187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3639 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3639  CRP/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  527  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4113  CRP/FNR family transcriptional regulator  98.46 
 
 		 260 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1802  CRP/FNR family transcriptional regulator  87.31 
 
 		 260 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4150  CRP/FNR family transcriptional regulator  87.69 
 
 		 260 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0712018  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3301  CRP/FNR family transcriptional regulator  87.69 
 
 		 260 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4216  CRP/FNR family transcriptional regulator  87.69 
 
 		 260 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.317081 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4389  CRP/FNR family transcriptional regulator  85.77 
 
 		 260 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0045  hypothetical protein  70.59 
 
 		 269 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2194  hypothetical protein  70.59 
 
 		 269 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0645  hypothetical protein  70.59 
 
 		 269 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0659  hypothetical protein  70.59 
 
 		 269 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2513  hypothetical protein  70.59 
 
 		 269 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0821  hypothetical protein  70.59 
 
 		 312 aa  330  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2891  hypothetical protein  70.17 
 
 		 269 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0534  hypothetical protein  70.34 
 
 		 344 aa  329  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5358  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 240 aa  255  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5841  Crp/Fnr family transcriptional regulator  52.36 
 
 		 242 aa  247  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6495  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 267 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.956501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1130  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.74 
 
 		 267 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.71 
 
 		 244 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0359086 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50 
 
 		 244 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2530  Crp/FNR family transcriptional regulator  50 
 
 		 244 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1315  CRP/FNR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 238 aa  228  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0177  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 238 aa  228  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1693  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.3052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1684  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0542  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 239 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.936935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2260  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.88 
 
 		 254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5274  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 239 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5585  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 239 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5104  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.66 
 
 		 243 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5755  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.66 
 
 		 243 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4421  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.66 
 
 		 243 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5290  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.35 
 
 		 239 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420985  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5568  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.35 
 
 		 239 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1115  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 250 aa  219  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.804671  normal  0.524469 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3898  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 239 aa  218  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  46.93 
 
 		 239 aa  218  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1963  CRP/FNR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 246 aa  219  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.555453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1637  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.21 
 
 		 232 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0811489  hitchhiker  0.00000101787 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2723  CRP/FNR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 232 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2740  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 232 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00150781  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1182  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 240 aa  216  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1519  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 239 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3549  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  51.18 
 
 		 239 aa  214  8e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3627  CRP/FNR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 245 aa  214  8e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0520  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.35 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1390  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.32 
 
 		 236 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 247 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0511998 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.88 
 
 		 246 aa  211  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1786  cyclic nucleotide-binding protein  43.1 
 
 		 255 aa  208  6e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.150342  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2551  transcriptional regulator-related protein  43.1 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0397  CRP/FNR family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 244 aa  206  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.934312  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3626  CRP/FNR family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 239 aa  206  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.468145 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3729  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 244 aa  204  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2386  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 268 aa  204  9e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.799782  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0905  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.54 
 
 		 243 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4275  cyclic nucleotide-binding protein  41.38 
 
 		 246 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.38 
 
 		 246 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.157616 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1647  CRP/FNR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 263 aa  202  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2043  cyclic nucleotide-binding  41.84 
 
 		 439 aa  196  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1916  cyclic nucleotide-binding  42.68 
 
 		 274 aa  194  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0876  transcriptional regulator-related protein  40.08 
 
 		 258 aa  191  9e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5269  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 340 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5590  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 242 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5838  cyclic nucleotide-binding  44.49 
 
 		 242 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1680  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 340 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0831  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.29 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.104237  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2036  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411103  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.86 
 
 		 245 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4412  cyclic nucleotide-binding protein  40 
 
 		 234 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2537  transcriptional regulator-related protein  38.39 
 
 		 252 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1803  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.08 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3302  cyclic nucleotide-binding protein  38.49 
 
 		 260 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.896655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4151  cyclic nucleotide-binding protein  38.49 
 
 		 260 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.066887  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4215  cyclic nucleotide-binding protein  38.49 
 
 		 260 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.32687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4411  cyclic nucleotide-binding protein  39.21 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76047 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0678  transcriptional regulator-related protein  40.81 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4390  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 262 aa  159  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.8 
 
 		 279 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5538  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.64 
 
 		 338 aa  158  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.13336 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4409  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1444  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3638  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4112  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21872  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0044  hypothetical protein  36.36 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2890  hypothetical protein  36.36 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2195  hypothetical protein  36.36 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0643  hypothetical protein  36.36 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0657  hypothetical protein  36.36 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2512  hypothetical protein  36.36 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.315481  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4415  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1787  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 232 aa  152  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.22283  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  41.18 
 
 		 247 aa  151  8.999999999999999e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1943  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 258 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.706004  decreased coverage  0.00341057 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2421  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269594  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2550  transcriptional regulator-related protein  36.11 
 
 		 230 aa  148  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0413  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.77 
 
 		 240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>