91 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  29.49 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  29.91 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2594  F0F1 ATP synthase subunit A  32.53 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546841 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  29.41 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0512  ATP synthase F0, A subunit  25.36 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2879  F0F1 ATP synthase subunit A  36.13 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.775771  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  28.38 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3972  F0F1 ATP synthase subunit A  30.04 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000792431  normal  0.307895 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4051  F0F1 ATP synthase subunit A  29.63 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>