More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5598 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 273 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5814  alpha/beta hydrolase fold  98.17 
 
 		 273 aa  541  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.086599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  86.08 
 
 		 273 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  87.41 
 
 		 273 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  87.41 
 
 		 273 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  61.03 
 
 		 272 aa  345  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  61.03 
 
 		 272 aa  344  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  60.29 
 
 		 272 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  58.61 
 
 		 272 aa  335  5e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  58.67 
 
 		 272 aa  334  7e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  57.14 
 
 		 273 aa  333  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  57.14 
 
 		 272 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  54.95 
 
 		 273 aa  316  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  56.99 
 
 		 272 aa  314  8e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  54.41 
 
 		 273 aa  308  8e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  54.38 
 
 		 274 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  52.92 
 
 		 274 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  52.21 
 
 		 273 aa  299  4e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  51.28 
 
 		 273 aa  297  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  54.58 
 
 		 273 aa  296  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  53.48 
 
 		 273 aa  296  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  52 
 
 		 275 aa  295  4e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  52 
 
 		 274 aa  295  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  53.48 
 
 		 340 aa  295  6e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  54.01 
 
 		 334 aa  294  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  52.38 
 
 		 273 aa  292  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  53.48 
 
 		 338 aa  292  5e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  52.21 
 
 		 290 aa  291  6e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  52.77 
 
 		 274 aa  289  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  52.01 
 
 		 273 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  50.18 
 
 		 273 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  51.28 
 
 		 273 aa  287  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  50.37 
 
 		 276 aa  285  4e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  51.46 
 
 		 277 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1992  non-heme chloroperoxidase  53.85 
 
 		 273 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  53.28 
 
 		 317 aa  281  6.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0603  non-heme chloroperoxidase  53.85 
 
 		 273 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  51.46 
 
 		 273 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  49.63 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  47.39 
 
 		 292 aa  281  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  51.1 
 
 		 273 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0694  non-heme chloroperoxidase  53.48 
 
 		 273 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  51.11 
 
 		 273 aa  278  5e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  48.71 
 
 		 272 aa  278  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  49.45 
 
 		 274 aa  277  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  48.53 
 
 		 280 aa  277  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  48.35 
 
 		 275 aa  275  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  50.18 
 
 		 273 aa  275  7e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  49.08 
 
 		 324 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  49.26 
 
 		 277 aa  274  9e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  48.88 
 
 		 297 aa  274  9e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  49.26 
 
 		 277 aa  274  9e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  49.26 
 
 		 277 aa  274  9e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3320  alpha/beta hydrolase fold protein  52 
 
 		 273 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  48.72 
 
 		 324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  49.45 
 
 		 273 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  48.88 
 
 		 322 aa  271  9e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1465  chloride peroxidase  50.18 
 
 		 326 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6363  chloride peroxidase  50.18 
 
 		 326 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.669549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7030  alpha/beta hydrolase fold  50.18 
 
 		 326 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429028  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  46.82 
 
 		 330 aa  269  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  49.08 
 
 		 273 aa  268  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2084  alpha/beta hydrolase fold protein  48.91 
 
 		 275 aa  265  8.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  44.4 
 
 		 297 aa  265  8.999999999999999e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  47.06 
 
 		 273 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6690  alpha/beta hydrolase fold  50.74 
 
 		 328 aa  262  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1113  Chloride peroxidase  45.72 
 
 		 324 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3084  alpha/beta hydrolase fold  54.63 
 
 		 235 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3150  bromoperoxidase  47.21 
 
 		 278 aa  254  8e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.908823  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2461  Alpha/beta hydrolase fold  45.76 
 
 		 272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3914  alpha/beta hydrolase fold protein  44.69 
 
 		 273 aa  253  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.732284  normal  0.454673 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  47.06 
 
 		 286 aa  251  7e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2363  alpha/beta hydrolase fold  45.26 
 
 		 328 aa  251  8.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329927 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2090  bromoperoxidase  47.92 
 
 		 278 aa  250  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3158  bromoperoxidase  46.97 
 
 		 278 aa  249  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00429075  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  46.77 
 
 		 281 aa  248  9e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2941  bromoperoxidase  46.21 
 
 		 278 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2915  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  46.21 
 
 		 278 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3165  bromoperoxidase  46.21 
 
 		 278 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0230592  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  46.39 
 
 		 278 aa  248  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3173  bromoperoxidase  46.21 
 
 		 278 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  45.49 
 
 		 277 aa  243  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  47.57 
 
 		 290 aa  241  7e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  43.87 
 
 		 278 aa  241  1e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4668  non-heme chloroperoxidase  46.49 
 
 		 276 aa  240  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  47.01 
 
 		 279 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  44.69 
 
 		 343 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5825  alpha/beta hydrolase fold  44.73 
 
 		 276 aa  236  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0224159  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  47.01 
 
 		 279 aa  236  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  43.91 
 
 		 276 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  43.07 
 
 		 276 aa  236  3e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1889  non-heme chloroperoxidase  43.8 
 
 		 274 aa  235  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5750  alpha/beta hydrolase fold  44.36 
 
 		 278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4420  alpha/beta hydrolase fold  43.07 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3146  alpha/beta hydrolase fold  42.55 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  44.12 
 
 		 274 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  44.12 
 
 		 274 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  43.75 
 
 		 274 aa  228  7e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  41.54 
 
 		 271 aa  228  7e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3581  Alpha/beta hydrolase  41.39 
 
 		 273 aa  227  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>