48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2304 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2304  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 277 aa  579  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.462122 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  38.01 
 
 		 274 aa  189  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.82 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.97 
 
 		 259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11532  hypothetical protein  25.91 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.547495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5239  hypothetical protein  27.73 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.611643 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0445  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.94 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  25.93 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.39 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2409  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.13 
 
 		 230 aa  57  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41990  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.33 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.37 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.51 
 
 		 285 aa  50.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3154  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.96 
 
 		 302 aa  49.7  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0588837  normal  0.0946962 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  23.11 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.33 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.05 
 
 		 292 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21 
 
 		 394 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1305  hypothetical protein  30.99 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96448 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.55 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0110  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.22 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.806567 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7153  hypothetical protein  28.05 
 
 		 304 aa  46.2  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.72 
 
 		 315 aa  46.2  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.42 
 
 		 300 aa  46.2  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.85 
 
 		 257 aa  45.8  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  20.5 
 
 		 394 aa  45.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  24.67 
 
 		 281 aa  45.8  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1417  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.71 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0247  phytanoyl-CoA dioxygenase  20.19 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.77 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2677  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.09 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.96 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  24.3 
 
 		 300 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3596  hypothetical protein  20.8 
 
 		 238 aa  43.9  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.07 
 
 		 293 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2807  hypothetical protein  22.88 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00870169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.94 
 
 		 292 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.94 
 
 		 292 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13664  hypothetical protein  24.81 
 
 		 291 aa  43.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0231349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.73 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3316  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  27.36 
 
 		 545 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1994  phytanoyl-CoA dioxygenase  24 
 
 		 259 aa  42.7  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.05 
 
 		 257 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5728  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.69 
 
 		 287 aa  42.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.73 
 
 		 257 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.89 
 
 		 257 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.05 
 
 		 257 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3672  ectoine hydroxylase  24.5 
 
 		 291 aa  42  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>