80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2170 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2170  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 		 350 aa  711    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0154  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  93.14 
 
 		 350 aa  652    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3603  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  82.29 
 
 		 350 aa  590  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4137  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  75.64 
 
 		 341 aa  534  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1244  ABC transporter substrate binding protein  80.94 
 
 		 343 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.803249  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6588  ABC transporter substrate binding protein  80.94 
 
 		 343 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6192  ABC transporter substrate binding protein  80.94 
 
 		 343 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6250  ABC transporter substrate binding protein  79.75 
 
 		 351 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6535  ABC transporter substrate binding protein  81.15 
 
 		 351 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6049  ABC transporter substrate binding protein  79.87 
 
 		 351 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2032  ABC transporter substrate binding protein  76.28 
 
 		 348 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596707  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0818  ABC transporter substrate binding protein  76.28 
 
 		 348 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106898  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1878  ABC transporter substrate binding protein  76.28 
 
 		 348 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1866  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  76.28 
 
 		 348 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.346438  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0343  ABC transporter substrate-binding protein  76.28 
 
 		 348 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.658815  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1687  ABC transporter substrate binding protein  76.28 
 
 		 348 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.4152  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0512  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  67.34 
 
 		 366 aa  490  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2677  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  68.51 
 
 		 343 aa  487  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0138  NLPA lipoprotein  68.24 
 
 		 341 aa  478  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2486  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  68.03 
 
 		 345 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00383664  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5057  ABC transporter, periplasmic binding protein  66.47 
 
 		 339 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34770  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  67.95 
 
 		 340 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.429191  normal  0.0167014 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0170  ABC transporter, periplasmic binding protein  66.18 
 
 		 339 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3450  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  69.03 
 
 		 343 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302208  hitchhiker  0.000774086 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0191  ABC transporter periplasmic-binding protein  65.88 
 
 		 339 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0189  ABC transporter, periplasmic binding protein  65.88 
 
 		 339 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.366153 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30920  ABC transporter, periplasmic binding protein  67.73 
 
 		 343 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0340  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  53.64 
 
 		 339 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5195  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  53.8 
 
 		 339 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2205  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  55.91 
 
 		 337 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1388  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  54.43 
 
 		 317 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1797  ABC transporter periplasmic binding protein  51.16 
 
 		 340 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4888  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  53.35 
 
 		 332 aa  371  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.962716  normal  0.144986 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1399  ABC transporter periplasmic binding protein  50.57 
 
 		 341 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30880  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  52.58 
 
 		 339 aa  363  3e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3455  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  52.29 
 
 		 347 aa  358  7e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1299  ABC transporter periplasmic binding protein  54.63 
 
 		 362 aa  355  8.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1728  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  44.01 
 
 		 333 aa  279  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3152  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.75 
 
 		 335 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5990  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.37 
 
 		 341 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.626097 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4505  NLPA lipoprotein  43.67 
 
 		 342 aa  269  5.9999999999999995e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.826664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3889  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.75 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  0.125658 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1120  ABC transporter, periplasmic binding protein  41.32 
 
 		 334 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4122  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  43.35 
 
 		 342 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4009  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  43.35 
 
 		 342 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368962  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03032  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  43.27 
 
 		 346 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.08661 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5982  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.9 
 
 		 334 aa  246  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.475529  normal  0.473207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0054  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  37.42 
 
 		 338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0054  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  37.93 
 
 		 338 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.940543  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6690  putative periplasmic substrate-binding subunit (ABC transporter)  39.2 
 
 		 338 aa  239  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3888  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  38.41 
 
 		 330 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3151  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  38.41 
 
 		 330 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5060  ABC transporter substrate-binding protein  38.08 
 
 		 327 aa  232  6e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6244  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  38.39 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0536  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  38.19 
 
 		 342 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00532956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1606  NLPA lipoprotein  38.33 
 
 		 346 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000297803 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2525  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  36.16 
 
 		 338 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74884  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3590  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  35 
 
 		 341 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3259  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  36.22 
 
 		 336 aa  193  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3930  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  35 
 
 		 341 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5326  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  36 
 
 		 338 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3496  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  35.67 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0231638 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  27.64 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5095  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  30 
 
 		 119 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.296668  normal  0.288347 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.27 
 
 		 346 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  28.42 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0409  putative substrate-binding protein of aliphatic sulfonate ABC transporter  20.29 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.830213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0211  sulfate ester transport system substrate-binding protein  28.69 
 
 		 337 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.887162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19360  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulfonates family  25.19 
 
 		 365 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.429227  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1570  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1981  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  22.88 
 
 		 335 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2622  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  22.73 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000404129  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5012  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  27.31 
 
 		 369 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0114898  normal  0.178041 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  23.28 
 
 		 311 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2312  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  23.01 
 
 		 328 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.355114  hitchhiker  0.0000000431055 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3256  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  30 
 
 		 383 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117955 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0145  NMT1/THI5 like domain protein  29.41 
 
 		 335 aa  42.7  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5004  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.8 
 
 		 347 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1433  putative sulfate ester transporter, periplasmic binding component  25.75 
 
 		 381 aa  42.7  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748329  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  26.49 
 
 		 349 aa  42.7  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.778479 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>