159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3024 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  92.93 
 
 		 396 aa  734    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6326  hypothetical protein  91.44 
 
 		 397 aa  689    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2363  hypothetical protein  93.69 
 
 		 396 aa  711    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421927  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3024  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  789    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2977  hypothetical protein  93.69 
 
 		 396 aa  711    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  97.73 
 
 		 396 aa  773    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2972  hypothetical protein  90.91 
 
 		 396 aa  678    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  77.33 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  79.55 
 
 		 410 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  77.33 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  76.63 
 
 		 397 aa  598  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  78.54 
 
 		 410 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000710511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  78.54 
 
 		 410 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3057  hypothetical protein  78.54 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.797312  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2036  hypothetical protein  78.54 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0343  hypothetical protein  78.54 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2248  hypothetical protein  78.54 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0330  hypothetical protein  78.28 
 
 		 396 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  60.91 
 
 		 397 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0181  hypothetical protein  63.32 
 
 		 398 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  60.66 
 
 		 397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0224  hypothetical protein  62 
 
 		 400 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  58.38 
 
 		 397 aa  431  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  50.13 
 
 		 386 aa  378  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  52.91 
 
 		 391 aa  360  2e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  50.39 
 
 		 384 aa  357  9.999999999999999e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  48.61 
 
 		 424 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  54.01 
 
 		 358 aa  341  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4140  hypothetical protein  51.03 
 
 		 386 aa  339  5e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  50.26 
 
 		 393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  50.5 
 
 		 404 aa  328  7e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4086  hypothetical protein  51.19 
 
 		 394 aa  326  5e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1711  protein of unknown function DUF185  46.9 
 
 		 395 aa  325  1e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.676361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  49.86 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  46.3 
 
 		 395 aa  319  5e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  47.52 
 
 		 375 aa  318  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1466  hypothetical protein  50.78 
 
 		 369 aa  317  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4224  hypothetical protein  50.78 
 
 		 376 aa  309  5e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203293 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  52.37 
 
 		 368 aa  309  5e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  43.15 
 
 		 393 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  50.13 
 
 		 366 aa  301  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  49.47 
 
 		 362 aa  301  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1251  hypothetical protein  49.86 
 
 		 337 aa  300  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  41.44 
 
 		 370 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  41.44 
 
 		 370 aa  290  3e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  41.35 
 
 		 394 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04309  hypothetical protein  44.47 
 
 		 394 aa  285  7e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954099  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  41.65 
 
 		 417 aa  285  9e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2524  hypothetical protein  44.15 
 
 		 403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  41.39 
 
 		 388 aa  283  4.0000000000000003e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0801  hypothetical protein  44.27 
 
 		 394 aa  279  7e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0712  hypothetical protein  44.59 
 
 		 394 aa  276  5e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  44.04 
 
 		 394 aa  270  4e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  41.92 
 
 		 398 aa  239  6.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3429  protein of unknown function DUF185  41.67 
 
 		 394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192039 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0301  protein of unknown function DUF185  37.4 
 
 		 375 aa  206  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820783 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0130  hypothetical protein  37.57 
 
 		 451 aa  206  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  35.7 
 
 		 393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  30.16 
 
 		 384 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  32.51 
 
 		 386 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  31.12 
 
 		 385 aa  160  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  32.88 
 
 		 394 aa  160  5e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  31.64 
 
 		 404 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0602  protein of unknown function DUF185  33.76 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.758537  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  30.08 
 
 		 387 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  33.62 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  31.89 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  33.06 
 
 		 378 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  28.46 
 
 		 397 aa  149  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  30.75 
 
 		 386 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  32.51 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  32.32 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  31.02 
 
 		 385 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  30.48 
 
 		 385 aa  143  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  32.97 
 
 		 384 aa  137  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07361  hypothetical protein  28.21 
 
 		 396 aa  135  9e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  30.48 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07341  hypothetical protein  27.37 
 
 		 396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07411  hypothetical protein  28.75 
 
 		 400 aa  130  6e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1049  hypothetical protein  30.79 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0950573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0681  hypothetical protein  28.41 
 
 		 396 aa  126  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.954033  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2151  protein of unknown function DUF185  30.09 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510759  normal  0.0912925 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0199  protein of unknown function DUF185  29.81 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15581  hypothetical protein  29.79 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.540295 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07541  hypothetical protein  27.11 
 
 		 396 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0115  hypothetical protein  28.53 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4393  hypothetical protein  26.14 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2988  hypothetical protein  26.8 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4340  hypothetical protein  26.14 
 
 		 368 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4113  hypothetical protein  25.92 
 
 		 370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4001  hypothetical protein  25.99 
 
 		 370 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4280  hypothetical protein  25.5 
 
 		 370 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4162  hypothetical protein  25.5 
 
 		 370 aa  117  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0783755  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4484  hypothetical protein  25.57 
 
 		 368 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.444169  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1529  hypothetical protein  30.06 
 
 		 365 aa  116  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  29.4 
 
 		 375 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1764  hypothetical protein  28.88 
 
 		 375 aa  116  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526416  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1478  hypothetical protein  30.06 
 
 		 365 aa  116  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00590219  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1230  hypothetical protein  33.43 
 
 		 351 aa  116  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.369365  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1638  hypothetical protein  30.95 
 
 		 363 aa  116  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>