62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0197 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0197  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.950311  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0149  hypothetical protein  92.66 
 
 
219 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50310  sugar nucleotidyltransferase  44.34 
 
 
220 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000057924  hitchhiker  0.000309665 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2837  nucleotidyl transferase  39.91 
 
 
220 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0282356  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1018  hypothetical protein  34.29 
 
 
212 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2615  putative sugar nucleotidyltransferase  31.37 
 
 
208 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  40.28 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  37.14 
 
 
223 aa  68.2  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1841  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  33.1 
 
 
225 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  34.26 
 
 
411 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  33.02 
 
 
411 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  35.19 
 
 
411 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  28.93 
 
 
270 aa  60.1  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1279  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  35.48 
 
 
266 aa  59.3  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  28.03 
 
 
250 aa  58.5  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
411 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  36.11 
 
 
414 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3985  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  41.44 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.755294 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0891  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  35.42 
 
 
230 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1575  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  41.82 
 
 
247 aa  55.5  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00205775  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  31.4 
 
 
241 aa  55.5  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  35.25 
 
 
254 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1415  nucleotidyl transferase/aminotransferase, class V  24.35 
 
 
616 aa  53.1  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  30.08 
 
 
249 aa  50.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  31.17 
 
 
251 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  32.3 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  30.08 
 
 
254 aa  49.7  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.01 
 
 
428 aa  49.7  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  29.75 
 
 
630 aa  48.9  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0093  sugar nucleotidyltransferase-like protein  33.61 
 
 
226 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  30.58 
 
 
384 aa  47.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  33.87 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2448  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  31.3 
 
 
453 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.420996  hitchhiker  0.000000146766 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  30.77 
 
 
254 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1173  hypothetical protein  26.03 
 
 
237 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0210885  normal  0.86006 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.81 
 
 
232 aa  45.8  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  27.87 
 
 
243 aa  45.4  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
622 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  30.66 
 
 
256 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  28.57 
 
 
622 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  28.8 
 
 
393 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  28.9 
 
 
243 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1570  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  43.48 
 
 
237 aa  43.5  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.467581  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  26.61 
 
 
262 aa  42.4  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0911  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  27.05 
 
 
249 aa  42.4  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1662  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  41.82 
 
 
253 aa  42.4  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000437878  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4487  nucleotidyl transferase  31.54 
 
 
243 aa  42.4  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0231829 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0611  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  27.43 
 
 
449 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.255649  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3368  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  40.98 
 
 
460 aa  42.4  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0770  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  30.83 
 
 
507 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.100351 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  27.2 
 
 
393 aa  42  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1802  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  25.63 
 
 
452 aa  42  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1770  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  29.01 
 
 
454 aa  42  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  28.29 
 
 
261 aa  42  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  31.4 
 
 
383 aa  42  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1599  Nucleotidyl transferase  31.46 
 
 
364 aa  41.6  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1335  histidinol-phosphate phosphatase  29.09 
 
 
417 aa  42  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0371324  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  29.36 
 
 
325 aa  42  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1784  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  33.98 
 
 
452 aa  42  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.907512  normal  0.0309291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5668  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  38.33 
 
 
239 aa  41.6  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0673101 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  30.16 
 
 
249 aa  41.6  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.44 
 
 
325 aa  41.6  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>