More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4123 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  100 
 
 		 153 aa  309  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  98.04 
 
 		 153 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  96.71 
 
 		 153 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  96.71 
 
 		 153 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  96.05 
 
 		 153 aa  300  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  96.05 
 
 		 153 aa  300  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  92.11 
 
 		 153 aa  288  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  84.56 
 
 		 153 aa  261  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  83.22 
 
 		 154 aa  259  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  83.22 
 
 		 154 aa  259  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  83.22 
 
 		 154 aa  259  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  83.22 
 
 		 154 aa  259  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  83.22 
 
 		 154 aa  259  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  83.22 
 
 		 154 aa  259  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  83.22 
 
 		 154 aa  259  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  70.14 
 
 		 147 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  69.44 
 
 		 147 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  68.06 
 
 		 144 aa  207  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  63.89 
 
 		 158 aa  189  8e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  62.76 
 
 		 146 aa  183  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  61.81 
 
 		 145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  61.11 
 
 		 145 aa  180  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  59.03 
 
 		 146 aa  180  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  60.84 
 
 		 146 aa  180  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  58.74 
 
 		 146 aa  178  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  54.86 
 
 		 164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  54.86 
 
 		 163 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  57.75 
 
 		 146 aa  170  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  57.24 
 
 		 149 aa  170  7.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  59.44 
 
 		 145 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  59.44 
 
 		 145 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  58.74 
 
 		 145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  56.64 
 
 		 145 aa  160  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  54.17 
 
 		 143 aa  158  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  54.55 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  53.85 
 
 		 144 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  53.15 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  52.45 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  51.06 
 
 		 141 aa  150  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  47.59 
 
 		 143 aa  147  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  52.82 
 
 		 143 aa  147  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  51.7 
 
 		 147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  52.11 
 
 		 142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  47.62 
 
 		 145 aa  145  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  52.45 
 
 		 146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  48.97 
 
 		 145 aa  144  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2360  CBS  54.55 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00610469  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  49.28 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  48.48 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  49.65 
 
 		 142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  47.95 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  52.54 
 
 		 120 aa  127  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  49.58 
 
 		 142 aa  126  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1756  CBS  44.6 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966462  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  45.21 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01671  CBS domain protein  57.84 
 
 		 104 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  42.07 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  40.69 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  40.68 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  37.32 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1696  CBS domain-containing protein  39.58 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28583  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  40.69 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  36.3 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  37.59 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2880  signal-transduction protein  36.99 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.982708  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  38.03 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0774  putative signal transduction protein with CBS domains  39.16 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  39.16 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  36.73 
 
 		 144 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  39.58 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  38.28 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 170 aa  89  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  36.73 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3078  CBS domain containing protein  31.03 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  40.14 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  32.48 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  39.16 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  38.1 
 
 		 142 aa  87.8  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  40.14 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2961  CBS domain-containing proteins  37.06 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.195076  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  38.46 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  38.1 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  36.81 
 
 		 177 aa  87.4  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  31.39 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1607  signal-transduction protein  37.06 
 
 		 144 aa  87  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0484541 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0777  hypothetical protein  34.01 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  38.17 
 
 		 182 aa  86.7  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  39.58 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1391  CBS domain-containing protein  37.76 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  39.44 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0806  hypothetical protein  34.01 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  36.88 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2670  signal-transduction protein  37.32 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0199897  normal  0.983064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  39.16 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1571  CBS domain-containing protein  35.17 
 
 		 165 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1358  hypothetical protein  34.03 
 
 		 153 aa  84  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512036  normal  0.639451 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2769  CBS domain containing protein  34.03 
 
 		 153 aa  84  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3907  signal-transduction protein  36.62 
 
 		 142 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1990  CBS domain containing protein  36.05 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  38.73 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>