179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3270 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3270  TrkA-N domain protein  100 
 
 
230 aa  462  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.588488  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2747  TrkA-N domain protein  71.69 
 
 
235 aa  328  5.0000000000000004e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0359063  hitchhiker  0.0000719315 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06980  K+ transport system, NAD-binding component  71.56 
 
 
232 aa  326  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0505  TrkA-N domain protein  67.83 
 
 
254 aa  323  1e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0590826 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0428  TrkA-N domain protein  69.37 
 
 
225 aa  319  1.9999999999999998e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24350  K+ transport system, NAD-binding component  60.73 
 
 
221 aa  277  1e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3145  TrkA-N domain protein  59.28 
 
 
228 aa  264  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.436065 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3347  TrkA domain-containing protein  58.01 
 
 
228 aa  263  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18040  K+ transport system, NAD-binding component  61.32 
 
 
225 aa  260  1e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2841  TrkA-N domain protein  54.34 
 
 
222 aa  238  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  0.066626 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0214  TrkA-N  53.3 
 
 
224 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7573  TrkA-N domain protein  50.22 
 
 
224 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2303  putative cation transporter  51.15 
 
 
222 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0523  TrkA-N domain protein  49.55 
 
 
223 aa  215  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24440  K+ transport system, NAD-binding component  52.13 
 
 
222 aa  211  5.999999999999999e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.800738  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1711  TrkA-N domain protein  49.28 
 
 
220 aa  210  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382687  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0796  Trk-type K+ transport systems membrane component  46.67 
 
 
220 aa  209  2e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1513  TrkA-N domain-containing protein  49.77 
 
 
224 aa  209  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36690  K+ transport system, NAD-binding component  46.79 
 
 
224 aa  204  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164115  normal  0.724398 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3574  TrkA domain-containing protein  45.21 
 
 
230 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.458769 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4247  TrkA-N domain protein  48.87 
 
 
225 aa  202  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.61262 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0398  TrkA-N  45.75 
 
 
224 aa  201  7e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81484  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4249  TrkA-N domain protein  45.45 
 
 
213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6144  TrkA-N  44.81 
 
 
220 aa  195  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674267  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0459  TrkA-N domain protein  44.55 
 
 
231 aa  191  9e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.821137  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0372  TrkA domain-containing protein  45.24 
 
 
222 aa  189  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.849541  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0443  TrkA domain-containing protein  44.29 
 
 
222 aa  187  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103493 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14840  K+ transport system, NAD-binding component  39.53 
 
 
229 aa  153  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.289305  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2142  putative potassium uptake protein  37.74 
 
 
221 aa  139  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.897368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1854  potassium uptake protein  37.74 
 
 
221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0461191  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  38.07 
 
 
215 aa  139  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  33.18 
 
 
227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1273  TrkA-N  37.38 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  41.38 
 
 
215 aa  132  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  33.96 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  34.43 
 
 
221 aa  129  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  34.43 
 
 
221 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  34.43 
 
 
221 aa  129  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  34.43 
 
 
221 aa  129  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  34.43 
 
 
221 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  34.43 
 
 
221 aa  129  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  36.06 
 
 
222 aa  128  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  34.43 
 
 
221 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  34.43 
 
 
221 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  34.43 
 
 
221 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  34.43 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  33.96 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  33.96 
 
 
220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  33.96 
 
 
220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 
217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  32.42 
 
 
220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200527  hitchhiker  0.0000000000000167844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3557  TrkA-N domain protein  35.1 
 
 
223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.647516  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  32.08 
 
 
220 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  34.84 
 
 
217 aa  125  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  33.78 
 
 
217 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  35.1 
 
 
222 aa  123  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3465  TrkA-N domain-containing protein  36.22 
 
 
231 aa  122  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  32.63 
 
 
233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2828  TrkA-N domain protein  34.81 
 
 
250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3209  TrkA-N domain protein  35.07 
 
 
231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4804  TrkA-N  35.14 
 
 
231 aa  116  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0249  TrkA-N domain protein  31.75 
 
 
219 aa  115  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0416  TrkA domain-containing protein  30.84 
 
 
217 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000130553  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4052  TrkA-N domain protein  31.16 
 
 
229 aa  114  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4091  TrkA-N domain protein  31.16 
 
 
229 aa  114  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0232188  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  34.07 
 
 
221 aa  114  8.999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  30.91 
 
 
233 aa  112  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1928  TrkA domain-containing protein  32.54 
 
 
223 aa  112  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  32.98 
 
 
232 aa  111  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0122  TrkA-N domain protein  29.13 
 
 
217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00122863  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0012  TrkA-N domain protein  30.99 
 
 
216 aa  109  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  33.01 
 
 
221 aa  108  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1584  TrkA-N  33.15 
 
 
219 aa  105  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0085  K+ transport systems, NAD-binding component  32.02 
 
 
218 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.73294e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0627  TrkA-N domain protein  37.57 
 
 
224 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1631  Trk family potassium uptake protein , putative  32.18 
 
 
223 aa  102  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001288  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  30 
 
 
217 aa  102  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.91889  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0630  TrkA-N domain protein  33.49 
 
 
219 aa  101  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.208337  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0139  TrkA-N domain protein  31.46 
 
 
218 aa  101  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0952  TrkA-N domain protein  32.6 
 
 
217 aa  100  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1585  TrkA-N domain protein  29.58 
 
 
216 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453253  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3550  hypothetical protein  34.81 
 
 
220 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2522  TrkA domain-containing protein  41.13 
 
 
221 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000136868  normal  0.0316786 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0339  TrkA-N domain protein  32.95 
 
 
218 aa  98.2  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00738023  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0750  TrkA domain-containing protein  34.36 
 
 
217 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.803573  normal  0.253071 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0728  TrkA-N domain protein  30.41 
 
 
221 aa  96.3  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.439731  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4040  TrkA-N domain protein  29.86 
 
 
221 aa  95.9  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1353  TrkA-N domain protein  34.48 
 
 
217 aa  95.5  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1793  TrkA-N domain protein  38.71 
 
 
220 aa  93.2  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4281  potassium uptake protein KtrA, putative  29.05 
 
 
214 aa  93.6  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0566  potassium uptake protein TrkA, putative  30 
 
 
218 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0052  TrkA domain-containing protein  32.7 
 
 
232 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000156349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0050  TrkA domain-containing protein  28.44 
 
 
232 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0058  TrkA domain-containing protein  28.44 
 
 
232 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000170567 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1642  hypothetical protein  30.81 
 
 
216 aa  93.2  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0313  TrkA domain-containing protein  30.53 
 
 
230 aa  91.3  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000239618  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4480  TrkA domain-containing protein  29.05 
 
 
217 aa  90.9  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000127966 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1463  TrkA-N domain protein  27.54 
 
 
220 aa  90.5  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00504118  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0047  TrkA domain-containing protein  32.08 
 
 
232 aa  90.1  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004055  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  30.24 
 
 
220 aa  88.6  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.248543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>