More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2809 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2809  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 164 aa  330  5e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  78.53 
 
 		 173 aa  259  8e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  73.91 
 
 		 168 aa  245  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2134  transcriptional regulator, AsnC family  73.86 
 
 		 165 aa  239  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 170 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 170 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 153 aa  111  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  46.88 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0128  transcription regulator protein  41.06 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  41.1 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.01 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 156 aa  106  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 162 aa  103  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  41.35 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.07 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 		 152 aa  98.2  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 153 aa  98.2  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1625  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 148 aa  98.2  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 148 aa  97.8  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  41.79 
 
 		 150 aa  97.4  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  41.79 
 
 		 150 aa  97.4  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  32.09 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3532  AsnC/Lrp family regulatory protein  40.74 
 
 		 187 aa  96.7  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0270  transcriptional regulator, AsnC family  37.04 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6058  transcriptional regulator, AsnC family  40.3 
 
 		 158 aa  95.5  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 162 aa  95.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 163 aa  95.5  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 163 aa  95.5  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4570  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.42 
 
 		 151 aa  94.4  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  0.0415278 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  37.41 
 
 		 155 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0129  transcriptional regulator, AsnC family  39.1 
 
 		 159 aa  94  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  38.57 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  38.57 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 151 aa  93.6  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  36.73 
 
 		 151 aa  92.8  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  40.15 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 145 aa  92.8  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 163 aa  92.8  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 144 aa  92.4  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 153 aa  90.9  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 149 aa  90.5  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 160 aa  90.5  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6249  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.64 
 
 		 141 aa  90.1  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  0.0293098 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  35.1 
 
 		 158 aa  89  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2300  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 145 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0611064  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  34.78 
 
 		 145 aa  88.6  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 156 aa  87.4  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  41.96 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  36.73 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 145 aa  87  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 150 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  35.82 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  33.58 
 
 		 155 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  33.58 
 
 		 155 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  40.83 
 
 		 152 aa  84.7  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1084  AsnC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 150 aa  84  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6313  AsnC family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0309  transcription regulator AsnC  36.57 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 145 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  35.25 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1625  AsnC family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2838  AsnC family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.12042  normal  0.0436846 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1733  AsnC family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  34.9 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2042  transcriptional regulator, AsnC family  29.08 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.600199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  32.84 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1479  AsnC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2980  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1285  AsnC family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.026588  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  34.46 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  32.84 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3205  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00222041  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1521  transcriptional regulator, AsnC family  32.84 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2984  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 163 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2349  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 163 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2928  AsnC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1452  transcriptional regulator, AsnC family  32.84 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.281827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>