64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0011 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0739  hypothetical protein  67.73 
 
 		 496 aa  665    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25742  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0011  hypothetical protein  100 
 
 		 484 aa  1003    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0171  sulfurtransferase DndC  51.8 
 
 		 507 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2474  hypothetical protein  48.31 
 
 		 551 aa  432  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.671413  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2209  hypothetical protein  52.48 
 
 		 566 aa  404  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2401  hypothetical protein  48.51 
 
 		 528 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4840  hypothetical protein  53.66 
 
 		 541 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.567316 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2458  hypothetical protein  47.43 
 
 		 538 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1932  hypothetical protein  50.9 
 
 		 518 aa  401  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230474  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0359  hypothetical protein  44.25 
 
 		 487 aa  382  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.296452  normal  0.0315828 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1368  hypothetical protein  42.61 
 
 		 486 aa  359  5e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4572  hypothetical protein  42.5 
 
 		 495 aa  352  7e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00813276  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2306  hypothetical protein  36.83 
 
 		 588 aa  307  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.816445  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0471  hypothetical protein  35.23 
 
 		 544 aa  282  9e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.565409  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0833  hypothetical protein  41.67 
 
 		 522 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.44 
 
 		 378 aa  243  5e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2950  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase  36.97 
 
 		 391 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000917196  normal  0.689261 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1300  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.33 
 
 		 342 aa  174  5e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2353  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.57 
 
 		 335 aa  150  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0038  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  31.43 
 
 		 590 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000866534 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0104  hypothetical protein  31.43 
 
 		 600 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149062  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0061  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  31.43 
 
 		 310 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0021  hypothetical protein  29.51 
 
 		 663 aa  134  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4980  hypothetical protein  31.53 
 
 		 604 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.519167  hitchhiker  0.00845932 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1053  hypothetical protein  30.11 
 
 		 574 aa  101  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0944363  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0129  hypothetical protein  28.21 
 
 		 817 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0317  hypothetical protein  28.62 
 
 		 607 aa  99  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.53 
 
 		 803 aa  97.8  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.92017 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5041  hypothetical protein  28.72 
 
 		 632 aa  96.3  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0110707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6782  hypothetical protein  28.85 
 
 		 600 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0703339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5337  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.08 
 
 		 608 aa  90.5  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0127085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4327  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.52 
 
 		 612 aa  85.1  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1110  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.62 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00714375  hitchhiker  0.00000984633 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4334  hypothetical protein  29.04 
 
 		 598 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6014  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase  26.98 
 
 		 597 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.605416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6191  hypothetical protein  25.46 
 
 		 597 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.09 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5743  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.14 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.613269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0022  hypothetical protein  21.56 
 
 		 388 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0523508  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  26.04 
 
 		 469 aa  65.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  26.49 
 
 		 667 aa  63.9  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  26.39 
 
 		 594 aa  62  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6216  hypothetical protein  27.8 
 
 		 496 aa  57  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4362  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.38 
 
 		 531 aa  57  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  25.34 
 
 		 588 aa  57  0.0000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  25.12 
 
 		 592 aa  57  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2060  hypothetical protein  27.14 
 
 		 594 aa  56.2  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.124935 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.1 
 
 		 580 aa  55.8  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  25.1 
 
 		 464 aa  55.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  27.66 
 
 		 469 aa  53.9  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  29.1 
 
 		 472 aa  53.5  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  23.85 
 
 		 466 aa  53.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  28.04 
 
 		 634 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1177  hypothetical protein  25.2 
 
 		 509 aa  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112818  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1714  hypothetical protein  23.92 
 
 		 512 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414906  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1725  hypothetical protein  27.08 
 
 		 491 aa  50.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.830403  normal  0.95658 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0188  hypothetical protein  27.14 
 
 		 502 aa  50.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.882321 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0748  hypothetical protein  25.84 
 
 		 503 aa  50.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0336  hypothetical protein  25 
 
 		 341 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0248  hypothetical protein  24.12 
 
 		 491 aa  48.5  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  24.12 
 
 		 633 aa  47.8  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  24.35 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  24.45 
 
 		 428 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2510  sulfate adenylyltransferase subunit 2  26.21 
 
 		 321 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>