98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_17480 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  517  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  61.82 
 
 
254 aa  244  8e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  35.8 
 
 
274 aa  158  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  35.02 
 
 
277 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  35.32 
 
 
265 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  34.63 
 
 
277 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  34.63 
 
 
277 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  35.37 
 
 
277 aa  146  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  40.66 
 
 
665 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  40.66 
 
 
665 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  40.66 
 
 
665 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  43.28 
 
 
664 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1098  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  43.69 
 
 
246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  32.33 
 
 
686 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  34.02 
 
 
711 aa  112  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  37.3 
 
 
692 aa  109  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  37.63 
 
 
739 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  34.2 
 
 
651 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  37.88 
 
 
678 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  36.23 
 
 
661 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21060  predicted membrane protein  46.67 
 
 
277 aa  107  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  33.47 
 
 
675 aa  106  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3552  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  45 
 
 
291 aa  105  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223965  normal  0.817267 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  40.33 
 
 
328 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  33.46 
 
 
319 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  31.76 
 
 
310 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  34.5 
 
 
722 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  31.34 
 
 
681 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  36.14 
 
 
676 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  40.96 
 
 
731 aa  99  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  31.5 
 
 
718 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  35.04 
 
 
672 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  37.18 
 
 
671 aa  97.1  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  30.17 
 
 
718 aa  95.5  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  36.79 
 
 
654 aa  95.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3086  hypothetical protein  42.08 
 
 
235 aa  94.7  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0589331  hitchhiker  0.00886483 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  31.2 
 
 
752 aa  94.4  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  33.6 
 
 
651 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  33.71 
 
 
322 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  34.17 
 
 
683 aa  92.4  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  33.94 
 
 
632 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  36.42 
 
 
708 aa  90.5  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  36.7 
 
 
679 aa  90.1  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  37.7 
 
 
719 aa  89.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  33.08 
 
 
322 aa  89.4  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  34.92 
 
 
691 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  30 
 
 
687 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  34.36 
 
 
671 aa  87.8  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  32.17 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  34.9 
 
 
631 aa  83.2  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  31.97 
 
 
646 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  32.81 
 
 
687 aa  77.4  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  30.6 
 
 
697 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  37.37 
 
 
708 aa  76.6  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  30.27 
 
 
331 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  30.92 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  34.52 
 
 
641 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  32.5 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  29.89 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  36.36 
 
 
642 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  29.89 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  34.52 
 
 
641 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  30.27 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  32.72 
 
 
613 aa  73.6  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  28.08 
 
 
637 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  33.57 
 
 
736 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  29.87 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.57 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  27.53 
 
 
394 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  32.89 
 
 
354 aa  63.9  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  32.86 
 
 
309 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.4 
 
 
326 aa  60.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  31.47 
 
 
322 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  34.13 
 
 
651 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  28.76 
 
 
300 aa  54.3  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  27.07 
 
 
315 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  29.58 
 
 
296 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  27.46 
 
 
294 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  25.88 
 
 
289 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  26.95 
 
 
264 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0562  hypothetical protein  28.17 
 
 
266 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522678  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2447  hypothetical protein  28.17 
 
 
290 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2875  hypothetical protein  28.17 
 
 
290 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1749  hypothetical protein  28.17 
 
 
290 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2834  hypothetical protein  28.17 
 
 
290 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2760  hypothetical protein  28.17 
 
 
290 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2819  hypothetical protein  28.17 
 
 
290 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286067  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1770  hypothetical protein  28.17 
 
 
290 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2151  membrane protein  27.59 
 
 
289 aa  45.8  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240263  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  25.2 
 
 
265 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4266  membrane protein  26.01 
 
 
289 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1036  membrane protein  26.01 
 
 
290 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  0.424179 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2269  membrane protein-like protein  27.17 
 
 
271 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761855  hitchhiker  0.00192882 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0675  membrane protein  28.32 
 
 
289 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1154  membrane protein  28.32 
 
 
289 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1130  membrane protein  28.32 
 
 
289 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1032  membrane protein  26.01 
 
 
290 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1898  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  29.86 
 
 
290 aa  42.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.903451  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>