56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3683 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3683  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  368  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1696  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.67 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000839516 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2311  YeeE/YedE family protein  38.32 
 
 		 185 aa  104  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.248702  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1169  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.67 
 
 		 197 aa  104  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1977  hypothetical protein  37.95 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.52467  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1867  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.75 
 
 		 176 aa  99  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.340851  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3014  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.71 
 
 		 175 aa  98.2  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2857  hypothetical protein  39.16 
 
 		 175 aa  97.1  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.05 
 
 		 174 aa  94.4  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820343 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2970  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.48 
 
 		 175 aa  94.4  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1628  YeeE/YedE family protein  35.8 
 
 		 185 aa  90.9  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0625  YeeE/YedE family protein  41.94 
 
 		 186 aa  85.1  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0557  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.72 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000311209  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1462  rhodanese domain-containing protein  30.81 
 
 		 419 aa  77.8  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3345  hypothetical protein  36.73 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0348  hypothetical protein  40.68 
 
 		 189 aa  72  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.176837  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4309  hypothetical protein  32.41 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4107  hypothetical protein  33.13 
 
 		 399 aa  68.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159801  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2629  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  67.8  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2810  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.33 
 
 		 218 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151764  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0789  rhodanese domain-containing protein  37.82 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.259144  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2715  hypothetical protein  34.36 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2595  hypothetical protein  35 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  30.34 
 
 		 647 aa  64.3  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0802  YeeE/YedE family protein  33.33 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1596  hypothetical protein  39.16 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0170  hypothetical protein  30 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3330  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.23 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  hitchhiker  0.00106524 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1172  hypothetical protein  25.3 
 
 		 373 aa  52  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.67 
 
 		 352 aa  50.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2996  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.33 
 
 		 138 aa  50.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.01 
 
 		 354 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  36.44 
 
 		 344 aa  49.7  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3115  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.91 
 
 		 152 aa  48.5  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6935  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.58 
 
 		 167 aa  47.8  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0103  hypothetical protein  27.27 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.296807 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.9 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4379  hypothetical protein  29.21 
 
 		 400 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.204255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3704  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.19 
 
 		 153 aa  44.7  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546913  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1367  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.23 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1834  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.73 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11773  hypothetical protein  25.81 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4968  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.53 
 
 		 400 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0259  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.03 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  28.24 
 
 		 343 aa  43.5  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1029  transporter component  24.6 
 
 		 136 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.489636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.71 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0743  hypothetical protein  26.62 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2607  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0973484 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4883  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.56 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0848134  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0445  putative inner membrane protein  26.58 
 
 		 423 aa  42  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  44.83 
 
 		 141 aa  42  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.68 
 
 		 140 aa  41.6  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0517637  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1744  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.53 
 
 		 137 aa  41.2  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1336  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.63 
 
 		 152 aa  41.2  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377918 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.58 
 
 		 332 aa  41.2  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>