23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4688 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4570  hypothetical protein  42.21 
 
 
856 aa  653    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4688  hypothetical protein  100 
 
 
836 aa  1718    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000356334  unclonable  0.00000000000739764 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3973  hypothetical protein  39.19 
 
 
822 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.642221  normal  0.635484 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4439  hypothetical protein  36.08 
 
 
822 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0317  hypothetical protein  27.24 
 
 
841 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0205782  hitchhiker  0.00830158 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00250  predicted aromatic compound dioxygenase  26.85 
 
 
841 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00253  hypothetical protein  26.85 
 
 
841 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0337  hypothetical protein  26.85 
 
 
841 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.365908  normal  0.874038 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0301  hypothetical protein  26.85 
 
 
841 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.974052  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3313  conserved hypothetical protein  26.46 
 
 
841 aa  70.1  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3328  hypothetical protein  26.46 
 
 
841 aa  70.1  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3248  outermembrane fimbrial usher protein  22.42 
 
 
910 aa  68.9  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1504  putative enzyme  23.08 
 
 
840 aa  65.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3387  hypothetical protein  28.03 
 
 
894 aa  58.9  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3563  hypothetical protein  28.79 
 
 
900 aa  58.9  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0605  outer membrane fimbrial user protein  28.79 
 
 
894 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3278  hypothetical protein  28.79 
 
 
900 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.887347  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0215  outermembrane fimbrial usher protein  35.62 
 
 
875 aa  54.7  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0152317 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0347  TcfC protein  33.33 
 
 
895 aa  54.3  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0932799 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0340  hypothetical protein  34.18 
 
 
895 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.638393 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3066  hypothetical protein  21.31 
 
 
809 aa  50.8  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00683748  decreased coverage  0.00952273 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2708  hypothetical protein  26.26 
 
 
977 aa  47  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6645  outermembrane fimbrial usher protein  23.53 
 
 
900 aa  46.6  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000201733 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>